Protein–RNA interactions for Protein: A3KMP2

Ttc38, Tetratricopeptide repeat protein 38, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc38A3KMP2 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ttc38A3KMP2 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ttc38A3KMP2 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ttc38A3KMP2 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ttc38A3KMP2 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ttc38A3KMP2 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ttc38A3KMP2 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ttc38A3KMP2 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ttc38A3KMP2 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ttc38A3KMP2 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ttc38A3KMP2 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ttc38A3KMP2 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ttc38A3KMP2 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ttc38A3KMP2 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ttc38A3KMP2 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ttc38A3KMP2 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ttc38A3KMP2 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ttc38A3KMP2 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ttc38A3KMP2 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ttc38A3KMP2 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ttc38A3KMP2 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ttc38A3KMP2 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ttc38A3KMP2 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ttc38A3KMP2 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ttc38A3KMP2 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ttc38A3KMP2 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ttc38A3KMP2 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ttc38A3KMP2 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ttc38A3KMP2 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ttc38A3KMP2 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ttc38A3KMP2 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ttc38A3KMP2 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ttc38A3KMP2 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ttc38A3KMP2 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ttc38A3KMP2 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ttc38A3KMP2 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ttc38A3KMP2 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ttc38A3KMP2 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ttc38A3KMP2 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Ttc38A3KMP2 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ttc38A3KMP2 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ttc38A3KMP2 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ttc38A3KMP2 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ttc38A3KMP2 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ttc38A3KMP2 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ttc38A3KMP2 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ttc38A3KMP2 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Ttc38A3KMP2 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ttc38A3KMP2 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ttc38A3KMP2 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ttc38A3KMP2 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ttc38A3KMP2 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ttc38A3KMP2 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ttc38A3KMP2 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ttc38A3KMP2 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ttc38A3KMP2 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ttc38A3KMP2 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ttc38A3KMP2 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ttc38A3KMP2 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ttc38A3KMP2 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ttc38A3KMP2 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ttc38A3KMP2 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ttc38A3KMP2 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ttc38A3KMP2 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ttc38A3KMP2 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ttc38A3KMP2 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ttc38A3KMP2 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Ttc38A3KMP2 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Ttc38A3KMP2 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ttc38A3KMP2 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Ttc38A3KMP2 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ttc38A3KMP2 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ttc38A3KMP2 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ttc38A3KMP2 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ttc38A3KMP2 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ttc38A3KMP2 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ttc38A3KMP2 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ttc38A3KMP2 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ttc38A3KMP2 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ttc38A3KMP2 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ttc38A3KMP2 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ttc38A3KMP2 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ttc38A3KMP2 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ttc38A3KMP2 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ttc38A3KMP2 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ttc38A3KMP2 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ttc38A3KMP2 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ttc38A3KMP2 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ttc38A3KMP2 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ttc38A3KMP2 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ttc38A3KMP2 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ttc38A3KMP2 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ttc38A3KMP2 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ttc38A3KMP2 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ttc38A3KMP2 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ttc38A3KMP2 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ttc38A3KMP2 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ttc38A3KMP2 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ttc38A3KMP2 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ttc38A3KMP2 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
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