Protein–RNA interactions for Protein: A2AD83

Frmd7, FERM domain-containing protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmd7A2AD83 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Frmd7A2AD83 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Frmd7A2AD83 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Frmd7A2AD83 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Frmd7A2AD83 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Frmd7A2AD83 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Frmd7A2AD83 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Frmd7A2AD83 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Frmd7A2AD83 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Frmd7A2AD83 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Frmd7A2AD83 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Frmd7A2AD83 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Frmd7A2AD83 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Frmd7A2AD83 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Frmd7A2AD83 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Frmd7A2AD83 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Frmd7A2AD83 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Frmd7A2AD83 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Frmd7A2AD83 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Frmd7A2AD83 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Frmd7A2AD83 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Frmd7A2AD83 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Frmd7A2AD83 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Frmd7A2AD83 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Frmd7A2AD83 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Frmd7A2AD83 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Frmd7A2AD83 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Frmd7A2AD83 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Frmd7A2AD83 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Frmd7A2AD83 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Frmd7A2AD83 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Frmd7A2AD83 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Frmd7A2AD83 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Frmd7A2AD83 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Frmd7A2AD83 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Frmd7A2AD83 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Frmd7A2AD83 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Frmd7A2AD83 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Frmd7A2AD83 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Frmd7A2AD83 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Frmd7A2AD83 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Frmd7A2AD83 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Frmd7A2AD83 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Frmd7A2AD83 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Frmd7A2AD83 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Frmd7A2AD83 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Frmd7A2AD83 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Frmd7A2AD83 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Frmd7A2AD83 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Frmd7A2AD83 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Frmd7A2AD83 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Frmd7A2AD83 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Frmd7A2AD83 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Frmd7A2AD83 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Frmd7A2AD83 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Frmd7A2AD83 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Frmd7A2AD83 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Frmd7A2AD83 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Frmd7A2AD83 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Frmd7A2AD83 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Frmd7A2AD83 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Frmd7A2AD83 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Frmd7A2AD83 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Frmd7A2AD83 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Frmd7A2AD83 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Frmd7A2AD83 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Frmd7A2AD83 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Frmd7A2AD83 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Frmd7A2AD83 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Frmd7A2AD83 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Frmd7A2AD83 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Frmd7A2AD83 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Frmd7A2AD83 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Frmd7A2AD83 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Frmd7A2AD83 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Frmd7A2AD83 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Frmd7A2AD83 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Frmd7A2AD83 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Frmd7A2AD83 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Frmd7A2AD83 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Frmd7A2AD83 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Frmd7A2AD83 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Frmd7A2AD83 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Frmd7A2AD83 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Frmd7A2AD83 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Frmd7A2AD83 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Frmd7A2AD83 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Frmd7A2AD83 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Frmd7A2AD83 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Frmd7A2AD83 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Frmd7A2AD83 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Frmd7A2AD83 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Frmd7A2AD83 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Frmd7A2AD83 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Frmd7A2AD83 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Frmd7A2AD83 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Frmd7A2AD83 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Frmd7A2AD83 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Frmd7A2AD83 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Frmd7A2AD83 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 167.7 ms