Protein–RNA interactions for Protein: A2AHA7

Pramel3, Preferentially-expressed antigen in melanoma-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramel3A2AHA7 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pramel3A2AHA7 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pramel3A2AHA7 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pramel3A2AHA7 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pramel3A2AHA7 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pramel3A2AHA7 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pramel3A2AHA7 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pramel3A2AHA7 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pramel3A2AHA7 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pramel3A2AHA7 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pramel3A2AHA7 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pramel3A2AHA7 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pramel3A2AHA7 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pramel3A2AHA7 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pramel3A2AHA7 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pramel3A2AHA7 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Pramel3A2AHA7 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pramel3A2AHA7 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pramel3A2AHA7 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pramel3A2AHA7 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pramel3A2AHA7 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pramel3A2AHA7 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pramel3A2AHA7 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pramel3A2AHA7 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pramel3A2AHA7 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pramel3A2AHA7 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pramel3A2AHA7 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pramel3A2AHA7 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pramel3A2AHA7 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pramel3A2AHA7 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pramel3A2AHA7 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pramel3A2AHA7 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pramel3A2AHA7 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pramel3A2AHA7 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pramel3A2AHA7 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pramel3A2AHA7 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pramel3A2AHA7 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pramel3A2AHA7 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pramel3A2AHA7 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pramel3A2AHA7 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pramel3A2AHA7 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pramel3A2AHA7 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pramel3A2AHA7 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pramel3A2AHA7 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pramel3A2AHA7 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pramel3A2AHA7 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pramel3A2AHA7 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pramel3A2AHA7 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Pramel3A2AHA7 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pramel3A2AHA7 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pramel3A2AHA7 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pramel3A2AHA7 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pramel3A2AHA7 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pramel3A2AHA7 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pramel3A2AHA7 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pramel3A2AHA7 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pramel3A2AHA7 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pramel3A2AHA7 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pramel3A2AHA7 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pramel3A2AHA7 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pramel3A2AHA7 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pramel3A2AHA7 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pramel3A2AHA7 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pramel3A2AHA7 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pramel3A2AHA7 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pramel3A2AHA7 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pramel3A2AHA7 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pramel3A2AHA7 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pramel3A2AHA7 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pramel3A2AHA7 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pramel3A2AHA7 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pramel3A2AHA7 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pramel3A2AHA7 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pramel3A2AHA7 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pramel3A2AHA7 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pramel3A2AHA7 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pramel3A2AHA7 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pramel3A2AHA7 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pramel3A2AHA7 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pramel3A2AHA7 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pramel3A2AHA7 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pramel3A2AHA7 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pramel3A2AHA7 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pramel3A2AHA7 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pramel3A2AHA7 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pramel3A2AHA7 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Pramel3A2AHA7 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Pramel3A2AHA7 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pramel3A2AHA7 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pramel3A2AHA7 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Pramel3A2AHA7 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pramel3A2AHA7 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pramel3A2AHA7 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pramel3A2AHA7 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pramel3A2AHA7 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pramel3A2AHA7 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pramel3A2AHA7 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pramel3A2AHA7 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pramel3A2AHA7 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pramel3A2AHA7 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms