Protein–RNA interactions for Protein: B1AWZ3

Nipsnap3a, Nipsnap homolog 3A, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap3aB1AWZ3 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nipsnap3aB1AWZ3 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nipsnap3aB1AWZ3 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nipsnap3aB1AWZ3 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nipsnap3aB1AWZ3 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nipsnap3aB1AWZ3 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nipsnap3aB1AWZ3 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nipsnap3aB1AWZ3 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nipsnap3aB1AWZ3 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nipsnap3aB1AWZ3 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nipsnap3aB1AWZ3 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nipsnap3aB1AWZ3 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nipsnap3aB1AWZ3 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nipsnap3aB1AWZ3 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nipsnap3aB1AWZ3 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nipsnap3aB1AWZ3 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nipsnap3aB1AWZ3 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nipsnap3aB1AWZ3 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nipsnap3aB1AWZ3 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nipsnap3aB1AWZ3 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nipsnap3aB1AWZ3 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nipsnap3aB1AWZ3 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Nipsnap3aB1AWZ3 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nipsnap3aB1AWZ3 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nipsnap3aB1AWZ3 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nipsnap3aB1AWZ3 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nipsnap3aB1AWZ3 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nipsnap3aB1AWZ3 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nipsnap3aB1AWZ3 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nipsnap3aB1AWZ3 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Nipsnap3aB1AWZ3 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nipsnap3aB1AWZ3 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nipsnap3aB1AWZ3 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nipsnap3aB1AWZ3 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nipsnap3aB1AWZ3 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nipsnap3aB1AWZ3 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nipsnap3aB1AWZ3 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nipsnap3aB1AWZ3 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nipsnap3aB1AWZ3 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nipsnap3aB1AWZ3 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nipsnap3aB1AWZ3 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nipsnap3aB1AWZ3 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Nipsnap3aB1AWZ3 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nipsnap3aB1AWZ3 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nipsnap3aB1AWZ3 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nipsnap3aB1AWZ3 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Nipsnap3aB1AWZ3 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Nipsnap3aB1AWZ3 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Nipsnap3aB1AWZ3 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Nipsnap3aB1AWZ3 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nipsnap3aB1AWZ3 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nipsnap3aB1AWZ3 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nipsnap3aB1AWZ3 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nipsnap3aB1AWZ3 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nipsnap3aB1AWZ3 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nipsnap3aB1AWZ3 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Nipsnap3aB1AWZ3 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nipsnap3aB1AWZ3 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nipsnap3aB1AWZ3 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nipsnap3aB1AWZ3 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nipsnap3aB1AWZ3 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nipsnap3aB1AWZ3 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nipsnap3aB1AWZ3 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nipsnap3aB1AWZ3 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nipsnap3aB1AWZ3 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nipsnap3aB1AWZ3 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nipsnap3aB1AWZ3 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nipsnap3aB1AWZ3 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nipsnap3aB1AWZ3 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nipsnap3aB1AWZ3 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nipsnap3aB1AWZ3 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nipsnap3aB1AWZ3 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nipsnap3aB1AWZ3 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nipsnap3aB1AWZ3 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nipsnap3aB1AWZ3 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nipsnap3aB1AWZ3 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nipsnap3aB1AWZ3 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nipsnap3aB1AWZ3 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nipsnap3aB1AWZ3 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nipsnap3aB1AWZ3 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nipsnap3aB1AWZ3 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nipsnap3aB1AWZ3 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nipsnap3aB1AWZ3 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nipsnap3aB1AWZ3 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nipsnap3aB1AWZ3 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Nipsnap3aB1AWZ3 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nipsnap3aB1AWZ3 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nipsnap3aB1AWZ3 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nipsnap3aB1AWZ3 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nipsnap3aB1AWZ3 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nipsnap3aB1AWZ3 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nipsnap3aB1AWZ3 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nipsnap3aB1AWZ3 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms