Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 AC117769.1-201ENSMUST00000224716 1120 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SbdsP70122 Gm43305-202ENSMUST00000225083 705 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SbdsP70122 Slc18a2-201ENSMUST00000026084 3803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SbdsP70122 Rab29-201ENSMUST00000027693 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SbdsP70122 H2-Aa-201ENSMUST00000040655 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SbdsP70122 Gm16380-201ENSMUST00000077997 478 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SbdsP70122 Pde11a-201ENSMUST00000099992 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SbdsP70122 4930480K15Rik-201ENSMUST00000162121 2199 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SbdsP70122 Pms1-201ENSMUST00000027267 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SbdsP70122 Pfkm-201ENSMUST00000051226 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SbdsP70122 Zbtb34-202ENSMUST00000113158 6602 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SbdsP70122 Crispld1-201ENSMUST00000095075 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SbdsP70122 Ddo-201ENSMUST00000019977 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SbdsP70122 Atf3-203ENSMUST00000195117 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SbdsP70122 Six6-201ENSMUST00000021519 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SbdsP70122 Itga7-202ENSMUST00000218290 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SbdsP70122 Zfp275-202ENSMUST00000114499 6284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SbdsP70122 Acp1-202ENSMUST00000074038 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SbdsP70122 Zfp710-203ENSMUST00000166250 3606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SbdsP70122 Plekhb2-203ENSMUST00000156687 5176 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SbdsP70122 Srd5a3-203ENSMUST00000113507 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SbdsP70122 Pex3-207ENSMUST00000170376 1381 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SbdsP70122 Fbp2-201ENSMUST00000021907 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SbdsP70122 Sfi1-218ENSMUST00000153425 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SbdsP70122 Gm19611-201ENSMUST00000216401 1865 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SbdsP70122 CT033774.1-201ENSMUST00000223084 2394 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SbdsP70122 Tiam1-201ENSMUST00000002588 7290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SbdsP70122 Clcn1-201ENSMUST00000031894 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SbdsP70122 Sdhc-202ENSMUST00000111336 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SbdsP70122 Tia1-202ENSMUST00000095753 4477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SbdsP70122 Ndufaf1-203ENSMUST00000110802 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SbdsP70122 Ank3-237ENSMUST00000183074 4948 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SbdsP70122 Cldn12-207ENSMUST00000179804 3752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SbdsP70122 Tnr-201ENSMUST00000111669 4424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SbdsP70122 Gm10603-201ENSMUST00000183512 2279 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SbdsP70122 Cfb-201ENSMUST00000025229 2737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SbdsP70122 Gabrb3-206ENSMUST00000196198 4348 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SbdsP70122 Bri3-202ENSMUST00000110695 669 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SbdsP70122 Styxl1-203ENSMUST00000111162 726 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SbdsP70122 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
SbdsP70122 1810058I24Rik-201ENSMUST00000130875 690 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SbdsP70122 Gm45716-203ENSMUST00000153734 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SbdsP70122 Gm15641-201ENSMUST00000161407 670 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SbdsP70122 Psmb6-ps2-201ENSMUST00000187074 705 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
SbdsP70122 Gm7539-201ENSMUST00000189789 630 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
SbdsP70122 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SbdsP70122 Gm37723-201ENSMUST00000194480 565 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
SbdsP70122 Fcer2a-205ENSMUST00000208145 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SbdsP70122 Gm45363-201ENSMUST00000210196 1294 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
SbdsP70122 1110019B22Rik-202ENSMUST00000218396 989 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SbdsP70122 AC154407.1-201ENSMUST00000226777 526 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
SbdsP70122 Gm26670-202ENSMUST00000226862 340 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
SbdsP70122 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SbdsP70122 Spata46-201ENSMUST00000056991 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SbdsP70122 Taar7a-201ENSMUST00000078532 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SbdsP70122 Taar7b-201ENSMUST00000092658 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SbdsP70122 Alms1-201ENSMUST00000072018 9986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SbdsP70122 Gpr143-201ENSMUST00000026383 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SbdsP70122 Cyp51-201ENSMUST00000001507 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SbdsP70122 Ptgs2os2-201ENSMUST00000181308 1745 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SbdsP70122 Ubap2-201ENSMUST00000030143 4368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SbdsP70122 Adamts6-201ENSMUST00000065766 4822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SbdsP70122 Ido2-201ENSMUST00000121992 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SbdsP70122 Srgap2-204ENSMUST00000186543 3533 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SbdsP70122 Itgad-201ENSMUST00000033051 3965 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SbdsP70122 Dcun1d4-201ENSMUST00000063882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SbdsP70122 Rpl4-201ENSMUST00000034966 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SbdsP70122 Zmat2-201ENSMUST00000001419 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SbdsP70122 Kidins220-202ENSMUST00000220459 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SbdsP70122 Cux1-211ENSMUST00000176745 2831 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SbdsP70122 Helz2-201ENSMUST00000094203 9162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SbdsP70122 Myc-204ENSMUST00000160009 1765 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SbdsP70122 Slc13a5-206ENSMUST00000208912 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SbdsP70122 Als2cr12-206ENSMUST00000191565 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SbdsP70122 Aurkc-203ENSMUST00000207711 1320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SbdsP70122 Anapc1-201ENSMUST00000014499 8942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SbdsP70122 1700030K09Rik-201ENSMUST00000064853 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SbdsP70122 Tstd2-202ENSMUST00000107772 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SbdsP70122 Sgo2b-201ENSMUST00000179944 3739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SbdsP70122 Il6st-210ENSMUST00000184949 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SbdsP70122 Klf8-201ENSMUST00000039545 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SbdsP70122 Fbxo32-201ENSMUST00000022986 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SbdsP70122 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SbdsP70122 Gm14234-201ENSMUST00000119539 845 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
SbdsP70122 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SbdsP70122 Gm16322-202ENSMUST00000141275 700 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SbdsP70122 Gm12737-201ENSMUST00000142835 725 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SbdsP70122 Ptgds-201ENSMUST00000015234 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SbdsP70122 Zfp667-204ENSMUST00000153840 596 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SbdsP70122 Erg-209ENSMUST00000177450 1280 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SbdsP70122 Gm9146-201ENSMUST00000182254 1006 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
SbdsP70122 Gm29157-201ENSMUST00000188753 612 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
SbdsP70122 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
SbdsP70122 Gm42493-201ENSMUST00000197559 1121 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SbdsP70122 Gm43821-201ENSMUST00000199198 729 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SbdsP70122 Gm43460-201ENSMUST00000202491 1057 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
SbdsP70122 Gm44196-203ENSMUST00000204359 1190 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SbdsP70122 AI463170-201ENSMUST00000217839 970 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
SbdsP70122 AC155300.1-201ENSMUST00000219134 480 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
SbdsP70122 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
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