Protein–RNA interactions for Protein: A2A5N3

Pabpc1l, Polyadenylate-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc1lA2A5N3 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pabpc1lA2A5N3 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pabpc1lA2A5N3 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pabpc1lA2A5N3 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Pabpc1lA2A5N3 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pabpc1lA2A5N3 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pabpc1lA2A5N3 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pabpc1lA2A5N3 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pabpc1lA2A5N3 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pabpc1lA2A5N3 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pabpc1lA2A5N3 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pabpc1lA2A5N3 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pabpc1lA2A5N3 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pabpc1lA2A5N3 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pabpc1lA2A5N3 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pabpc1lA2A5N3 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pabpc1lA2A5N3 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pabpc1lA2A5N3 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pabpc1lA2A5N3 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pabpc1lA2A5N3 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pabpc1lA2A5N3 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pabpc1lA2A5N3 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pabpc1lA2A5N3 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pabpc1lA2A5N3 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pabpc1lA2A5N3 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pabpc1lA2A5N3 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pabpc1lA2A5N3 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pabpc1lA2A5N3 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pabpc1lA2A5N3 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pabpc1lA2A5N3 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pabpc1lA2A5N3 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pabpc1lA2A5N3 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pabpc1lA2A5N3 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pabpc1lA2A5N3 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pabpc1lA2A5N3 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pabpc1lA2A5N3 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pabpc1lA2A5N3 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pabpc1lA2A5N3 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pabpc1lA2A5N3 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pabpc1lA2A5N3 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pabpc1lA2A5N3 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pabpc1lA2A5N3 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pabpc1lA2A5N3 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pabpc1lA2A5N3 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pabpc1lA2A5N3 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pabpc1lA2A5N3 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pabpc1lA2A5N3 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pabpc1lA2A5N3 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pabpc1lA2A5N3 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pabpc1lA2A5N3 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pabpc1lA2A5N3 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pabpc1lA2A5N3 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pabpc1lA2A5N3 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pabpc1lA2A5N3 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pabpc1lA2A5N3 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pabpc1lA2A5N3 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pabpc1lA2A5N3 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pabpc1lA2A5N3 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Pabpc1lA2A5N3 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pabpc1lA2A5N3 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pabpc1lA2A5N3 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pabpc1lA2A5N3 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pabpc1lA2A5N3 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pabpc1lA2A5N3 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pabpc1lA2A5N3 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Pabpc1lA2A5N3 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pabpc1lA2A5N3 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pabpc1lA2A5N3 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pabpc1lA2A5N3 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pabpc1lA2A5N3 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pabpc1lA2A5N3 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pabpc1lA2A5N3 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pabpc1lA2A5N3 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pabpc1lA2A5N3 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pabpc1lA2A5N3 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pabpc1lA2A5N3 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pabpc1lA2A5N3 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pabpc1lA2A5N3 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pabpc1lA2A5N3 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pabpc1lA2A5N3 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Pabpc1lA2A5N3 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pabpc1lA2A5N3 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pabpc1lA2A5N3 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pabpc1lA2A5N3 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pabpc1lA2A5N3 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pabpc1lA2A5N3 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pabpc1lA2A5N3 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pabpc1lA2A5N3 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pabpc1lA2A5N3 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pabpc1lA2A5N3 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pabpc1lA2A5N3 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pabpc1lA2A5N3 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pabpc1lA2A5N3 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pabpc1lA2A5N3 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pabpc1lA2A5N3 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pabpc1lA2A5N3 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pabpc1lA2A5N3 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pabpc1lA2A5N3 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pabpc1lA2A5N3 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pabpc1lA2A5N3 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms