Protein–RNA interactions for Protein: A2BED8

Samt1, Predicted gene 10057, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samt1A2BED8 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Samt1A2BED8 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Samt1A2BED8 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Samt1A2BED8 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Samt1A2BED8 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Samt1A2BED8 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Samt1A2BED8 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Samt1A2BED8 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Samt1A2BED8 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Samt1A2BED8 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Samt1A2BED8 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Samt1A2BED8 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Samt1A2BED8 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Samt1A2BED8 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Samt1A2BED8 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Samt1A2BED8 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Samt1A2BED8 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Samt1A2BED8 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Samt1A2BED8 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Samt1A2BED8 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Samt1A2BED8 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Samt1A2BED8 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Samt1A2BED8 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Samt1A2BED8 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Samt1A2BED8 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Samt1A2BED8 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Samt1A2BED8 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Samt1A2BED8 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Samt1A2BED8 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Samt1A2BED8 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Samt1A2BED8 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Samt1A2BED8 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Samt1A2BED8 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Samt1A2BED8 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Samt1A2BED8 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Samt1A2BED8 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Samt1A2BED8 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Samt1A2BED8 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Samt1A2BED8 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Samt1A2BED8 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Samt1A2BED8 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Samt1A2BED8 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Samt1A2BED8 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Samt1A2BED8 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Samt1A2BED8 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Samt1A2BED8 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Samt1A2BED8 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Samt1A2BED8 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Samt1A2BED8 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Samt1A2BED8 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Samt1A2BED8 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Samt1A2BED8 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Samt1A2BED8 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Samt1A2BED8 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Samt1A2BED8 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Samt1A2BED8 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Samt1A2BED8 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Samt1A2BED8 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Samt1A2BED8 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Samt1A2BED8 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Samt1A2BED8 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Samt1A2BED8 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Samt1A2BED8 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Samt1A2BED8 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Samt1A2BED8 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Samt1A2BED8 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Samt1A2BED8 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Samt1A2BED8 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Samt1A2BED8 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Samt1A2BED8 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Samt1A2BED8 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Samt1A2BED8 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Samt1A2BED8 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Samt1A2BED8 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Samt1A2BED8 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Samt1A2BED8 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Samt1A2BED8 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Samt1A2BED8 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Samt1A2BED8 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Samt1A2BED8 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Samt1A2BED8 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Samt1A2BED8 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Samt1A2BED8 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Samt1A2BED8 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Samt1A2BED8 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Samt1A2BED8 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Samt1A2BED8 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Samt1A2BED8 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Samt1A2BED8 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Samt1A2BED8 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Samt1A2BED8 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Samt1A2BED8 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Samt1A2BED8 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Samt1A2BED8 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Samt1A2BED8 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Samt1A2BED8 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Samt1A2BED8 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Samt1A2BED8 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Samt1A2BED8 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Samt1A2BED8 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms