Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Lmo3-207ENSMUST00000163065 2425 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2-Eb1P04230 Serpinb6b-203ENSMUST00000164541 1719 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2-Eb1P04230 Gm42714-201ENSMUST00000202063 1364 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
H2-Eb1P04230 Mia3-202ENSMUST00000109158 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2-Eb1P04230 Gm14705-201ENSMUST00000154109 1824 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2-Eb1P04230 Slc1a2-202ENSMUST00000080210 11595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2-Eb1P04230 Pax5-202ENSMUST00000102932 1460 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2-Eb1P04230 Efna1-201ENSMUST00000029566 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2-Eb1P04230 Micalcl-202ENSMUST00000051308 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2-Eb1P04230 Zfp58-201ENSMUST00000076123 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2-Eb1P04230 Mbd1-201ENSMUST00000097530 2833 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2-Eb1P04230 Gpr75-201ENSMUST00000109430 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2-Eb1P04230 Gm26673-201ENSMUST00000181126 3377 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2-Eb1P04230 Rsrc2-208ENSMUST00000182309 1595 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2-Eb1P04230 CT010575.1-201ENSMUST00000220666 2924 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2-Eb1P04230 Prim1-201ENSMUST00000026461 1583 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2-Eb1P04230 Gm26797-202ENSMUST00000213132 2562 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2-Eb1P04230 Hdac9-208ENSMUST00000211107 1683 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2-Eb1P04230 Hmgcll1-205ENSMUST00000183425 3239 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2-Eb1P04230 Slc17a3-203ENSMUST00000110422 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2-Eb1P04230 Vipas39-203ENSMUST00000179379 2418 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2-Eb1P04230 Edil3-201ENSMUST00000043111 5156 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2-Eb1P04230 Actbl2-201ENSMUST00000054716 2737 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2-Eb1P04230 Cfap61-204ENSMUST00000126415 2256 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2-Eb1P04230 Gm26911-201ENSMUST00000181770 1737 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2-Eb1P04230 Gm43064-201ENSMUST00000199710 3144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2-Eb1P04230 Nectin4-203ENSMUST00000111286 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2-Eb1P04230 Cd22-213ENSMUST00000190617 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2-Eb1P04230 Slc25a14-204ENSMUST00000134257 1805 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2-Eb1P04230 Tuft1-204ENSMUST00000196733 2555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2-Eb1P04230 Gm34923-201ENSMUST00000222673 5043 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2-Eb1P04230 Ywhag-201ENSMUST00000055808 3520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2-Eb1P04230 Gm22937-201ENSMUST00000103954 131 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
H2-Eb1P04230 Gm11235-201ENSMUST00000117763 333 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
H2-Eb1P04230 Rhox3d-ps-201ENSMUST00000119181 825 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
H2-Eb1P04230 Gm20822-201ENSMUST00000165756 687 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2-Eb1P04230 Gm20828-201ENSMUST00000170889 687 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2-Eb1P04230 Gm7696-201ENSMUST00000174727 907 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
H2-Eb1P04230 Pkib-204ENSMUST00000175852 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2-Eb1P04230 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
H2-Eb1P04230 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
H2-Eb1P04230 Gm43480-201ENSMUST00000201201 416 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
H2-Eb1P04230 Gm44709-201ENSMUST00000207649 448 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2-Eb1P04230 Gm6518-201ENSMUST00000208450 342 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
H2-Eb1P04230 Gm3912-202ENSMUST00000210164 643 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2-Eb1P04230 Nosip-207ENSMUST00000210520 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2-Eb1P04230 AC153363.1-201ENSMUST00000213572 359 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
H2-Eb1P04230 AL672010.1-201ENSMUST00000215182 1246 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
H2-Eb1P04230 Gm5805-201ENSMUST00000072779 456 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
H2-Eb1P04230 Mapk1ip1-202ENSMUST00000118810 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2-Eb1P04230 Olfr30-202ENSMUST00000215691 2404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2-Eb1P04230 Trim9-211ENSMUST00000223160 3574 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2-Eb1P04230 9130221F21Rik-201ENSMUST00000206867 2631 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2-Eb1P04230 Gm15947-201ENSMUST00000161395 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2-Eb1P04230 CT009601.1-201ENSMUST00000225567 2705 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
H2-Eb1P04230 Tcn2-202ENSMUST00000109988 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2-Eb1P04230 Anxa6-202ENSMUST00000108883 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2-Eb1P04230 2700049A03Rik-203ENSMUST00000149564 5763 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2-Eb1P04230 Ccdc138-201ENSMUST00000036576 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2-Eb1P04230 Plec-217ENSMUST00000169438 14827 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2-Eb1P04230 Fndc7-202ENSMUST00000102620 3477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2-Eb1P04230 Ribc1-201ENSMUST00000026288 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
H2-Eb1P04230 Gm42731-201ENSMUST00000201839 1641 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
H2-Eb1P04230 Zfp780b-201ENSMUST00000081618 3004 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
H2-Eb1P04230 Zmpste24-201ENSMUST00000058754 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
H2-Eb1P04230 Sap130-202ENSMUST00000178164 4030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
H2-Eb1P04230 Trpm2-203ENSMUST00000105401 7274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
H2-Eb1P04230 Gm19972-201ENSMUST00000218180 5664 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
H2-Eb1P04230 Dhx30-219ENSMUST00000199529 4373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
H2-Eb1P04230 Heatr6-201ENSMUST00000001002 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
H2-Eb1P04230 Gm37608-201ENSMUST00000195696 1880 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
H2-Eb1P04230 Bcl2l14-202ENSMUST00000111960 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
H2-Eb1P04230 Tmbim7-201ENSMUST00000014673 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
H2-Eb1P04230 Gm37125-201ENSMUST00000195877 1559 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
H2-Eb1P04230 4930556L07Rik-201ENSMUST00000134422 1490 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
H2-Eb1P04230 Defb48-201ENSMUST00000100493 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
H2-Eb1P04230 Rab29-202ENSMUST00000112386 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
H2-Eb1P04230 Vbp1-202ENSMUST00000114070 632 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
H2-Eb1P04230 Ywhaq-ps2-201ENSMUST00000117738 643 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
H2-Eb1P04230 Gm25288-201ENSMUST00000122800 265 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
H2-Eb1P04230 Gm12682-201ENSMUST00000144637 1081 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
H2-Eb1P04230 Gm16547-201ENSMUST00000159474 293 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
H2-Eb1P04230 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
H2-Eb1P04230 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
H2-Eb1P04230 Gm43969-201ENSMUST00000204833 535 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
H2-Eb1P04230 Gm34655-202ENSMUST00000215259 877 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
H2-Eb1P04230 Gstz1-203ENSMUST00000220574 971 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
H2-Eb1P04230 AC141884.2-201ENSMUST00000228811 775 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
H2-Eb1P04230 Sapcd1-201ENSMUST00000040151 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
H2-Eb1P04230 Ifne-201ENSMUST00000056014 664 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
H2-Eb1P04230 Lxn-201ENSMUST00000058981 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
H2-Eb1P04230 Crip1-201ENSMUST00000006523 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
H2-Eb1P04230 Ccdc30-203ENSMUST00000084307 989 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
H2-Eb1P04230 Mrps14-202ENSMUST00000097193 787 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
H2-Eb1P04230 Olfr1229-201ENSMUST00000099788 1019 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
H2-Eb1P04230 Dpy19l2-201ENSMUST00000133010 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
H2-Eb1P04230 Mir9-3hg-202ENSMUST00000181511 3412 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
H2-Eb1P04230 Gsdme-203ENSMUST00000165099 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
H2-Eb1P04230 Sap18-204ENSMUST00000128764 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
H2-Eb1P04230 Adat1-201ENSMUST00000034427 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.8 ms