Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ07

Tubb1, Tubulin beta-1 chain, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb1A2AQ07 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tubb1A2AQ07 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tubb1A2AQ07 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tubb1A2AQ07 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tubb1A2AQ07 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tubb1A2AQ07 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tubb1A2AQ07 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tubb1A2AQ07 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tubb1A2AQ07 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Tubb1A2AQ07 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tubb1A2AQ07 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tubb1A2AQ07 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tubb1A2AQ07 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tubb1A2AQ07 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Tubb1A2AQ07 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Tubb1A2AQ07 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tubb1A2AQ07 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Tubb1A2AQ07 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tubb1A2AQ07 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tubb1A2AQ07 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tubb1A2AQ07 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tubb1A2AQ07 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tubb1A2AQ07 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tubb1A2AQ07 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tubb1A2AQ07 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tubb1A2AQ07 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tubb1A2AQ07 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tubb1A2AQ07 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tubb1A2AQ07 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tubb1A2AQ07 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tubb1A2AQ07 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tubb1A2AQ07 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tubb1A2AQ07 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Tubb1A2AQ07 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tubb1A2AQ07 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tubb1A2AQ07 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tubb1A2AQ07 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tubb1A2AQ07 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tubb1A2AQ07 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tubb1A2AQ07 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tubb1A2AQ07 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tubb1A2AQ07 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tubb1A2AQ07 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tubb1A2AQ07 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tubb1A2AQ07 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tubb1A2AQ07 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tubb1A2AQ07 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tubb1A2AQ07 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tubb1A2AQ07 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tubb1A2AQ07 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tubb1A2AQ07 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tubb1A2AQ07 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tubb1A2AQ07 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tubb1A2AQ07 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tubb1A2AQ07 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tubb1A2AQ07 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tubb1A2AQ07 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tubb1A2AQ07 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tubb1A2AQ07 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tubb1A2AQ07 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tubb1A2AQ07 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tubb1A2AQ07 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tubb1A2AQ07 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tubb1A2AQ07 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tubb1A2AQ07 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tubb1A2AQ07 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tubb1A2AQ07 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tubb1A2AQ07 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tubb1A2AQ07 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Tubb1A2AQ07 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tubb1A2AQ07 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tubb1A2AQ07 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tubb1A2AQ07 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tubb1A2AQ07 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tubb1A2AQ07 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tubb1A2AQ07 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tubb1A2AQ07 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tubb1A2AQ07 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tubb1A2AQ07 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tubb1A2AQ07 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tubb1A2AQ07 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tubb1A2AQ07 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tubb1A2AQ07 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tubb1A2AQ07 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tubb1A2AQ07 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tubb1A2AQ07 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tubb1A2AQ07 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tubb1A2AQ07 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tubb1A2AQ07 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tubb1A2AQ07 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tubb1A2AQ07 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tubb1A2AQ07 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tubb1A2AQ07 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tubb1A2AQ07 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tubb1A2AQ07 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tubb1A2AQ07 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tubb1A2AQ07 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tubb1A2AQ07 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tubb1A2AQ07 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Tubb1A2AQ07 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms