Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RP08

1700028J19Rik, RIKEN cDNA 1700028J19 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
1700028J19RikA0A0U1RP08 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
1700028J19RikA0A0U1RP08 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
1700028J19RikA0A0U1RP08 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
1700028J19RikA0A0U1RP08 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
1700028J19RikA0A0U1RP08 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
1700028J19RikA0A0U1RP08 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
1700028J19RikA0A0U1RP08 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
1700028J19RikA0A0U1RP08 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
1700028J19RikA0A0U1RP08 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
1700028J19RikA0A0U1RP08 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
1700028J19RikA0A0U1RP08 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
1700028J19RikA0A0U1RP08 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
1700028J19RikA0A0U1RP08 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
1700028J19RikA0A0U1RP08 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
1700028J19RikA0A0U1RP08 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
1700028J19RikA0A0U1RP08 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
1700028J19RikA0A0U1RP08 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
1700028J19RikA0A0U1RP08 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
1700028J19RikA0A0U1RP08 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
1700028J19RikA0A0U1RP08 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
1700028J19RikA0A0U1RP08 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
1700028J19RikA0A0U1RP08 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
1700028J19RikA0A0U1RP08 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
1700028J19RikA0A0U1RP08 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
1700028J19RikA0A0U1RP08 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
1700028J19RikA0A0U1RP08 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
1700028J19RikA0A0U1RP08 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
1700028J19RikA0A0U1RP08 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
1700028J19RikA0A0U1RP08 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
1700028J19RikA0A0U1RP08 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
1700028J19RikA0A0U1RP08 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
1700028J19RikA0A0U1RP08 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
1700028J19RikA0A0U1RP08 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
1700028J19RikA0A0U1RP08 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
1700028J19RikA0A0U1RP08 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
1700028J19RikA0A0U1RP08 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
1700028J19RikA0A0U1RP08 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
1700028J19RikA0A0U1RP08 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
1700028J19RikA0A0U1RP08 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
1700028J19RikA0A0U1RP08 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
1700028J19RikA0A0U1RP08 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
1700028J19RikA0A0U1RP08 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
1700028J19RikA0A0U1RP08 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
1700028J19RikA0A0U1RP08 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
1700028J19RikA0A0U1RP08 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
1700028J19RikA0A0U1RP08 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
1700028J19RikA0A0U1RP08 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
1700028J19RikA0A0U1RP08 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
1700028J19RikA0A0U1RP08 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
1700028J19RikA0A0U1RP08 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
1700028J19RikA0A0U1RP08 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
1700028J19RikA0A0U1RP08 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
1700028J19RikA0A0U1RP08 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
1700028J19RikA0A0U1RP08 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
1700028J19RikA0A0U1RP08 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
1700028J19RikA0A0U1RP08 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
1700028J19RikA0A0U1RP08 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
1700028J19RikA0A0U1RP08 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
1700028J19RikA0A0U1RP08 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
1700028J19RikA0A0U1RP08 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
1700028J19RikA0A0U1RP08 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms