Protein–RNA interactions for Protein: B1ARI9

Prr29, Proline-rich protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr29B1ARI9 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Prr29B1ARI9 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Prr29B1ARI9 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Prr29B1ARI9 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Prr29B1ARI9 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Prr29B1ARI9 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Prr29B1ARI9 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Prr29B1ARI9 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Prr29B1ARI9 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Prr29B1ARI9 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Prr29B1ARI9 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Prr29B1ARI9 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Prr29B1ARI9 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Prr29B1ARI9 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Prr29B1ARI9 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Prr29B1ARI9 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Prr29B1ARI9 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Prr29B1ARI9 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Prr29B1ARI9 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Prr29B1ARI9 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Prr29B1ARI9 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Prr29B1ARI9 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Prr29B1ARI9 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Prr29B1ARI9 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Prr29B1ARI9 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Prr29B1ARI9 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Prr29B1ARI9 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Prr29B1ARI9 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Prr29B1ARI9 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Prr29B1ARI9 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Prr29B1ARI9 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Prr29B1ARI9 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Prr29B1ARI9 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Prr29B1ARI9 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Prr29B1ARI9 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Prr29B1ARI9 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Prr29B1ARI9 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Prr29B1ARI9 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Prr29B1ARI9 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Prr29B1ARI9 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Prr29B1ARI9 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Prr29B1ARI9 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Prr29B1ARI9 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Prr29B1ARI9 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Prr29B1ARI9 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Prr29B1ARI9 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Prr29B1ARI9 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Prr29B1ARI9 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Prr29B1ARI9 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Prr29B1ARI9 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Prr29B1ARI9 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Prr29B1ARI9 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Prr29B1ARI9 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Prr29B1ARI9 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Prr29B1ARI9 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Prr29B1ARI9 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Prr29B1ARI9 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Prr29B1ARI9 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Prr29B1ARI9 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Prr29B1ARI9 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Prr29B1ARI9 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Prr29B1ARI9 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Prr29B1ARI9 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Prr29B1ARI9 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Prr29B1ARI9 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Prr29B1ARI9 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Prr29B1ARI9 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Prr29B1ARI9 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Prr29B1ARI9 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Prr29B1ARI9 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Prr29B1ARI9 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Prr29B1ARI9 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Prr29B1ARI9 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Prr29B1ARI9 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Prr29B1ARI9 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Prr29B1ARI9 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Prr29B1ARI9 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Prr29B1ARI9 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Prr29B1ARI9 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Prr29B1ARI9 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Prr29B1ARI9 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Prr29B1ARI9 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Prr29B1ARI9 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Prr29B1ARI9 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Prr29B1ARI9 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Prr29B1ARI9 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Prr29B1ARI9 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Prr29B1ARI9 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Prr29B1ARI9 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Prr29B1ARI9 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Prr29B1ARI9 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Prr29B1ARI9 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Prr29B1ARI9 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Prr29B1ARI9 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Prr29B1ARI9 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Prr29B1ARI9 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Prr29B1ARI9 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Prr29B1ARI9 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Prr29B1ARI9 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Prr29B1ARI9 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms