Protein–RNA interactions for Protein: A2AMW3

Gabre, Gamma-aminobutyric acid (GABA) A receptor, subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabreA2AMW3 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GabreA2AMW3 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GabreA2AMW3 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GabreA2AMW3 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GabreA2AMW3 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GabreA2AMW3 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GabreA2AMW3 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GabreA2AMW3 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GabreA2AMW3 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GabreA2AMW3 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GabreA2AMW3 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GabreA2AMW3 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GabreA2AMW3 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GabreA2AMW3 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
GabreA2AMW3 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GabreA2AMW3 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GabreA2AMW3 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GabreA2AMW3 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GabreA2AMW3 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GabreA2AMW3 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GabreA2AMW3 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GabreA2AMW3 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GabreA2AMW3 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GabreA2AMW3 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GabreA2AMW3 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GabreA2AMW3 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GabreA2AMW3 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GabreA2AMW3 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GabreA2AMW3 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
GabreA2AMW3 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
GabreA2AMW3 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GabreA2AMW3 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
GabreA2AMW3 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GabreA2AMW3 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GabreA2AMW3 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GabreA2AMW3 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GabreA2AMW3 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GabreA2AMW3 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GabreA2AMW3 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GabreA2AMW3 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GabreA2AMW3 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GabreA2AMW3 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GabreA2AMW3 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GabreA2AMW3 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GabreA2AMW3 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GabreA2AMW3 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GabreA2AMW3 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GabreA2AMW3 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GabreA2AMW3 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GabreA2AMW3 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GabreA2AMW3 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GabreA2AMW3 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GabreA2AMW3 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GabreA2AMW3 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GabreA2AMW3 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GabreA2AMW3 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GabreA2AMW3 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GabreA2AMW3 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GabreA2AMW3 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GabreA2AMW3 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GabreA2AMW3 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GabreA2AMW3 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GabreA2AMW3 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GabreA2AMW3 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GabreA2AMW3 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GabreA2AMW3 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
GabreA2AMW3 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GabreA2AMW3 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
GabreA2AMW3 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
GabreA2AMW3 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GabreA2AMW3 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GabreA2AMW3 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GabreA2AMW3 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GabreA2AMW3 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GabreA2AMW3 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GabreA2AMW3 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
GabreA2AMW3 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GabreA2AMW3 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GabreA2AMW3 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GabreA2AMW3 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GabreA2AMW3 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GabreA2AMW3 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
GabreA2AMW3 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GabreA2AMW3 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GabreA2AMW3 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GabreA2AMW3 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GabreA2AMW3 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GabreA2AMW3 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GabreA2AMW3 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GabreA2AMW3 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GabreA2AMW3 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GabreA2AMW3 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GabreA2AMW3 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GabreA2AMW3 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GabreA2AMW3 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
GabreA2AMW3 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GabreA2AMW3 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GabreA2AMW3 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GabreA2AMW3 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GabreA2AMW3 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms