Protein–RNA interactions for Protein: A2RT81

Rnf39, MCG22610, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf39A2RT81 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rnf39A2RT81 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Rnf39A2RT81 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rnf39A2RT81 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rnf39A2RT81 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rnf39A2RT81 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rnf39A2RT81 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rnf39A2RT81 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Rnf39A2RT81 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rnf39A2RT81 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rnf39A2RT81 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rnf39A2RT81 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rnf39A2RT81 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rnf39A2RT81 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rnf39A2RT81 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rnf39A2RT81 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rnf39A2RT81 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rnf39A2RT81 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rnf39A2RT81 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rnf39A2RT81 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rnf39A2RT81 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rnf39A2RT81 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rnf39A2RT81 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rnf39A2RT81 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rnf39A2RT81 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rnf39A2RT81 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rnf39A2RT81 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rnf39A2RT81 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rnf39A2RT81 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rnf39A2RT81 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rnf39A2RT81 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rnf39A2RT81 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rnf39A2RT81 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rnf39A2RT81 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rnf39A2RT81 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rnf39A2RT81 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rnf39A2RT81 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Rnf39A2RT81 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rnf39A2RT81 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rnf39A2RT81 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rnf39A2RT81 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rnf39A2RT81 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rnf39A2RT81 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rnf39A2RT81 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rnf39A2RT81 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rnf39A2RT81 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rnf39A2RT81 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Rnf39A2RT81 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Rnf39A2RT81 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rnf39A2RT81 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rnf39A2RT81 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rnf39A2RT81 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rnf39A2RT81 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rnf39A2RT81 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rnf39A2RT81 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rnf39A2RT81 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rnf39A2RT81 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rnf39A2RT81 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rnf39A2RT81 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rnf39A2RT81 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rnf39A2RT81 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rnf39A2RT81 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rnf39A2RT81 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rnf39A2RT81 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rnf39A2RT81 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Rnf39A2RT81 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rnf39A2RT81 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rnf39A2RT81 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rnf39A2RT81 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rnf39A2RT81 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rnf39A2RT81 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rnf39A2RT81 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rnf39A2RT81 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rnf39A2RT81 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Rnf39A2RT81 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rnf39A2RT81 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rnf39A2RT81 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Rnf39A2RT81 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rnf39A2RT81 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rnf39A2RT81 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rnf39A2RT81 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rnf39A2RT81 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rnf39A2RT81 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rnf39A2RT81 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rnf39A2RT81 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rnf39A2RT81 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rnf39A2RT81 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rnf39A2RT81 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rnf39A2RT81 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rnf39A2RT81 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rnf39A2RT81 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rnf39A2RT81 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rnf39A2RT81 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Rnf39A2RT81 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rnf39A2RT81 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rnf39A2RT81 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rnf39A2RT81 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rnf39A2RT81 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Rnf39A2RT81 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Rnf39A2RT81 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms