Protein–RNA interactions for Protein: A2A654

Bptf, Bromodomain PHD finger transcription factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 3,036 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BptfA2A654 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BptfA2A654 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BptfA2A654 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BptfA2A654 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BptfA2A654 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BptfA2A654 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
BptfA2A654 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BptfA2A654 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
BptfA2A654 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BptfA2A654 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BptfA2A654 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BptfA2A654 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BptfA2A654 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BptfA2A654 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BptfA2A654 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BptfA2A654 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BptfA2A654 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BptfA2A654 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BptfA2A654 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BptfA2A654 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BptfA2A654 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BptfA2A654 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BptfA2A654 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BptfA2A654 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BptfA2A654 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BptfA2A654 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BptfA2A654 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BptfA2A654 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BptfA2A654 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BptfA2A654 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BptfA2A654 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BptfA2A654 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BptfA2A654 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BptfA2A654 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BptfA2A654 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BptfA2A654 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BptfA2A654 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BptfA2A654 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BptfA2A654 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BptfA2A654 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BptfA2A654 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BptfA2A654 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BptfA2A654 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BptfA2A654 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BptfA2A654 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BptfA2A654 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BptfA2A654 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BptfA2A654 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BptfA2A654 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BptfA2A654 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BptfA2A654 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BptfA2A654 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BptfA2A654 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BptfA2A654 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BptfA2A654 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BptfA2A654 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BptfA2A654 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BptfA2A654 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BptfA2A654 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BptfA2A654 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
BptfA2A654 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
BptfA2A654 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BptfA2A654 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BptfA2A654 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BptfA2A654 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BptfA2A654 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BptfA2A654 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BptfA2A654 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BptfA2A654 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BptfA2A654 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BptfA2A654 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BptfA2A654 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BptfA2A654 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BptfA2A654 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BptfA2A654 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BptfA2A654 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BptfA2A654 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BptfA2A654 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BptfA2A654 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BptfA2A654 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BptfA2A654 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BptfA2A654 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BptfA2A654 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BptfA2A654 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BptfA2A654 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BptfA2A654 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BptfA2A654 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BptfA2A654 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BptfA2A654 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BptfA2A654 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BptfA2A654 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BptfA2A654 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BptfA2A654 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BptfA2A654 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BptfA2A654 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BptfA2A654 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
BptfA2A654 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
BptfA2A654 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BptfA2A654 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BptfA2A654 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms