Protein–RNA interactions for Protein: A4Q9E8

Ttll6, Tubulin polyglutamylase TTLL6, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll6A4Q9E8 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ttll6A4Q9E8 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ttll6A4Q9E8 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ttll6A4Q9E8 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ttll6A4Q9E8 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ttll6A4Q9E8 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ttll6A4Q9E8 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ttll6A4Q9E8 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ttll6A4Q9E8 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ttll6A4Q9E8 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ttll6A4Q9E8 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ttll6A4Q9E8 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ttll6A4Q9E8 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ttll6A4Q9E8 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ttll6A4Q9E8 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Ttll6A4Q9E8 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ttll6A4Q9E8 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ttll6A4Q9E8 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ttll6A4Q9E8 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ttll6A4Q9E8 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ttll6A4Q9E8 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ttll6A4Q9E8 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ttll6A4Q9E8 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ttll6A4Q9E8 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ttll6A4Q9E8 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ttll6A4Q9E8 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ttll6A4Q9E8 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ttll6A4Q9E8 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ttll6A4Q9E8 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ttll6A4Q9E8 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ttll6A4Q9E8 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ttll6A4Q9E8 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ttll6A4Q9E8 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ttll6A4Q9E8 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ttll6A4Q9E8 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ttll6A4Q9E8 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ttll6A4Q9E8 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ttll6A4Q9E8 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ttll6A4Q9E8 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ttll6A4Q9E8 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Ttll6A4Q9E8 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ttll6A4Q9E8 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ttll6A4Q9E8 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ttll6A4Q9E8 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ttll6A4Q9E8 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ttll6A4Q9E8 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ttll6A4Q9E8 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ttll6A4Q9E8 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ttll6A4Q9E8 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ttll6A4Q9E8 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Ttll6A4Q9E8 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ttll6A4Q9E8 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ttll6A4Q9E8 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ttll6A4Q9E8 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ttll6A4Q9E8 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ttll6A4Q9E8 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ttll6A4Q9E8 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ttll6A4Q9E8 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ttll6A4Q9E8 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ttll6A4Q9E8 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ttll6A4Q9E8 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ttll6A4Q9E8 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ttll6A4Q9E8 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ttll6A4Q9E8 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ttll6A4Q9E8 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ttll6A4Q9E8 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ttll6A4Q9E8 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ttll6A4Q9E8 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ttll6A4Q9E8 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ttll6A4Q9E8 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ttll6A4Q9E8 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ttll6A4Q9E8 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ttll6A4Q9E8 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Ttll6A4Q9E8 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ttll6A4Q9E8 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ttll6A4Q9E8 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ttll6A4Q9E8 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ttll6A4Q9E8 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ttll6A4Q9E8 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ttll6A4Q9E8 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ttll6A4Q9E8 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ttll6A4Q9E8 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ttll6A4Q9E8 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ttll6A4Q9E8 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ttll6A4Q9E8 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ttll6A4Q9E8 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ttll6A4Q9E8 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ttll6A4Q9E8 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ttll6A4Q9E8 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ttll6A4Q9E8 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ttll6A4Q9E8 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ttll6A4Q9E8 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ttll6A4Q9E8 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ttll6A4Q9E8 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ttll6A4Q9E8 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ttll6A4Q9E8 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ttll6A4Q9E8 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ttll6A4Q9E8 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ttll6A4Q9E8 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ttll6A4Q9E8 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms