Protein–RNA interactions for Protein: A2A8M8

Pramef6, PRAME family member 6, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef6A2A8M8 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pramef6A2A8M8 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pramef6A2A8M8 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pramef6A2A8M8 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Pramef6A2A8M8 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pramef6A2A8M8 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pramef6A2A8M8 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Pramef6A2A8M8 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pramef6A2A8M8 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pramef6A2A8M8 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pramef6A2A8M8 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pramef6A2A8M8 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pramef6A2A8M8 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pramef6A2A8M8 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pramef6A2A8M8 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pramef6A2A8M8 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pramef6A2A8M8 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pramef6A2A8M8 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pramef6A2A8M8 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pramef6A2A8M8 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pramef6A2A8M8 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pramef6A2A8M8 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Pramef6A2A8M8 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pramef6A2A8M8 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pramef6A2A8M8 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pramef6A2A8M8 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pramef6A2A8M8 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pramef6A2A8M8 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pramef6A2A8M8 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pramef6A2A8M8 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pramef6A2A8M8 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pramef6A2A8M8 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pramef6A2A8M8 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pramef6A2A8M8 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pramef6A2A8M8 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pramef6A2A8M8 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pramef6A2A8M8 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pramef6A2A8M8 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pramef6A2A8M8 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pramef6A2A8M8 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pramef6A2A8M8 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Pramef6A2A8M8 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pramef6A2A8M8 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pramef6A2A8M8 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pramef6A2A8M8 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pramef6A2A8M8 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pramef6A2A8M8 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pramef6A2A8M8 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pramef6A2A8M8 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pramef6A2A8M8 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pramef6A2A8M8 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pramef6A2A8M8 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Pramef6A2A8M8 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pramef6A2A8M8 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pramef6A2A8M8 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pramef6A2A8M8 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Pramef6A2A8M8 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pramef6A2A8M8 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pramef6A2A8M8 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pramef6A2A8M8 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pramef6A2A8M8 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pramef6A2A8M8 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pramef6A2A8M8 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pramef6A2A8M8 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pramef6A2A8M8 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pramef6A2A8M8 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pramef6A2A8M8 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pramef6A2A8M8 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pramef6A2A8M8 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pramef6A2A8M8 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Pramef6A2A8M8 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pramef6A2A8M8 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pramef6A2A8M8 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Pramef6A2A8M8 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pramef6A2A8M8 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pramef6A2A8M8 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pramef6A2A8M8 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pramef6A2A8M8 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pramef6A2A8M8 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pramef6A2A8M8 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pramef6A2A8M8 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pramef6A2A8M8 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pramef6A2A8M8 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pramef6A2A8M8 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pramef6A2A8M8 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Pramef6A2A8M8 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pramef6A2A8M8 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pramef6A2A8M8 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pramef6A2A8M8 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pramef6A2A8M8 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pramef6A2A8M8 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pramef6A2A8M8 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pramef6A2A8M8 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pramef6A2A8M8 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pramef6A2A8M8 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pramef6A2A8M8 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pramef6A2A8M8 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pramef6A2A8M8 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pramef6A2A8M8 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pramef6A2A8M8 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms