Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B5Q0

Ighv5-6, Immunoglobulin heavy variable 5-6 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ighv5-6A0A075B5Q0 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ighv5-6A0A075B5Q0 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ighv5-6A0A075B5Q0 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ighv5-6A0A075B5Q0 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ighv5-6A0A075B5Q0 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ighv5-6A0A075B5Q0 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ighv5-6A0A075B5Q0 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ighv5-6A0A075B5Q0 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ighv5-6A0A075B5Q0 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ighv5-6A0A075B5Q0 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ighv5-6A0A075B5Q0 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ighv5-6A0A075B5Q0 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ighv5-6A0A075B5Q0 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ighv5-6A0A075B5Q0 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ighv5-6A0A075B5Q0 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ighv5-6A0A075B5Q0 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ighv5-6A0A075B5Q0 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ighv5-6A0A075B5Q0 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ighv5-6A0A075B5Q0 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ighv5-6A0A075B5Q0 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ighv5-6A0A075B5Q0 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ighv5-6A0A075B5Q0 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ighv5-6A0A075B5Q0 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ighv5-6A0A075B5Q0 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ighv5-6A0A075B5Q0 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ighv5-6A0A075B5Q0 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ighv5-6A0A075B5Q0 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ighv5-6A0A075B5Q0 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ighv5-6A0A075B5Q0 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ighv5-6A0A075B5Q0 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ighv5-6A0A075B5Q0 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ighv5-6A0A075B5Q0 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ighv5-6A0A075B5Q0 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ighv5-6A0A075B5Q0 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ighv5-6A0A075B5Q0 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ighv5-6A0A075B5Q0 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ighv5-6A0A075B5Q0 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ighv5-6A0A075B5Q0 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ighv5-6A0A075B5Q0 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ighv5-6A0A075B5Q0 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ighv5-6A0A075B5Q0 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ighv5-6A0A075B5Q0 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ighv5-6A0A075B5Q0 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ighv5-6A0A075B5Q0 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ighv5-6A0A075B5Q0 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ighv5-6A0A075B5Q0 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ighv5-6A0A075B5Q0 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ighv5-6A0A075B5Q0 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ighv5-6A0A075B5Q0 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ighv5-6A0A075B5Q0 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ighv5-6A0A075B5Q0 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ighv5-6A0A075B5Q0 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ighv5-6A0A075B5Q0 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ighv5-6A0A075B5Q0 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ighv5-6A0A075B5Q0 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ighv5-6A0A075B5Q0 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ighv5-6A0A075B5Q0 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ighv5-6A0A075B5Q0 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ighv5-6A0A075B5Q0 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ighv5-6A0A075B5Q0 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ighv5-6A0A075B5Q0 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ighv5-6A0A075B5Q0 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ighv5-6A0A075B5Q0 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ighv5-6A0A075B5Q0 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ighv5-6A0A075B5Q0 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ighv5-6A0A075B5Q0 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ighv5-6A0A075B5Q0 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ighv5-6A0A075B5Q0 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ighv5-6A0A075B5Q0 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ighv5-6A0A075B5Q0 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ighv5-6A0A075B5Q0 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ighv5-6A0A075B5Q0 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ighv5-6A0A075B5Q0 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ighv5-6A0A075B5Q0 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ighv5-6A0A075B5Q0 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ighv5-6A0A075B5Q0 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ighv5-6A0A075B5Q0 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ighv5-6A0A075B5Q0 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ighv5-6A0A075B5Q0 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ighv5-6A0A075B5Q0 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ighv5-6A0A075B5Q0 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ighv5-6A0A075B5Q0 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ighv5-6A0A075B5Q0 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ighv5-6A0A075B5Q0 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ighv5-6A0A075B5Q0 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ighv5-6A0A075B5Q0 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ighv5-6A0A075B5Q0 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ighv5-6A0A075B5Q0 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ighv5-6A0A075B5Q0 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ighv5-6A0A075B5Q0 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ighv5-6A0A075B5Q0 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ighv5-6A0A075B5Q0 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ighv5-6A0A075B5Q0 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ighv5-6A0A075B5Q0 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ighv5-6A0A075B5Q0 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ighv5-6A0A075B5Q0 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ighv5-6A0A075B5Q0 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ighv5-6A0A075B5Q0 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ighv5-6A0A075B5Q0 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ighv5-6A0A075B5Q0 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms