Protein–RNA interactions for Protein: A9JSM3

Tmem238, Transmembrane protein 238, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem238A9JSM3 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tmem238A9JSM3 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tmem238A9JSM3 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tmem238A9JSM3 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tmem238A9JSM3 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tmem238A9JSM3 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tmem238A9JSM3 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tmem238A9JSM3 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tmem238A9JSM3 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tmem238A9JSM3 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tmem238A9JSM3 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tmem238A9JSM3 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tmem238A9JSM3 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tmem238A9JSM3 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Tmem238A9JSM3 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Tmem238A9JSM3 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Tmem238A9JSM3 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Tmem238A9JSM3 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Tmem238A9JSM3 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Tmem238A9JSM3 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Tmem238A9JSM3 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Tmem238A9JSM3 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Tmem238A9JSM3 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Tmem238A9JSM3 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Tmem238A9JSM3 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tmem238A9JSM3 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tmem238A9JSM3 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tmem238A9JSM3 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tmem238A9JSM3 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tmem238A9JSM3 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tmem238A9JSM3 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tmem238A9JSM3 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tmem238A9JSM3 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tmem238A9JSM3 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tmem238A9JSM3 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tmem238A9JSM3 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tmem238A9JSM3 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tmem238A9JSM3 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tmem238A9JSM3 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tmem238A9JSM3 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tmem238A9JSM3 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tmem238A9JSM3 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tmem238A9JSM3 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tmem238A9JSM3 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tmem238A9JSM3 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tmem238A9JSM3 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tmem238A9JSM3 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Tmem238A9JSM3 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tmem238A9JSM3 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tmem238A9JSM3 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tmem238A9JSM3 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tmem238A9JSM3 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tmem238A9JSM3 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tmem238A9JSM3 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tmem238A9JSM3 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tmem238A9JSM3 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tmem238A9JSM3 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tmem238A9JSM3 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tmem238A9JSM3 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tmem238A9JSM3 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tmem238A9JSM3 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tmem238A9JSM3 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tmem238A9JSM3 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tmem238A9JSM3 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tmem238A9JSM3 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tmem238A9JSM3 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tmem238A9JSM3 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Tmem238A9JSM3 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Tmem238A9JSM3 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Tmem238A9JSM3 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Tmem238A9JSM3 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Tmem238A9JSM3 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Tmem238A9JSM3 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Tmem238A9JSM3 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Tmem238A9JSM3 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Tmem238A9JSM3 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Tmem238A9JSM3 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Tmem238A9JSM3 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Tmem238A9JSM3 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Tmem238A9JSM3 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Tmem238A9JSM3 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Tmem238A9JSM3 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Tmem238A9JSM3 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Tmem238A9JSM3 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Tmem238A9JSM3 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Tmem238A9JSM3 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Tmem238A9JSM3 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Tmem238A9JSM3 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Tmem238A9JSM3 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Tmem238A9JSM3 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Tmem238A9JSM3 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Tmem238A9JSM3 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Tmem238A9JSM3 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Tmem238A9JSM3 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Tmem238A9JSM3 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Tmem238A9JSM3 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Tmem238A9JSM3 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Tmem238A9JSM3 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Tmem238A9JSM3 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Tmem238A9JSM3 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms