Protein–RNA interactions for Protein: P09055

Itgb1, Integrin beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb1P09055 Htr1f-201ENSMUST00000063076 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Itgb1P09055 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Itgb1P09055 Pip5k1b-201ENSMUST00000025800 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Itgb1P09055 Col20a1-201ENSMUST00000108856 4489 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Itgb1P09055 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Itgb1P09055 Catsper1-201ENSMUST00000043380 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Itgb1P09055 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Itgb1P09055 Tyk2-201ENSMUST00000001036 4619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Itgb1P09055 Gpr37-202ENSMUST00000200812 3035 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Itgb1P09055 Lman1-201ENSMUST00000048260 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Itgb1P09055 Ccdc96-201ENSMUST00000060100 3585 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Itgb1P09055 C730027H18Rik-201ENSMUST00000218381 2300 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Itgb1P09055 Gatsl2-201ENSMUST00000016088 7367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Itgb1P09055 Nmt1-201ENSMUST00000021314 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Itgb1P09055 Timm10b-203ENSMUST00000106783 3273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Itgb1P09055 Ifna5-201ENSMUST00000102804 570 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Itgb1P09055 Gm8754-201ENSMUST00000118391 520 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Itgb1P09055 Rpl7a-ps12-201ENSMUST00000120384 794 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Itgb1P09055 Oosp2-201ENSMUST00000121793 677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Itgb1P09055 Eif4a-ps4-201ENSMUST00000122226 1218 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Itgb1P09055 Gm13781-201ENSMUST00000124153 492 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Itgb1P09055 Gm11715-201ENSMUST00000129501 695 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Itgb1P09055 Gm12907-201ENSMUST00000148027 507 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Itgb1P09055 Gm22669-201ENSMUST00000158723 318 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Itgb1P09055 Gm22616-201ENSMUST00000179783 100 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Itgb1P09055 Gm26611-201ENSMUST00000181449 785 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Itgb1P09055 Mir8104-201ENSMUST00000185165 101 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Itgb1P09055 Gm2021-201ENSMUST00000190623 464 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Itgb1P09055 Gm18299-201ENSMUST00000192026 636 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Itgb1P09055 Gm44139-201ENSMUST00000204903 373 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Itgb1P09055 Lysmd4-203ENSMUST00000207757 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Itgb1P09055 Gm44716-201ENSMUST00000209007 710 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Itgb1P09055 AC161581.1-201ENSMUST00000228696 318 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Itgb1P09055 Dcun1d2-203ENSMUST00000110839 2937 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Itgb1P09055 4833420G17Rik-201ENSMUST00000026519 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Itgb1P09055 Deup1-201ENSMUST00000045513 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Itgb1P09055 Gm45871-204ENSMUST00000211710 2003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Itgb1P09055 Uros-204ENSMUST00000106146 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Itgb1P09055 Baiap3-206ENSMUST00000182825 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Itgb1P09055 Rdh7-201ENSMUST00000047199 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Itgb1P09055 Amotl1-201ENSMUST00000013220 8957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Itgb1P09055 Tfip11-201ENSMUST00000031288 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Itgb1P09055 Zfp68-203ENSMUST00000110905 4749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Itgb1P09055 Cd74-203ENSMUST00000167610 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Itgb1P09055 Olfr95-201ENSMUST00000060728 5129 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Itgb1P09055 Anxa11os-201ENSMUST00000184083 2479 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Itgb1P09055 Slc25a14-208ENSMUST00000177710 1516 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Itgb1P09055 Sel1l-201ENSMUST00000021347 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Itgb1P09055 Gm31763-202ENSMUST00000218205 1724 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Itgb1P09055 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Itgb1P09055 Nos3-202ENSMUST00000115090 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Itgb1P09055 Ank1-204ENSMUST00000117270 5652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Itgb1P09055 Mapk1ip1-202ENSMUST00000118810 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Itgb1P09055 Prr13-205ENSMUST00000171245 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Itgb1P09055 Supt20-ps-201ENSMUST00000117999 1560 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
Itgb1P09055 Gm4925-202ENSMUST00000168843 1561 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
Itgb1P09055 Piezo2-202ENSMUST00000047480 10724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Itgb1P09055 C330027C09Rik-202ENSMUST00000117994 3977 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Itgb1P09055 C330027C09Rik-201ENSMUST00000048374 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Itgb1P09055 Add2-204ENSMUST00000203366 3407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Itgb1P09055 Rps6ka1-209ENSMUST00000174481 2228 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Itgb1P09055 Gm44907-201ENSMUST00000207423 1633 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
Itgb1P09055 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Itgb1P09055 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Itgb1P09055 Asb15-201ENSMUST00000031696 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Itgb1P09055 Ica1-204ENSMUST00000115520 1876 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Itgb1P09055 Ralgps1-202ENSMUST00000091039 2738 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Itgb1P09055 Snd1-206ENSMUST00000167201 3781 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Itgb1P09055 Gm25723-201ENSMUST00000104530 126 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Itgb1P09055 Gm8163-201ENSMUST00000122020 1060 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Itgb1P09055 Gm13372-201ENSMUST00000123129 688 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Itgb1P09055 Gm12637-201ENSMUST00000130501 368 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Itgb1P09055 Rnasek-203ENSMUST00000141880 465 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Itgb1P09055 Faap24-203ENSMUST00000154597 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Itgb1P09055 Scgb1b21-201ENSMUST00000170232 268 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Itgb1P09055 Rps28-205ENSMUST00000173844 382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Itgb1P09055 Mir3100-201ENSMUST00000174918 65 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Itgb1P09055 Gm5627-201ENSMUST00000178539 931 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Itgb1P09055 Tspy-ps-203ENSMUST00000186546 989 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Itgb1P09055 Gm5259-201ENSMUST00000191231 800 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Itgb1P09055 Olfr139-203ENSMUST00000206280 1059 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Itgb1P09055 Gm31378-201ENSMUST00000213538 267 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Itgb1P09055 AC132881.1-201ENSMUST00000223780 1062 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Itgb1P09055 CT571271.1-201ENSMUST00000227071 670 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Itgb1P09055 Ift43-201ENSMUST00000054565 773 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Itgb1P09055 Tuft1-204ENSMUST00000196733 2555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Itgb1P09055 Prpf6-203ENSMUST00000136481 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Itgb1P09055 Tpx2-206ENSMUST00000164120 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Itgb1P09055 Zfp948-201ENSMUST00000088787 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Itgb1P09055 Dnajb12-204ENSMUST00000146590 3070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Itgb1P09055 Oxct1-201ENSMUST00000110690 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Itgb1P09055 Zfp42-201ENSMUST00000082120 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Itgb1P09055 Fgl2-201ENSMUST00000035799 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Itgb1P09055 Otof-201ENSMUST00000074171 7129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Itgb1P09055 Dhdds-201ENSMUST00000012262 3133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Itgb1P09055 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Itgb1P09055 Bicd2-202ENSMUST00000110084 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Itgb1P09055 Acsm5-205ENSMUST00000207440 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Itgb1P09055 Wdr20rt-202ENSMUST00000221658 1570 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Itgb1P09055 CT009713.3-201ENSMUST00000224987 1565 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms