Protein–RNA interactions for Protein: A0AUP1

Ccdc112, Coiled-coil domain-containing protein 112, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc112A0AUP1 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc112A0AUP1 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc112A0AUP1 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc112A0AUP1 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc112A0AUP1 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc112A0AUP1 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc112A0AUP1 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc112A0AUP1 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc112A0AUP1 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc112A0AUP1 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc112A0AUP1 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc112A0AUP1 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc112A0AUP1 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc112A0AUP1 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc112A0AUP1 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc112A0AUP1 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc112A0AUP1 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc112A0AUP1 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc112A0AUP1 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc112A0AUP1 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Ccdc112A0AUP1 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc112A0AUP1 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc112A0AUP1 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc112A0AUP1 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc112A0AUP1 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc112A0AUP1 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc112A0AUP1 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc112A0AUP1 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc112A0AUP1 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc112A0AUP1 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc112A0AUP1 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc112A0AUP1 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc112A0AUP1 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc112A0AUP1 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc112A0AUP1 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc112A0AUP1 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc112A0AUP1 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc112A0AUP1 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc112A0AUP1 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc112A0AUP1 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc112A0AUP1 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc112A0AUP1 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc112A0AUP1 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc112A0AUP1 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc112A0AUP1 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc112A0AUP1 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc112A0AUP1 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc112A0AUP1 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc112A0AUP1 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc112A0AUP1 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc112A0AUP1 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc112A0AUP1 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc112A0AUP1 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc112A0AUP1 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc112A0AUP1 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc112A0AUP1 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc112A0AUP1 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc112A0AUP1 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc112A0AUP1 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc112A0AUP1 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc112A0AUP1 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc112A0AUP1 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc112A0AUP1 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc112A0AUP1 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc112A0AUP1 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc112A0AUP1 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc112A0AUP1 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc112A0AUP1 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc112A0AUP1 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc112A0AUP1 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc112A0AUP1 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc112A0AUP1 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc112A0AUP1 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc112A0AUP1 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc112A0AUP1 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc112A0AUP1 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc112A0AUP1 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc112A0AUP1 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc112A0AUP1 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc112A0AUP1 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ccdc112A0AUP1 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc112A0AUP1 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc112A0AUP1 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc112A0AUP1 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc112A0AUP1 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc112A0AUP1 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc112A0AUP1 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc112A0AUP1 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc112A0AUP1 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc112A0AUP1 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc112A0AUP1 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc112A0AUP1 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc112A0AUP1 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc112A0AUP1 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc112A0AUP1 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc112A0AUP1 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc112A0AUP1 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc112A0AUP1 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc112A0AUP1 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc112A0AUP1 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms