Protein–RNA interactions for Protein: A0A140LIX9

Cfap99, Cilia and flagella-associated protein 99, mousemouse

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Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap99A0A140LIX9 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cfap99A0A140LIX9 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cfap99A0A140LIX9 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cfap99A0A140LIX9 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cfap99A0A140LIX9 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Cfap99A0A140LIX9 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cfap99A0A140LIX9 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Cfap99A0A140LIX9 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Cfap99A0A140LIX9 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cfap99A0A140LIX9 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cfap99A0A140LIX9 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cfap99A0A140LIX9 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cfap99A0A140LIX9 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cfap99A0A140LIX9 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cfap99A0A140LIX9 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cfap99A0A140LIX9 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cfap99A0A140LIX9 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cfap99A0A140LIX9 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cfap99A0A140LIX9 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cfap99A0A140LIX9 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cfap99A0A140LIX9 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cfap99A0A140LIX9 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Cfap99A0A140LIX9 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cfap99A0A140LIX9 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cfap99A0A140LIX9 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cfap99A0A140LIX9 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cfap99A0A140LIX9 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cfap99A0A140LIX9 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cfap99A0A140LIX9 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cfap99A0A140LIX9 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cfap99A0A140LIX9 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cfap99A0A140LIX9 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cfap99A0A140LIX9 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cfap99A0A140LIX9 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cfap99A0A140LIX9 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cfap99A0A140LIX9 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cfap99A0A140LIX9 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cfap99A0A140LIX9 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cfap99A0A140LIX9 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Cfap99A0A140LIX9 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cfap99A0A140LIX9 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cfap99A0A140LIX9 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cfap99A0A140LIX9 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cfap99A0A140LIX9 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cfap99A0A140LIX9 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cfap99A0A140LIX9 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cfap99A0A140LIX9 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Cfap99A0A140LIX9 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cfap99A0A140LIX9 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cfap99A0A140LIX9 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cfap99A0A140LIX9 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cfap99A0A140LIX9 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cfap99A0A140LIX9 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Cfap99A0A140LIX9 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cfap99A0A140LIX9 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Cfap99A0A140LIX9 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cfap99A0A140LIX9 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cfap99A0A140LIX9 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cfap99A0A140LIX9 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cfap99A0A140LIX9 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cfap99A0A140LIX9 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cfap99A0A140LIX9 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cfap99A0A140LIX9 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cfap99A0A140LIX9 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cfap99A0A140LIX9 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cfap99A0A140LIX9 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cfap99A0A140LIX9 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cfap99A0A140LIX9 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cfap99A0A140LIX9 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cfap99A0A140LIX9 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cfap99A0A140LIX9 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cfap99A0A140LIX9 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cfap99A0A140LIX9 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cfap99A0A140LIX9 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cfap99A0A140LIX9 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cfap99A0A140LIX9 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cfap99A0A140LIX9 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cfap99A0A140LIX9 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cfap99A0A140LIX9 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cfap99A0A140LIX9 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cfap99A0A140LIX9 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cfap99A0A140LIX9 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cfap99A0A140LIX9 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cfap99A0A140LIX9 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cfap99A0A140LIX9 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cfap99A0A140LIX9 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cfap99A0A140LIX9 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cfap99A0A140LIX9 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cfap99A0A140LIX9 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cfap99A0A140LIX9 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Cfap99A0A140LIX9 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cfap99A0A140LIX9 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cfap99A0A140LIX9 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cfap99A0A140LIX9 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cfap99A0A140LIX9 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cfap99A0A140LIX9 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cfap99A0A140LIX9 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cfap99A0A140LIX9 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cfap99A0A140LIX9 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cfap99A0A140LIX9 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
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