Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDV6

Ccdc63, Coiled-coil domain-containing protein 63, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc63Q8CDV6 AC156802.2-203ENSMUST00000226032 1906 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccdc63Q8CDV6 Celf2-211ENSMUST00000142941 2338 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccdc63Q8CDV6 Ccdc186-202ENSMUST00000118592 6445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccdc63Q8CDV6 Slc37a4-202ENSMUST00000213268 1353 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccdc63Q8CDV6 Lims1-201ENSMUST00000020077 1565 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccdc63Q8CDV6 Trpm1-201ENSMUST00000085222 5711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccdc63Q8CDV6 Aplp2-201ENSMUST00000072634 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccdc63Q8CDV6 Gm16478-201ENSMUST00000208113 5084 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccdc63Q8CDV6 Trim13-202ENSMUST00000165015 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccdc63Q8CDV6 Exosc1-201ENSMUST00000075280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccdc63Q8CDV6 Wdr62-201ENSMUST00000108190 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccdc63Q8CDV6 Oas3-201ENSMUST00000044833 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccdc63Q8CDV6 Fam122b-201ENSMUST00000071023 4334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccdc63Q8CDV6 Gulo-201ENSMUST00000059970 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccdc63Q8CDV6 Ptchd4-201ENSMUST00000048691 6890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccdc63Q8CDV6 Nmrk2-201ENSMUST00000005069 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccdc63Q8CDV6 Ptpn7-202ENSMUST00000167080 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccdc63Q8CDV6 Plec-215ENSMUST00000169108 14853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccdc63Q8CDV6 Robo4-203ENSMUST00000115048 3392 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccdc63Q8CDV6 Gm24470-201ENSMUST00000104486 132 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccdc63Q8CDV6 Vbp1-202ENSMUST00000114070 632 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccdc63Q8CDV6 Ywhaq-ps2-201ENSMUST00000117738 643 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccdc63Q8CDV6 Ifitm7-201ENSMUST00000117803 853 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccdc63Q8CDV6 Gm25288-201ENSMUST00000122800 265 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccdc63Q8CDV6 Pradc1-204ENSMUST00000126805 953 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccdc63Q8CDV6 Adora3-202ENSMUST00000164730 1219 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccdc63Q8CDV6 Gm20714-202ENSMUST00000176436 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccdc63Q8CDV6 Rwdd2a-202ENSMUST00000179212 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccdc63Q8CDV6 Gm20821-202ENSMUST00000180352 684 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccdc63Q8CDV6 Gm28671-201ENSMUST00000187036 692 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccdc63Q8CDV6 Gm18182-201ENSMUST00000191380 1251 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccdc63Q8CDV6 Gm43249-201ENSMUST00000200464 458 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccdc63Q8CDV6 Gm6423-201ENSMUST00000204315 934 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccdc63Q8CDV6 Gm43969-201ENSMUST00000204833 535 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccdc63Q8CDV6 Stt3a-209ENSMUST00000217599 285 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccdc63Q8CDV6 AI463170-202ENSMUST00000218453 558 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccdc63Q8CDV6 AC154585.1-201ENSMUST00000218917 997 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccdc63Q8CDV6 Ap3s1-202ENSMUST00000224622 978 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccdc63Q8CDV6 AC134860.5-201ENSMUST00000225071 1249 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccdc63Q8CDV6 Eny2-204ENSMUST00000226827 558 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccdc63Q8CDV6 AC102523.2-201ENSMUST00000227813 983 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccdc63Q8CDV6 AC141884.2-201ENSMUST00000228811 775 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccdc63Q8CDV6 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccdc63Q8CDV6 Calm4-201ENSMUST00000042219 917 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccdc63Q8CDV6 4930533K18Rik-201ENSMUST00000058942 1259 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccdc63Q8CDV6 Casz1-201ENSMUST00000094464 4349 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccdc63Q8CDV6 Tmem130-201ENSMUST00000061446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccdc63Q8CDV6 Ptpn21-201ENSMUST00000085116 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccdc63Q8CDV6 Gm7967-202ENSMUST00000191042 5042 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccdc63Q8CDV6 Nadsyn1-201ENSMUST00000033415 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccdc63Q8CDV6 Loxl4-201ENSMUST00000026190 3738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccdc63Q8CDV6 Rasgrp4-201ENSMUST00000032811 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccdc63Q8CDV6 Rasgrp4-202ENSMUST00000094617 4617 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccdc63Q8CDV6 C86187-202ENSMUST00000209497 2415 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccdc63Q8CDV6 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccdc63Q8CDV6 Slc7a9-203ENSMUST00000118969 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccdc63Q8CDV6 Gm36426-201ENSMUST00000222903 1795 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccdc63Q8CDV6 Nfyc-204ENSMUST00000120779 2006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccdc63Q8CDV6 Cxcl12-201ENSMUST00000073043 5627 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccdc63Q8CDV6 Srp54a-207ENSMUST00000110708 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccdc63Q8CDV6 Actl9-201ENSMUST00000174088 1373 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccdc63Q8CDV6 Mettl8-204ENSMUST00000112186 2347 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccdc63Q8CDV6 Gm28988-201ENSMUST00000191363 1897 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccdc63Q8CDV6 Gtf2i-223ENSMUST00000174513 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccdc63Q8CDV6 Acnat1-202ENSMUST00000107697 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccdc63Q8CDV6 Snx6-204ENSMUST00000218934 1441 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccdc63Q8CDV6 Nipal3-202ENSMUST00000105856 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccdc63Q8CDV6 Gm26724-201ENSMUST00000180434 1650 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccdc63Q8CDV6 Inhbe-201ENSMUST00000059718 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccdc63Q8CDV6 Spats2l-206ENSMUST00000167085 3929 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccdc63Q8CDV6 Efna1-201ENSMUST00000029566 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccdc63Q8CDV6 Slc24a1-201ENSMUST00000037798 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccdc63Q8CDV6 Tcaf1-201ENSMUST00000045054 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccdc63Q8CDV6 4930538E20Rik-201ENSMUST00000131383 546 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccdc63Q8CDV6 Lsm6-204ENSMUST00000146824 541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccdc63Q8CDV6 Gm12056-201ENSMUST00000148364 1257 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccdc63Q8CDV6 Rsph14-206ENSMUST00000166088 1203 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccdc63Q8CDV6 Gm17782-201ENSMUST00000174345 880 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccdc63Q8CDV6 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccdc63Q8CDV6 Gm28916-201ENSMUST00000186988 699 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccdc63Q8CDV6 Gm9515-201ENSMUST00000200276 647 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccdc63Q8CDV6 Gm6342-201ENSMUST00000204344 766 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccdc63Q8CDV6 Gm45349-201ENSMUST00000210285 1074 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccdc63Q8CDV6 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccdc63Q8CDV6 Tspo2-201ENSMUST00000024794 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccdc63Q8CDV6 Ifne-201ENSMUST00000056014 664 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccdc63Q8CDV6 Sh2d6-201ENSMUST00000089687 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccdc63Q8CDV6 Rsph14-201ENSMUST00000009214 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccdc63Q8CDV6 Aven-202ENSMUST00000099588 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccdc63Q8CDV6 Daam2-201ENSMUST00000057610 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccdc63Q8CDV6 Nox1-204ENSMUST00000159259 1581 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccdc63Q8CDV6 Mlph-201ENSMUST00000027528 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccdc63Q8CDV6 Apobec1-201ENSMUST00000112585 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccdc63Q8CDV6 Nctc1-202ENSMUST00000132167 2104 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccdc63Q8CDV6 Msln-201ENSMUST00000075884 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccdc63Q8CDV6 Gpr75-201ENSMUST00000109430 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccdc63Q8CDV6 Wdr35-201ENSMUST00000085745 4501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccdc63Q8CDV6 Stxbp5l-203ENSMUST00000114780 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccdc63Q8CDV6 N6amt1-204ENSMUST00000120284 3473 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccdc63Q8CDV6 D630003M21Rik-203ENSMUST00000169335 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
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