Protein–RNA interactions for Protein: A0A0G2JFS9

Atg4a-ps, Cysteine protease, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4a-psA0A0G2JFS9 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atg4a-psA0A0G2JFS9 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atg4a-psA0A0G2JFS9 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Atg4a-psA0A0G2JFS9 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Atg4a-psA0A0G2JFS9 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Atg4a-psA0A0G2JFS9 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Atg4a-psA0A0G2JFS9 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms