Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUB6

Otud1, OTU domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 454 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud1Q9CUB6 4931428L18Rik-201ENSMUST00000127775 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Otud1Q9CUB6 Gm13827-201ENSMUST00000148801 372 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Otud1Q9CUB6 BC016548-202ENSMUST00000153797 805 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Otud1Q9CUB6 Gm8185-201ENSMUST00000160999 669 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Otud1Q9CUB6 Gm4141-201ENSMUST00000174364 921 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Otud1Q9CUB6 Gm4201-201ENSMUST00000174775 921 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Otud1Q9CUB6 Cdhr4-208ENSMUST00000176373 492 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Otud1Q9CUB6 Vmn1r-ps52-201ENSMUST00000177426 862 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Otud1Q9CUB6 Gm8210-201ENSMUST00000178557 483 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Otud1Q9CUB6 Gm15454-201ENSMUST00000179718 483 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Otud1Q9CUB6 Gm6291-201ENSMUST00000179994 309 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Otud1Q9CUB6 Gm27005-201ENSMUST00000182783 921 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Otud1Q9CUB6 Gm28449-201ENSMUST00000187655 506 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Otud1Q9CUB6 Mmp7-201ENSMUST00000018767 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Otud1Q9CUB6 Gm29669-201ENSMUST00000188605 881 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Otud1Q9CUB6 Gm37355-201ENSMUST00000193345 606 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Otud1Q9CUB6 Gm4430-202ENSMUST00000193902 1041 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Otud1Q9CUB6 D8Ertd738e-201ENSMUST00000019506 616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Otud1Q9CUB6 Gm43894-201ENSMUST00000203274 688 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Otud1Q9CUB6 Gm43867-201ENSMUST00000203860 525 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Otud1Q9CUB6 AC153962.2-201ENSMUST00000219417 550 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Otud1Q9CUB6 Gm35615-201ENSMUST00000221255 719 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Otud1Q9CUB6 Gm3926-201ENSMUST00000223378 1123 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Otud1Q9CUB6 AC101205.2-201ENSMUST00000226206 715 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Otud1Q9CUB6 Nsmce2-203ENSMUST00000227173 1122 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Otud1Q9CUB6 AC142266.1-201ENSMUST00000228107 415 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Otud1Q9CUB6 Cypt12-201ENSMUST00000029080 550 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Otud1Q9CUB6 Rps3a2-201ENSMUST00000074245 792 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Otud1Q9CUB6 Gm6344-201ENSMUST00000075962 483 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Otud1Q9CUB6 Vmn1r6-201ENSMUST00000079669 1058 ntAPPRIS P2 BASIC10□□□□□ -0.81
Otud1Q9CUB6 Zfp609-201ENSMUST00000159109 7777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Otud1Q9CUB6 Morf4l2-201ENSMUST00000033797 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Otud1Q9CUB6 Pole-202ENSMUST00000112481 1523 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Otud1Q9CUB6 Frmd4b-201ENSMUST00000032146 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Otud1Q9CUB6 Cep70-207ENSMUST00000190715 1768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Otud1Q9CUB6 Mut-201ENSMUST00000169611 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Otud1Q9CUB6 Prpf6-203ENSMUST00000136481 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Otud1Q9CUB6 Snd1-206ENSMUST00000167201 3781 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Otud1Q9CUB6 Acin1-203ENSMUST00000111484 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Otud1Q9CUB6 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Otud1Q9CUB6 Micalcl-203ENSMUST00000106645 2309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Otud1Q9CUB6 Gm6124-201ENSMUST00000188240 2580 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Otud1Q9CUB6 Bzw2-201ENSMUST00000020856 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Otud1Q9CUB6 Scn10a-204ENSMUST00000214408 5877 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Otud1Q9CUB6 Arl14ep-202ENSMUST00000093883 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Otud1Q9CUB6 Tpd52-202ENSMUST00000091354 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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Otud1Q9CUB6 Gm5472-201ENSMUST00000178604 1678 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Otud1Q9CUB6 Slc10a1-201ENSMUST00000095572 1674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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Otud1Q9CUB6 Asb11-202ENSMUST00000036858 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Otud1Q9CUB6 Arl6ip5-201ENSMUST00000044681 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Otud1Q9CUB6 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Otud1Q9CUB6 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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Otud1Q9CUB6 Ets2-201ENSMUST00000023612 3890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Otud1Q9CUB6 Mapre2-203ENSMUST00000118826 3052 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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Otud1Q9CUB6 Adam8-201ENSMUST00000026546 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Otud1Q9CUB6 C130021I20Rik-201ENSMUST00000147294 3693 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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Otud1Q9CUB6 Cntnap2-201ENSMUST00000060839 1540 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Otud1Q9CUB6 Ap4m1-201ENSMUST00000019662 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Otud1Q9CUB6 Gnl2-201ENSMUST00000030684 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Otud1Q9CUB6 Mettl8-201ENSMUST00000090849 1842 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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Otud1Q9CUB6 Mid1-ps1-201ENSMUST00000167967 1248 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Otud1Q9CUB6 Gast-201ENSMUST00000017309 460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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Otud1Q9CUB6 Milr1-206ENSMUST00000182896 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Otud1Q9CUB6 Milr1-207ENSMUST00000182908 811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Otud1Q9CUB6 2610016A17Rik-201ENSMUST00000185211 474 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Otud1Q9CUB6 Gm29543-201ENSMUST00000188138 967 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
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Otud1Q9CUB6 Gm38047-201ENSMUST00000193690 1133 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Otud1Q9CUB6 Gm38233-201ENSMUST00000194259 807 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Otud1Q9CUB6 Gm42617-201ENSMUST00000197640 1229 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Otud1Q9CUB6 Gm18748-201ENSMUST00000198507 622 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Otud1Q9CUB6 Gm3527-201ENSMUST00000198905 460 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Otud1Q9CUB6 Pcdh7-207ENSMUST00000199310 659 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Otud1Q9CUB6 Fxyd1-214ENSMUST00000206328 545 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Otud1Q9CUB6 Gm45604-201ENSMUST00000209665 550 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Otud1Q9CUB6 Gm18996-201ENSMUST00000214851 755 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Otud1Q9CUB6 AC123830.1-201ENSMUST00000217156 609 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Otud1Q9CUB6 AC123735.1-201ENSMUST00000227358 605 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Otud1Q9CUB6 1700047G03Rik-205ENSMUST00000227822 1048 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Otud1Q9CUB6 Krtap2-4-201ENSMUST00000074926 828 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Otud1Q9CUB6 Olfr510-201ENSMUST00000076289 945 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Otud1Q9CUB6 V1ra8-201ENSMUST00000078371 890 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Otud1Q9CUB6 Vmn1r212-201ENSMUST00000095960 1164 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Otud1Q9CUB6 Gm10580-201ENSMUST00000097985 396 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Otud1Q9CUB6 Gm10582-201ENSMUST00000097987 396 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
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