Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Aebp2-201ENSMUST00000032359 5932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Ccl20O89093 Acsm2-201ENSMUST00000084647 2051 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Ccl20O89093 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Ccl20O89093 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
Ccl20O89093 Gm5555-201ENSMUST00000120352 1111 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
Ccl20O89093 Gm4879-201ENSMUST00000122190 1272 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
Ccl20O89093 Fam187b-203ENSMUST00000129773 1213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Ccl20O89093 Aif1l-207ENSMUST00000148056 670 ntTSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Ccl20O89093 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Ccl20O89093 Gm45716-203ENSMUST00000153734 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Ccl20O89093 Gm16574-201ENSMUST00000159301 745 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
Ccl20O89093 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
Ccl20O89093 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
Ccl20O89093 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
Ccl20O89093 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
Ccl20O89093 AC238811.4-201ENSMUST00000178019 1246 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
Ccl20O89093 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
Ccl20O89093 AC238940.3-201ENSMUST00000178830 1246 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
Ccl20O89093 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
Ccl20O89093 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
Ccl20O89093 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
Ccl20O89093 Mir8111-201ENSMUST00000184463 137 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
Ccl20O89093 Psmb6-ps2-201ENSMUST00000187074 705 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
Ccl20O89093 Gm29135-201ENSMUST00000188411 612 ntTSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Ccl20O89093 Gm42518-201ENSMUST00000196277 938 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
Ccl20O89093 Gm42617-201ENSMUST00000197640 1229 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
Ccl20O89093 E230014E18Rik-201ENSMUST00000215920 859 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Ccl20O89093 Gm34983-202ENSMUST00000220432 494 ntTSL 3 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Ccl20O89093 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Ccl20O89093 Sh2d6-201ENSMUST00000089687 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Ccl20O89093 Gm17644-201ENSMUST00000181272 3200 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Ccl20O89093 Qars-201ENSMUST00000006838 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Ccl20O89093 Mbd1-201ENSMUST00000097530 2833 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Ccl20O89093 Abcc4-202ENSMUST00000166646 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Ccl20O89093 Atp10d-202ENSMUST00000126664 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Ccl20O89093 Gm10406-201ENSMUST00000100895 1813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Ccl20O89093 Polr3f-202ENSMUST00000110017 1632 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Ccl20O89093 Tnfaip1-201ENSMUST00000017759 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Ccl20O89093 Snx6-204ENSMUST00000218934 1441 ntTSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Ccl20O89093 D030018L15Rik-203ENSMUST00000140253 2902 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Ccl20O89093 Trim61-201ENSMUST00000078409 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
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Ccl20O89093 Zbtb43-201ENSMUST00000028125 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Ccl20O89093 Dysf-215ENSMUST00000204591 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Ccl20O89093 Platr9-202ENSMUST00000149572 1556 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
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Ccl20O89093 Rnf13-201ENSMUST00000041826 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Ccl20O89093 Zfr-201ENSMUST00000122941 4850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Ccl20O89093 Olfr77-202ENSMUST00000217347 5980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Ccl20O89093 Htr1a-201ENSMUST00000022235 4484 ntAPPRIS P1 BASIC8.86□□□□□ -0.99
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Ccl20O89093 Fbxo34-204ENSMUST00000165714 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Ccl20O89093 Rpl4-201ENSMUST00000034966 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Ccl20O89093 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
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Ccl20O89093 Chac2-202ENSMUST00000101394 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Ccl20O89093 Dubr-202ENSMUST00000186535 2896 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
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Ccl20O89093 AC160060.1-201ENSMUST00000217840 1813 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
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Ccl20O89093 Scmh1-203ENSMUST00000106298 1995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Ccl20O89093 Gm44570-201ENSMUST00000207526 3698 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
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Ccl20O89093 A1cf-201ENSMUST00000075838 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
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Ccl20O89093 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Ccl20O89093 Arhgap26-216ENSMUST00000155576 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Ccl20O89093 Nedd4-201ENSMUST00000034740 5499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Ccl20O89093 Rab11fip3-201ENSMUST00000118828 3271 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Ccl20O89093 Slc2a1-201ENSMUST00000030398 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Ccl20O89093 Spag6l-201ENSMUST00000023468 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Ccl20O89093 Gsdme-203ENSMUST00000165099 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Ccl20O89093 Dhrs7b-201ENSMUST00000042281 1553 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Ccl20O89093 Mthfd1-201ENSMUST00000021443 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Ccl20O89093 CT009601.1-201ENSMUST00000225567 2705 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Ccl20O89093 Gm8036-201ENSMUST00000118089 1718 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Ccl20O89093 Zfp58-201ENSMUST00000076123 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Ccl20O89093 Tmco3-201ENSMUST00000045229 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Ccl20O89093 Rtbdn-202ENSMUST00000109740 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Ccl20O89093 Kdm2b-205ENSMUST00000121739 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Ccl20O89093 Ctss-201ENSMUST00000015667 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Ccl20O89093 Epha6-203ENSMUST00000161358 1356 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Ccl20O89093 Slco5a1-206ENSMUST00000147606 3615 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Ccl20O89093 4930511J24Rik-201ENSMUST00000223541 1528 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Ccl20O89093 Siglech-203ENSMUST00000121492 1655 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Ccl20O89093 Cyp2d9-201ENSMUST00000089129 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Ccl20O89093 AU018091-201ENSMUST00000171749 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
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