Protein–RNA interactions for Protein: B1APN4

Rhox1, Reproductive homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox1B1APN4 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rhox1B1APN4 BC052040-201ENSMUST00000110918 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rhox1B1APN4 Tyw1-201ENSMUST00000040213 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rhox1B1APN4 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rhox1B1APN4 Chrnb2-203ENSMUST00000200558 3482 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rhox1B1APN4 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rhox1B1APN4 Srrm4-201ENSMUST00000076124 7472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rhox1B1APN4 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rhox1B1APN4 Gp2-201ENSMUST00000033255 1993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rhox1B1APN4 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rhox1B1APN4 4933413J09Rik-202ENSMUST00000059648 3387 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rhox1B1APN4 Herc6-201ENSMUST00000031817 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rhox1B1APN4 9430015G10Rik-201ENSMUST00000072554 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rhox1B1APN4 Aar2-202ENSMUST00000109570 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rhox1B1APN4 Olfr272-202ENSMUST00000107667 1936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rhox1B1APN4 Clp1-201ENSMUST00000028475 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rhox1B1APN4 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rhox1B1APN4 Ctnnd1-204ENSMUST00000099941 5783 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rhox1B1APN4 4930432L08Rik-201ENSMUST00000132154 1608 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rhox1B1APN4 Inf2-201ENSMUST00000101029 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rhox1B1APN4 Edil3-202ENSMUST00000081769 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rhox1B1APN4 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rhox1B1APN4 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rhox1B1APN4 4933409D19Rik-201ENSMUST00000193674 1557 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rhox1B1APN4 Specc1l-204ENSMUST00000218766 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rhox1B1APN4 Zfp957-201ENSMUST00000040802 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rhox1B1APN4 Megf11-203ENSMUST00000118485 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rhox1B1APN4 Snrpb2-201ENSMUST00000008477 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rhox1B1APN4 Hottip-201ENSMUST00000141300 2346 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rhox1B1APN4 Sfxn5-204ENSMUST00000113788 514 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rhox1B1APN4 Gm15264-201ENSMUST00000118050 502 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Rhox1B1APN4 Klra14-ps-201ENSMUST00000119532 802 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Rhox1B1APN4 Olfr1127-ps1-201ENSMUST00000119555 892 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Rhox1B1APN4 Gm15287-201ENSMUST00000132564 751 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rhox1B1APN4 Gm11634-201ENSMUST00000154147 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rhox1B1APN4 Gm4778-202ENSMUST00000159517 1241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rhox1B1APN4 Gm4812-201ENSMUST00000182847 993 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Rhox1B1APN4 Gm28415-201ENSMUST00000187528 452 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rhox1B1APN4 1700034K08Rik-202ENSMUST00000188082 619 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rhox1B1APN4 Gm38038-201ENSMUST00000193803 259 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Rhox1B1APN4 Gm8625-201ENSMUST00000194185 1077 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Rhox1B1APN4 Gm37072-201ENSMUST00000194570 837 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Rhox1B1APN4 Gm37782-201ENSMUST00000194879 678 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Rhox1B1APN4 Gm42859-201ENSMUST00000199572 193 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Rhox1B1APN4 Nme6-214ENSMUST00000200468 865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rhox1B1APN4 Gm42530-201ENSMUST00000202683 550 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rhox1B1APN4 AC110816.1-201ENSMUST00000218559 980 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Rhox1B1APN4 AC155300.1-201ENSMUST00000219134 480 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Rhox1B1APN4 Mrpl33-201ENSMUST00000031024 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rhox1B1APN4 Olfr724-201ENSMUST00000075030 1006 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rhox1B1APN4 Olfr873-202ENSMUST00000075717 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rhox1B1APN4 Slxl1-201ENSMUST00000088740 730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rhox1B1APN4 4930566F21Rik-201ENSMUST00000201177 1535 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rhox1B1APN4 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rhox1B1APN4 Crot-201ENSMUST00000003720 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rhox1B1APN4 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rhox1B1APN4 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rhox1B1APN4 Mybpc3-203ENSMUST00000169776 4163 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rhox1B1APN4 Cacna1c-219ENSMUST00000189389 6603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rhox1B1APN4 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rhox1B1APN4 C1rb-201ENSMUST00000184647 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rhox1B1APN4 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rhox1B1APN4 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rhox1B1APN4 Slc23a2-201ENSMUST00000028815 6364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rhox1B1APN4 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rhox1B1APN4 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rhox1B1APN4 Myo1c-203ENSMUST00000102505 4652 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rhox1B1APN4 Cabin1-201ENSMUST00000001712 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rhox1B1APN4 Nf1-202ENSMUST00000108251 9217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rhox1B1APN4 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rhox1B1APN4 Tmigd1-201ENSMUST00000072633 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rhox1B1APN4 Chil1-207ENSMUST00000153856 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rhox1B1APN4 Atxn2l-206ENSMUST00000206577 3894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rhox1B1APN4 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rhox1B1APN4 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rhox1B1APN4 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rhox1B1APN4 Gm5697-201ENSMUST00000122295 2482 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rhox1B1APN4 Samd13-202ENSMUST00000125965 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rhox1B1APN4 Tube1-201ENSMUST00000019991 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rhox1B1APN4 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rhox1B1APN4 Zfp830-201ENSMUST00000056677 1591 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rhox1B1APN4 Chic1-201ENSMUST00000116547 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rhox1B1APN4 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rhox1B1APN4 Babam2-202ENSMUST00000071531 1308 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rhox1B1APN4 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rhox1B1APN4 Srsf6-203ENSMUST00000130411 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rhox1B1APN4 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rhox1B1APN4 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rhox1B1APN4 Dync1i2-201ENSMUST00000081710 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rhox1B1APN4 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rhox1B1APN4 Rgs12-203ENSMUST00000114280 2777 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rhox1B1APN4 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rhox1B1APN4 Klk6-201ENSMUST00000107966 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rhox1B1APN4 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rhox1B1APN4 Ncbp2-202ENSMUST00000115178 515 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rhox1B1APN4 Gm14550-201ENSMUST00000117918 407 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rhox1B1APN4 Gm14320-201ENSMUST00000137275 1023 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rhox1B1APN4 Gm18358-201ENSMUST00000173179 1277 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rhox1B1APN4 Vmn1r-ps151-201ENSMUST00000176956 982 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rhox1B1APN4 Gm25872-201ENSMUST00000177784 100 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms