Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B5J5

Trbv31, T cell receptor beta, variable 31, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv31A0A075B5J5 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Trbv31A0A075B5J5 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trbv31A0A075B5J5 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trbv31A0A075B5J5 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trbv31A0A075B5J5 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trbv31A0A075B5J5 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trbv31A0A075B5J5 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trbv31A0A075B5J5 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trbv31A0A075B5J5 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trbv31A0A075B5J5 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Trbv31A0A075B5J5 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Trbv31A0A075B5J5 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Trbv31A0A075B5J5 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Trbv31A0A075B5J5 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Trbv31A0A075B5J5 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trbv31A0A075B5J5 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trbv31A0A075B5J5 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trbv31A0A075B5J5 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Trbv31A0A075B5J5 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Trbv31A0A075B5J5 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trbv31A0A075B5J5 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trbv31A0A075B5J5 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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