Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Nxpe1-ps-201ENSMUST00000209981 1454 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Spesp1-201ENSMUST00000056949 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Pa2g4-202ENSMUST00000131728 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Gm22751-201ENSMUST00000102077 109 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Mir692-3-201ENSMUST00000102079 109 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Mir692-2-201ENSMUST00000102081 109 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Gstm6-204ENSMUST00000106684 1179 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Slc45a1-202ENSMUST00000117997 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 4930533B01Rik-201ENSMUST00000123377 1029 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Marcksl1-ps4-201ENSMUST00000132531 291 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Gm7583-201ENSMUST00000182941 1005 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 1700001J11Rik-201ENSMUST00000185917 759 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Gm8384-201ENSMUST00000190905 704 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 1700012J22Rik-201ENSMUST00000193492 830 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Gm37688-201ENSMUST00000195195 465 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Gm8643-201ENSMUST00000195228 625 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Gm45276-201ENSMUST00000209549 1086 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Gm19121-201ENSMUST00000215720 1022 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Gm7242-201ENSMUST00000221134 705 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Gm36495-201ENSMUST00000221201 684 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 CT030035.1-201ENSMUST00000223964 935 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Ssna1-201ENSMUST00000028342 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Klk1b22-201ENSMUST00000077528 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Ube2l3-201ENSMUST00000090192 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Fhad1-203ENSMUST00000105780 4809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Med17-201ENSMUST00000034411 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Gsg1-204ENSMUST00000111911 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Aldh1a3-201ENSMUST00000015278 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Lpin1-201ENSMUST00000067124 5581 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 9330175E14Rik-201ENSMUST00000180445 4852 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Stox2-206ENSMUST00000210030 2734 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Ank1-205ENSMUST00000117296 6794 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Rpe65-202ENSMUST00000196999 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Armc8-202ENSMUST00000185524 2820 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Egfr-201ENSMUST00000020329 10208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Grip1-216ENSMUST00000154238 2482 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Prl8a1-202ENSMUST00000095926 1682 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Dph5-202ENSMUST00000106505 1836 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Gm19557-201ENSMUST00000182109 2765 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Slc7a4-201ENSMUST00000063544 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 AC140462.2-201ENSMUST00000225718 2433 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Gtf2ird1-204ENSMUST00000100652 3693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Spata17-201ENSMUST00000027908 1303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Mblac2-201ENSMUST00000057598 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Btbd7-206ENSMUST00000223554 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Gm5434-202ENSMUST00000222384 1451 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Gm5434-201ENSMUST00000071825 1451 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 4933439C10Rik-203ENSMUST00000132226 3184 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Zfp42-201ENSMUST00000082120 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Pcdhb2-201ENSMUST00000056522 2813 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Gm24933-201ENSMUST00000103762 110 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Gm23252-201ENSMUST00000103776 110 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Gm23595-201ENSMUST00000104306 130 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Rxfp2-202ENSMUST00000110496 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Gm20815-201ENSMUST00000115496 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Pex13-ps-201ENSMUST00000118184 1157 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Gm13498-201ENSMUST00000119159 2166 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Gm15982-201ENSMUST00000121681 554 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Gm12035-201ENSMUST00000121890 623 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 3110039M20Rik-201ENSMUST00000127041 868 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
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Dsg1bQ7TSF1 Stamos-201ENSMUST00000152524 801 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Spef2-203ENSMUST00000159368 1422 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Psme1-208ENSMUST00000174259 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
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Dsg1bQ7TSF1 Slitrk3-202ENSMUST00000192477 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
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Dsg1bQ7TSF1 BC049987-201ENSMUST00000213859 918 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 AC122367.1-201ENSMUST00000221978 1709 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 AC132881.2-201ENSMUST00000225474 709 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
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Dsg1bQ7TSF1 Slfn1-201ENSMUST00000037994 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
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Dsg1bQ7TSF1 Flicr-201ENSMUST00000144719 3455 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Klf10-203ENSMUST00000227920 2144 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Trim61-201ENSMUST00000078409 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Bace2-201ENSMUST00000047275 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Hivep2-204ENSMUST00000187083 9268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Sfmbt2-202ENSMUST00000114861 1813 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Arpp21-217ENSMUST00000161412 1687 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Epha6-203ENSMUST00000161358 1356 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 AC122382.1-201ENSMUST00000225869 2371 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Rpap2-204ENSMUST00000112654 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Atf3-203ENSMUST00000195117 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Srrm4-202ENSMUST00000139425 2798 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Rasgrp1-204ENSMUST00000173252 1750 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Pou1f1-201ENSMUST00000004964 1773 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Gm42731-201ENSMUST00000201839 1641 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Lrtm2-204ENSMUST00000168793 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms