Protein–RNA interactions for Protein: A2AMM0

Cavin4, Caveolae-associated protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cavin4A2AMM0 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cavin4A2AMM0 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Cavin4A2AMM0 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cavin4A2AMM0 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cavin4A2AMM0 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cavin4A2AMM0 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cavin4A2AMM0 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cavin4A2AMM0 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cavin4A2AMM0 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cavin4A2AMM0 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cavin4A2AMM0 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cavin4A2AMM0 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Cavin4A2AMM0 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cavin4A2AMM0 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cavin4A2AMM0 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cavin4A2AMM0 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cavin4A2AMM0 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cavin4A2AMM0 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cavin4A2AMM0 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cavin4A2AMM0 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cavin4A2AMM0 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cavin4A2AMM0 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cavin4A2AMM0 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Cavin4A2AMM0 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cavin4A2AMM0 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cavin4A2AMM0 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cavin4A2AMM0 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cavin4A2AMM0 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cavin4A2AMM0 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cavin4A2AMM0 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cavin4A2AMM0 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cavin4A2AMM0 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cavin4A2AMM0 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cavin4A2AMM0 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cavin4A2AMM0 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cavin4A2AMM0 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cavin4A2AMM0 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cavin4A2AMM0 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cavin4A2AMM0 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cavin4A2AMM0 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cavin4A2AMM0 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cavin4A2AMM0 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC25.58■■□□□ 1.68
Cavin4A2AMM0 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cavin4A2AMM0 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cavin4A2AMM0 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cavin4A2AMM0 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cavin4A2AMM0 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Cavin4A2AMM0 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cavin4A2AMM0 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cavin4A2AMM0 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cavin4A2AMM0 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cavin4A2AMM0 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cavin4A2AMM0 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cavin4A2AMM0 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cavin4A2AMM0 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Cavin4A2AMM0 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cavin4A2AMM0 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cavin4A2AMM0 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cavin4A2AMM0 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cavin4A2AMM0 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cavin4A2AMM0 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cavin4A2AMM0 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cavin4A2AMM0 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cavin4A2AMM0 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cavin4A2AMM0 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cavin4A2AMM0 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cavin4A2AMM0 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Cavin4A2AMM0 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cavin4A2AMM0 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cavin4A2AMM0 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cavin4A2AMM0 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cavin4A2AMM0 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cavin4A2AMM0 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cavin4A2AMM0 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cavin4A2AMM0 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cavin4A2AMM0 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cavin4A2AMM0 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cavin4A2AMM0 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cavin4A2AMM0 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cavin4A2AMM0 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cavin4A2AMM0 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cavin4A2AMM0 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cavin4A2AMM0 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cavin4A2AMM0 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cavin4A2AMM0 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cavin4A2AMM0 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cavin4A2AMM0 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cavin4A2AMM0 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cavin4A2AMM0 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cavin4A2AMM0 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cavin4A2AMM0 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cavin4A2AMM0 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cavin4A2AMM0 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cavin4A2AMM0 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cavin4A2AMM0 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
Cavin4A2AMM0 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cavin4A2AMM0 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cavin4A2AMM0 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cavin4A2AMM0 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cavin4A2AMM0 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms