Protein–RNA interactions for Protein: B1ATG9

Trabd2b, Metalloprotease TIKI2, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trabd2bB1ATG9 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trabd2bB1ATG9 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trabd2bB1ATG9 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trabd2bB1ATG9 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trabd2bB1ATG9 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trabd2bB1ATG9 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trabd2bB1ATG9 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trabd2bB1ATG9 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trabd2bB1ATG9 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trabd2bB1ATG9 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trabd2bB1ATG9 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trabd2bB1ATG9 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trabd2bB1ATG9 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trabd2bB1ATG9 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trabd2bB1ATG9 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Trabd2bB1ATG9 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Trabd2bB1ATG9 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trabd2bB1ATG9 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trabd2bB1ATG9 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trabd2bB1ATG9 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trabd2bB1ATG9 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trabd2bB1ATG9 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trabd2bB1ATG9 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trabd2bB1ATG9 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trabd2bB1ATG9 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Trabd2bB1ATG9 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trabd2bB1ATG9 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Trabd2bB1ATG9 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
Trabd2bB1ATG9 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trabd2bB1ATG9 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trabd2bB1ATG9 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trabd2bB1ATG9 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trabd2bB1ATG9 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trabd2bB1ATG9 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trabd2bB1ATG9 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trabd2bB1ATG9 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trabd2bB1ATG9 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trabd2bB1ATG9 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Trabd2bB1ATG9 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trabd2bB1ATG9 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trabd2bB1ATG9 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trabd2bB1ATG9 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trabd2bB1ATG9 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trabd2bB1ATG9 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Trabd2bB1ATG9 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trabd2bB1ATG9 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trabd2bB1ATG9 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trabd2bB1ATG9 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trabd2bB1ATG9 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trabd2bB1ATG9 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trabd2bB1ATG9 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trabd2bB1ATG9 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trabd2bB1ATG9 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trabd2bB1ATG9 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trabd2bB1ATG9 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trabd2bB1ATG9 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
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Trabd2bB1ATG9 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trabd2bB1ATG9 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trabd2bB1ATG9 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trabd2bB1ATG9 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trabd2bB1ATG9 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trabd2bB1ATG9 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trabd2bB1ATG9 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trabd2bB1ATG9 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trabd2bB1ATG9 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trabd2bB1ATG9 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trabd2bB1ATG9 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trabd2bB1ATG9 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trabd2bB1ATG9 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trabd2bB1ATG9 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trabd2bB1ATG9 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trabd2bB1ATG9 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trabd2bB1ATG9 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trabd2bB1ATG9 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trabd2bB1ATG9 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trabd2bB1ATG9 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trabd2bB1ATG9 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trabd2bB1ATG9 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Trabd2bB1ATG9 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trabd2bB1ATG9 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Trabd2bB1ATG9 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trabd2bB1ATG9 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trabd2bB1ATG9 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Trabd2bB1ATG9 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trabd2bB1ATG9 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trabd2bB1ATG9 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trabd2bB1ATG9 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trabd2bB1ATG9 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trabd2bB1ATG9 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trabd2bB1ATG9 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trabd2bB1ATG9 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trabd2bB1ATG9 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trabd2bB1ATG9 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Trabd2bB1ATG9 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Trabd2bB1ATG9 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Trabd2bB1ATG9 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trabd2bB1ATG9 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trabd2bB1ATG9 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trabd2bB1ATG9 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
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