Protein–RNA interactions for Protein: A2APF3

Ctcfl, Transcriptional repressor CTCFL, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtcflA2APF3 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CtcflA2APF3 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CtcflA2APF3 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CtcflA2APF3 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CtcflA2APF3 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CtcflA2APF3 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CtcflA2APF3 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CtcflA2APF3 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CtcflA2APF3 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CtcflA2APF3 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CtcflA2APF3 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
CtcflA2APF3 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CtcflA2APF3 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CtcflA2APF3 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CtcflA2APF3 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CtcflA2APF3 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CtcflA2APF3 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CtcflA2APF3 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CtcflA2APF3 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CtcflA2APF3 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CtcflA2APF3 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CtcflA2APF3 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CtcflA2APF3 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CtcflA2APF3 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CtcflA2APF3 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CtcflA2APF3 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CtcflA2APF3 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CtcflA2APF3 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CtcflA2APF3 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CtcflA2APF3 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CtcflA2APF3 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CtcflA2APF3 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CtcflA2APF3 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CtcflA2APF3 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CtcflA2APF3 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CtcflA2APF3 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CtcflA2APF3 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CtcflA2APF3 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CtcflA2APF3 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CtcflA2APF3 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CtcflA2APF3 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CtcflA2APF3 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CtcflA2APF3 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CtcflA2APF3 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CtcflA2APF3 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CtcflA2APF3 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CtcflA2APF3 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CtcflA2APF3 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CtcflA2APF3 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CtcflA2APF3 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CtcflA2APF3 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CtcflA2APF3 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CtcflA2APF3 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CtcflA2APF3 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CtcflA2APF3 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CtcflA2APF3 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CtcflA2APF3 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CtcflA2APF3 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CtcflA2APF3 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CtcflA2APF3 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CtcflA2APF3 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CtcflA2APF3 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CtcflA2APF3 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CtcflA2APF3 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CtcflA2APF3 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CtcflA2APF3 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CtcflA2APF3 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CtcflA2APF3 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CtcflA2APF3 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CtcflA2APF3 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CtcflA2APF3 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CtcflA2APF3 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CtcflA2APF3 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CtcflA2APF3 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CtcflA2APF3 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CtcflA2APF3 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CtcflA2APF3 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CtcflA2APF3 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CtcflA2APF3 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CtcflA2APF3 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CtcflA2APF3 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CtcflA2APF3 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CtcflA2APF3 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CtcflA2APF3 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CtcflA2APF3 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CtcflA2APF3 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CtcflA2APF3 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CtcflA2APF3 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CtcflA2APF3 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CtcflA2APF3 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CtcflA2APF3 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CtcflA2APF3 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CtcflA2APF3 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CtcflA2APF3 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CtcflA2APF3 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CtcflA2APF3 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CtcflA2APF3 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CtcflA2APF3 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CtcflA2APF3 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CtcflA2APF3 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms