Protein–RNA interactions for Protein: P17208

Pou4f1, POU domain, class 4, transcription factor 1, mousemouse

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Length 421 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou4f1P17208 Ido2-201ENSMUST00000121992 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Pou4f1P17208 Gm14126-201ENSMUST00000122345 395 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Pou4f1P17208 Gm13981-201ENSMUST00000122360 447 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Pou4f1P17208 Gm28037-201ENSMUST00000122365 611 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Pou4f1P17208 9230111E07Rik-201ENSMUST00000124850 811 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Pou4f1P17208 Hmgn2-208ENSMUST00000136327 772 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Pou4f1P17208 Gm16441-201ENSMUST00000138176 924 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Pou4f1P17208 Rnasek-203ENSMUST00000141880 465 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Pou4f1P17208 Gm13802-201ENSMUST00000150159 663 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Pou4f1P17208 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Pou4f1P17208 Gm6038-201ENSMUST00000154310 948 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Pou4f1P17208 Gm13938-201ENSMUST00000156809 493 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Pou4f1P17208 Gm17192-201ENSMUST00000169031 511 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Pou4f1P17208 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Pou4f1P17208 Gm27203-201ENSMUST00000183677 307 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Pou4f1P17208 Gm29200-201ENSMUST00000188118 1085 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Pou4f1P17208 Adh6-ps1-202ENSMUST00000196293 754 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Pou4f1P17208 4930573C15Rik-201ENSMUST00000197707 777 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Pou4f1P17208 4930431F10Rik-201ENSMUST00000213122 1157 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Pou4f1P17208 Gm9487-201ENSMUST00000216600 472 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Pou4f1P17208 1110019B22Rik-202ENSMUST00000218396 989 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Pou4f1P17208 Gm43305-202ENSMUST00000225083 705 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Pou4f1P17208 AC119177.2-201ENSMUST00000226699 629 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Pou4f1P17208 AC164883.7-201ENSMUST00000228534 851 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Pou4f1P17208 Riok3-201ENSMUST00000025270 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Pou4f1P17208 Bub1b-201ENSMUST00000038341 3668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Pou4f1P17208 Hils1-201ENSMUST00000038928 864 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Pou4f1P17208 Rbm8a-201ENSMUST00000048915 2608 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Pou4f1P17208 Gm16380-201ENSMUST00000077997 478 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Pou4f1P17208 Snu13-202ENSMUST00000080622 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Pou4f1P17208 n-R5s185-201ENSMUST00000083953 119 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Pou4f1P17208 Nlrc5-202ENSMUST00000098489 1721 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Pou4f1P17208 Bmp4-202ENSMUST00000100676 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Pou4f1P17208 Zfp275-202ENSMUST00000114499 6284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Pou4f1P17208 5031425E22Rik-202ENSMUST00000185943 1477 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Pou4f1P17208 Dsg1a-201ENSMUST00000077146 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Pou4f1P17208 Vmn1r199-203ENSMUST00000227689 5537 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Pou4f1P17208 Anxa7-207ENSMUST00000224975 2727 ntAPPRIS P2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Pou4f1P17208 2810006K23Rik-201ENSMUST00000077376 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Pou4f1P17208 Rab11fip3-201ENSMUST00000118828 3271 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Pou4f1P17208 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Pou4f1P17208 Gnat3-201ENSMUST00000030561 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Pou4f1P17208 Cptp-201ENSMUST00000030950 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Pou4f1P17208 Tacc2-203ENSMUST00000084513 9029 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Pou4f1P17208 Adat1-201ENSMUST00000034427 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Pou4f1P17208 Sftpa1-202ENSMUST00000170719 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Pou4f1P17208 Efna5-201ENSMUST00000076840 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Pou4f1P17208 Itgb8-201ENSMUST00000026360 8403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Pou4f1P17208 Car13-201ENSMUST00000029071 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Pou4f1P17208 Nppa-201ENSMUST00000103230 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Pou4f1P17208 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Pou4f1P17208 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Pou4f1P17208 1700011M02Rik-201ENSMUST00000113602 420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Pou4f1P17208 Srpk1-202ENSMUST00000114767 445 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Pou4f1P17208 Tnfrsf9-205ENSMUST00000116257 2115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Pou4f1P17208 Gm4879-201ENSMUST00000122190 1272 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Pou4f1P17208 Utp23-202ENSMUST00000136129 779 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Pou4f1P17208 Sox5it-201ENSMUST00000144026 1207 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Pou4f1P17208 Gm16235-202ENSMUST00000149562 206 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Pou4f1P17208 Ins2-208ENSMUST00000162317 297 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Pou4f1P17208 Gm5274-201ENSMUST00000182641 1003 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Pou4f1P17208 Gm28166-201ENSMUST00000187637 620 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Pou4f1P17208 Prm2-202ENSMUST00000189593 674 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
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Pou4f1P17208 Gm18596-201ENSMUST00000218133 843 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Pou4f1P17208 AC166341.2-201ENSMUST00000220571 120 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Pou4f1P17208 2210010C04Rik-201ENSMUST00000031931 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Pou4f1P17208 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Pou4f1P17208 4930555K19Rik-201ENSMUST00000060066 171 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Pou4f1P17208 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Pou4f1P17208 Olfr222-202ENSMUST00000214351 2474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Pou4f1P17208 Pkd1l3-203ENSMUST00000212537 6576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Pou4f1P17208 Zfp54-201ENSMUST00000007884 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Pou4f1P17208 Tnr-201ENSMUST00000111669 4424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Pou4f1P17208 Cyp51-201ENSMUST00000001507 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Pou4f1P17208 Crispld1-201ENSMUST00000095075 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Pou4f1P17208 R3hcc1l-201ENSMUST00000026188 4112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Pou4f1P17208 Pax6-204ENSMUST00000111083 2370 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Pou4f1P17208 Rpgr-202ENSMUST00000072393 2380 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Pou4f1P17208 Gm11426-201ENSMUST00000125600 2220 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Pou4f1P17208 Pibf1-201ENSMUST00000022650 2797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Pou4f1P17208 Decr1-201ENSMUST00000029877 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Pou4f1P17208 Lipa-201ENSMUST00000049572 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Pou4f1P17208 Olfr1495-203ENSMUST00000216980 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Pou4f1P17208 Fbxo32-201ENSMUST00000022986 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Pou4f1P17208 Kif1b-203ENSMUST00000060537 10233 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Pou4f1P17208 Etv1-204ENSMUST00000160701 1578 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Pou4f1P17208 Tmprss3-202ENSMUST00000114549 2872 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Pou4f1P17208 Sncaip-201ENSMUST00000025413 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Pou4f1P17208 Myc-204ENSMUST00000160009 1765 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Pou4f1P17208 Dgcr2-204ENSMUST00000117945 4003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Pou4f1P17208 Sh3pxd2b-201ENSMUST00000038753 7413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Pou4f1P17208 Gm19165-201ENSMUST00000204453 1982 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms