Protein–RNA interactions for Protein: A2AFR2

4930447F04Rik, RIKEN cDNA 4930447F04 gene, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930447F04RikA2AFR2 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
4930447F04RikA2AFR2 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
4930447F04RikA2AFR2 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
4930447F04RikA2AFR2 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
4930447F04RikA2AFR2 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
4930447F04RikA2AFR2 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
4930447F04RikA2AFR2 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
4930447F04RikA2AFR2 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
4930447F04RikA2AFR2 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
4930447F04RikA2AFR2 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
4930447F04RikA2AFR2 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
4930447F04RikA2AFR2 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
4930447F04RikA2AFR2 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
4930447F04RikA2AFR2 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
4930447F04RikA2AFR2 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
4930447F04RikA2AFR2 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
4930447F04RikA2AFR2 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
4930447F04RikA2AFR2 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
4930447F04RikA2AFR2 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
4930447F04RikA2AFR2 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
4930447F04RikA2AFR2 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
4930447F04RikA2AFR2 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
4930447F04RikA2AFR2 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
4930447F04RikA2AFR2 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
4930447F04RikA2AFR2 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
4930447F04RikA2AFR2 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
4930447F04RikA2AFR2 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
4930447F04RikA2AFR2 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
4930447F04RikA2AFR2 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
4930447F04RikA2AFR2 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
4930447F04RikA2AFR2 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
4930447F04RikA2AFR2 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
4930447F04RikA2AFR2 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
4930447F04RikA2AFR2 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
4930447F04RikA2AFR2 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
4930447F04RikA2AFR2 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
4930447F04RikA2AFR2 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
4930447F04RikA2AFR2 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
4930447F04RikA2AFR2 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
4930447F04RikA2AFR2 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
4930447F04RikA2AFR2 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
4930447F04RikA2AFR2 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
4930447F04RikA2AFR2 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
4930447F04RikA2AFR2 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
4930447F04RikA2AFR2 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
4930447F04RikA2AFR2 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
4930447F04RikA2AFR2 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
4930447F04RikA2AFR2 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
4930447F04RikA2AFR2 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
4930447F04RikA2AFR2 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
4930447F04RikA2AFR2 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
4930447F04RikA2AFR2 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
4930447F04RikA2AFR2 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
4930447F04RikA2AFR2 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
4930447F04RikA2AFR2 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
4930447F04RikA2AFR2 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
4930447F04RikA2AFR2 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
4930447F04RikA2AFR2 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
4930447F04RikA2AFR2 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
4930447F04RikA2AFR2 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
4930447F04RikA2AFR2 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
4930447F04RikA2AFR2 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
4930447F04RikA2AFR2 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
4930447F04RikA2AFR2 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
4930447F04RikA2AFR2 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
4930447F04RikA2AFR2 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
4930447F04RikA2AFR2 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
4930447F04RikA2AFR2 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
4930447F04RikA2AFR2 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
4930447F04RikA2AFR2 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
4930447F04RikA2AFR2 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
4930447F04RikA2AFR2 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
4930447F04RikA2AFR2 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
4930447F04RikA2AFR2 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
4930447F04RikA2AFR2 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
4930447F04RikA2AFR2 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
4930447F04RikA2AFR2 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
4930447F04RikA2AFR2 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
4930447F04RikA2AFR2 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
4930447F04RikA2AFR2 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
4930447F04RikA2AFR2 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
4930447F04RikA2AFR2 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
4930447F04RikA2AFR2 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
4930447F04RikA2AFR2 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
4930447F04RikA2AFR2 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
4930447F04RikA2AFR2 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
4930447F04RikA2AFR2 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
4930447F04RikA2AFR2 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
4930447F04RikA2AFR2 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
4930447F04RikA2AFR2 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
4930447F04RikA2AFR2 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
4930447F04RikA2AFR2 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
4930447F04RikA2AFR2 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
4930447F04RikA2AFR2 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
4930447F04RikA2AFR2 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
4930447F04RikA2AFR2 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
4930447F04RikA2AFR2 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
4930447F04RikA2AFR2 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
4930447F04RikA2AFR2 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
4930447F04RikA2AFR2 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms