Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtf1A2AQ19 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rtf1A2AQ19 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rtf1A2AQ19 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rtf1A2AQ19 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rtf1A2AQ19 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rtf1A2AQ19 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rtf1A2AQ19 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Rtf1A2AQ19 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Rtf1A2AQ19 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Rtf1A2AQ19 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Rtf1A2AQ19 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Rtf1A2AQ19 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rtf1A2AQ19 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rtf1A2AQ19 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rtf1A2AQ19 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rtf1A2AQ19 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rtf1A2AQ19 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rtf1A2AQ19 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rtf1A2AQ19 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rtf1A2AQ19 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rtf1A2AQ19 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Rtf1A2AQ19 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Rtf1A2AQ19 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rtf1A2AQ19 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rtf1A2AQ19 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rtf1A2AQ19 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rtf1A2AQ19 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rtf1A2AQ19 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rtf1A2AQ19 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rtf1A2AQ19 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rtf1A2AQ19 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Rtf1A2AQ19 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rtf1A2AQ19 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rtf1A2AQ19 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rtf1A2AQ19 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rtf1A2AQ19 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Rtf1A2AQ19 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rtf1A2AQ19 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rtf1A2AQ19 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rtf1A2AQ19 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rtf1A2AQ19 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rtf1A2AQ19 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Rtf1A2AQ19 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rtf1A2AQ19 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rtf1A2AQ19 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rtf1A2AQ19 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rtf1A2AQ19 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rtf1A2AQ19 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rtf1A2AQ19 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rtf1A2AQ19 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rtf1A2AQ19 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rtf1A2AQ19 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rtf1A2AQ19 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rtf1A2AQ19 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rtf1A2AQ19 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.68
Rtf1A2AQ19 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Rtf1A2AQ19 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rtf1A2AQ19 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rtf1A2AQ19 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rtf1A2AQ19 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rtf1A2AQ19 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rtf1A2AQ19 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rtf1A2AQ19 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rtf1A2AQ19 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rtf1A2AQ19 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rtf1A2AQ19 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rtf1A2AQ19 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rtf1A2AQ19 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rtf1A2AQ19 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rtf1A2AQ19 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rtf1A2AQ19 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rtf1A2AQ19 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rtf1A2AQ19 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rtf1A2AQ19 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rtf1A2AQ19 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rtf1A2AQ19 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rtf1A2AQ19 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rtf1A2AQ19 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rtf1A2AQ19 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Rtf1A2AQ19 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rtf1A2AQ19 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rtf1A2AQ19 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rtf1A2AQ19 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rtf1A2AQ19 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rtf1A2AQ19 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rtf1A2AQ19 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Rtf1A2AQ19 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rtf1A2AQ19 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rtf1A2AQ19 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rtf1A2AQ19 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rtf1A2AQ19 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rtf1A2AQ19 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rtf1A2AQ19 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rtf1A2AQ19 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rtf1A2AQ19 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Rtf1A2AQ19 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rtf1A2AQ19 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rtf1A2AQ19 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rtf1A2AQ19 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rtf1A2AQ19 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms