Protein–RNA interactions for Protein: A2AKX3

Setx, Probable helicase senataxin, mousemouse

Predictions only

Length 2,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SetxA2AKX3 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SetxA2AKX3 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SetxA2AKX3 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SetxA2AKX3 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SetxA2AKX3 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SetxA2AKX3 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SetxA2AKX3 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SetxA2AKX3 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SetxA2AKX3 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SetxA2AKX3 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SetxA2AKX3 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SetxA2AKX3 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SetxA2AKX3 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SetxA2AKX3 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SetxA2AKX3 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SetxA2AKX3 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SetxA2AKX3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SetxA2AKX3 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SetxA2AKX3 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SetxA2AKX3 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SetxA2AKX3 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SetxA2AKX3 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SetxA2AKX3 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SetxA2AKX3 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SetxA2AKX3 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SetxA2AKX3 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SetxA2AKX3 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SetxA2AKX3 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SetxA2AKX3 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SetxA2AKX3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SetxA2AKX3 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SetxA2AKX3 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SetxA2AKX3 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SetxA2AKX3 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SetxA2AKX3 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SetxA2AKX3 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SetxA2AKX3 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SetxA2AKX3 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SetxA2AKX3 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SetxA2AKX3 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SetxA2AKX3 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SetxA2AKX3 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SetxA2AKX3 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SetxA2AKX3 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SetxA2AKX3 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SetxA2AKX3 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SetxA2AKX3 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SetxA2AKX3 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SetxA2AKX3 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SetxA2AKX3 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SetxA2AKX3 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SetxA2AKX3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SetxA2AKX3 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SetxA2AKX3 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SetxA2AKX3 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SetxA2AKX3 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SetxA2AKX3 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SetxA2AKX3 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SetxA2AKX3 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SetxA2AKX3 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SetxA2AKX3 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SetxA2AKX3 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SetxA2AKX3 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SetxA2AKX3 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SetxA2AKX3 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SetxA2AKX3 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SetxA2AKX3 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SetxA2AKX3 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SetxA2AKX3 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SetxA2AKX3 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SetxA2AKX3 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SetxA2AKX3 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SetxA2AKX3 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SetxA2AKX3 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SetxA2AKX3 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SetxA2AKX3 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SetxA2AKX3 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SetxA2AKX3 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SetxA2AKX3 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SetxA2AKX3 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SetxA2AKX3 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SetxA2AKX3 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SetxA2AKX3 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SetxA2AKX3 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SetxA2AKX3 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SetxA2AKX3 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SetxA2AKX3 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SetxA2AKX3 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SetxA2AKX3 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SetxA2AKX3 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SetxA2AKX3 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SetxA2AKX3 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SetxA2AKX3 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SetxA2AKX3 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SetxA2AKX3 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SetxA2AKX3 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SetxA2AKX3 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SetxA2AKX3 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SetxA2AKX3 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SetxA2AKX3 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms