Protein–RNA interactions for Protein: A2AKG8

Focad, Focadhesin, mousemouse

Predictions only

Length 1,798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FocadA2AKG8 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FocadA2AKG8 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
FocadA2AKG8 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
FocadA2AKG8 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
FocadA2AKG8 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
FocadA2AKG8 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
FocadA2AKG8 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
FocadA2AKG8 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
FocadA2AKG8 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
FocadA2AKG8 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
FocadA2AKG8 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
FocadA2AKG8 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
FocadA2AKG8 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
FocadA2AKG8 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
FocadA2AKG8 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
FocadA2AKG8 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
FocadA2AKG8 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
FocadA2AKG8 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
FocadA2AKG8 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
FocadA2AKG8 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
FocadA2AKG8 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FocadA2AKG8 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
FocadA2AKG8 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
FocadA2AKG8 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
FocadA2AKG8 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
FocadA2AKG8 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
FocadA2AKG8 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
FocadA2AKG8 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
FocadA2AKG8 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
FocadA2AKG8 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
FocadA2AKG8 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
FocadA2AKG8 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
FocadA2AKG8 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
FocadA2AKG8 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
FocadA2AKG8 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
FocadA2AKG8 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
FocadA2AKG8 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
FocadA2AKG8 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
FocadA2AKG8 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
FocadA2AKG8 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
FocadA2AKG8 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
FocadA2AKG8 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
FocadA2AKG8 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
FocadA2AKG8 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
FocadA2AKG8 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
FocadA2AKG8 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
FocadA2AKG8 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
FocadA2AKG8 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
FocadA2AKG8 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
FocadA2AKG8 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
FocadA2AKG8 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
FocadA2AKG8 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
FocadA2AKG8 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
FocadA2AKG8 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
FocadA2AKG8 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
FocadA2AKG8 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
FocadA2AKG8 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
FocadA2AKG8 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
FocadA2AKG8 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
FocadA2AKG8 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
FocadA2AKG8 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
FocadA2AKG8 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
FocadA2AKG8 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
FocadA2AKG8 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
FocadA2AKG8 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
FocadA2AKG8 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
FocadA2AKG8 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
FocadA2AKG8 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
FocadA2AKG8 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
FocadA2AKG8 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
FocadA2AKG8 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
FocadA2AKG8 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
FocadA2AKG8 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
FocadA2AKG8 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FocadA2AKG8 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FocadA2AKG8 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FocadA2AKG8 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
FocadA2AKG8 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
FocadA2AKG8 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
FocadA2AKG8 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
FocadA2AKG8 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FocadA2AKG8 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FocadA2AKG8 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FocadA2AKG8 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
FocadA2AKG8 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FocadA2AKG8 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FocadA2AKG8 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
FocadA2AKG8 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FocadA2AKG8 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
FocadA2AKG8 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FocadA2AKG8 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FocadA2AKG8 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FocadA2AKG8 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FocadA2AKG8 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FocadA2AKG8 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
FocadA2AKG8 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
FocadA2AKG8 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
FocadA2AKG8 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
FocadA2AKG8 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
FocadA2AKG8 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms