Protein–RNA interactions for Protein: A2A8L1

Chd5, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,946 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd5A2A8L1 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Chd5A2A8L1 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Chd5A2A8L1 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Chd5A2A8L1 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Chd5A2A8L1 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Chd5A2A8L1 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Chd5A2A8L1 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Chd5A2A8L1 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Chd5A2A8L1 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Chd5A2A8L1 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Chd5A2A8L1 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Chd5A2A8L1 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Chd5A2A8L1 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Chd5A2A8L1 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
Chd5A2A8L1 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Chd5A2A8L1 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Chd5A2A8L1 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Chd5A2A8L1 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Chd5A2A8L1 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Chd5A2A8L1 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Chd5A2A8L1 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Chd5A2A8L1 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Chd5A2A8L1 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Chd5A2A8L1 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Chd5A2A8L1 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Chd5A2A8L1 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Chd5A2A8L1 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Chd5A2A8L1 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Chd5A2A8L1 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Chd5A2A8L1 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Chd5A2A8L1 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Chd5A2A8L1 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Chd5A2A8L1 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Chd5A2A8L1 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Chd5A2A8L1 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Chd5A2A8L1 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Chd5A2A8L1 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Chd5A2A8L1 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Chd5A2A8L1 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Chd5A2A8L1 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Chd5A2A8L1 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Chd5A2A8L1 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Chd5A2A8L1 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Chd5A2A8L1 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Chd5A2A8L1 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Chd5A2A8L1 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Chd5A2A8L1 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Chd5A2A8L1 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Chd5A2A8L1 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Chd5A2A8L1 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Chd5A2A8L1 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Chd5A2A8L1 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Chd5A2A8L1 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Chd5A2A8L1 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Chd5A2A8L1 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Chd5A2A8L1 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Chd5A2A8L1 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Chd5A2A8L1 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Chd5A2A8L1 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Chd5A2A8L1 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Chd5A2A8L1 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Chd5A2A8L1 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Chd5A2A8L1 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Chd5A2A8L1 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Chd5A2A8L1 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Chd5A2A8L1 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Chd5A2A8L1 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Chd5A2A8L1 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Chd5A2A8L1 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Chd5A2A8L1 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Chd5A2A8L1 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Chd5A2A8L1 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Chd5A2A8L1 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Chd5A2A8L1 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Chd5A2A8L1 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Chd5A2A8L1 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Chd5A2A8L1 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Chd5A2A8L1 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Chd5A2A8L1 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Chd5A2A8L1 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Chd5A2A8L1 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Chd5A2A8L1 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Chd5A2A8L1 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Chd5A2A8L1 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Chd5A2A8L1 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Chd5A2A8L1 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Chd5A2A8L1 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Chd5A2A8L1 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Chd5A2A8L1 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Chd5A2A8L1 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Chd5A2A8L1 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Chd5A2A8L1 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Chd5A2A8L1 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Chd5A2A8L1 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Chd5A2A8L1 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Chd5A2A8L1 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Chd5A2A8L1 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Chd5A2A8L1 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Chd5A2A8L1 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Chd5A2A8L1 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.2 ms