Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Skp2-201ENSMUST00000096482 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Col5a3Q9JLI2 Gm34821-202ENSMUST00000209114 1949 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Col5a3Q9JLI2 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Col5a3Q9JLI2 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Col5a3Q9JLI2 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Col5a3Q9JLI2 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Col5a3Q9JLI2 Gm3126-201ENSMUST00000216513 1468 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Col5a3Q9JLI2 BC049352-203ENSMUST00000171799 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Col5a3Q9JLI2 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Col5a3Q9JLI2 Gm38148-201ENSMUST00000195166 3012 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Col5a3Q9JLI2 Gm25092-201ENSMUST00000103996 129 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Col5a3Q9JLI2 Gm11988-201ENSMUST00000122321 1069 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Col5a3Q9JLI2 Pip5k1bos-201ENSMUST00000126936 684 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Col5a3Q9JLI2 Gm12111-201ENSMUST00000150073 349 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Col5a3Q9JLI2 4930432M17Rik-202ENSMUST00000196899 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Col5a3Q9JLI2 Gm30052-201ENSMUST00000211951 913 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Col5a3Q9JLI2 Gm29794-201ENSMUST00000218919 1247 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Col5a3Q9JLI2 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Col5a3Q9JLI2 Nt5c1b-211ENSMUST00000218339 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Col5a3Q9JLI2 Nt5c1b-201ENSMUST00000002456 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Col5a3Q9JLI2 Tmem87a-201ENSMUST00000090042 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Col5a3Q9JLI2 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Col5a3Q9JLI2 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Col5a3Q9JLI2 Poldip3-202ENSMUST00000100375 3157 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Col5a3Q9JLI2 Gm32255-201ENSMUST00000219456 1349 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Col5a3Q9JLI2 Rpe65-202ENSMUST00000196999 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Col5a3Q9JLI2 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Col5a3Q9JLI2 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Col5a3Q9JLI2 AC125223.2-202ENSMUST00000225020 4103 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Col5a3Q9JLI2 Oc90-201ENSMUST00000060522 1909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Col5a3Q9JLI2 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Col5a3Q9JLI2 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Col5a3Q9JLI2 Wipf1-203ENSMUST00000102680 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Col5a3Q9JLI2 Gm16063-201ENSMUST00000156235 1701 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Col5a3Q9JLI2 Srsf5-203ENSMUST00000110352 1491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Col5a3Q9JLI2 Srsf5-204ENSMUST00000110354 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Col5a3Q9JLI2 Amt-201ENSMUST00000035230 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Col5a3Q9JLI2 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Col5a3Q9JLI2 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Col5a3Q9JLI2 Camk2g-202ENSMUST00000080440 3604 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Col5a3Q9JLI2 Apbb1-217ENSMUST00000191011 2712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Col5a3Q9JLI2 Opalin-201ENSMUST00000087176 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Col5a3Q9JLI2 Pip5k1a-205ENSMUST00000107233 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Col5a3Q9JLI2 Scnn1b-201ENSMUST00000033161 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Col5a3Q9JLI2 Gm45330-201ENSMUST00000209681 1575 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Col5a3Q9JLI2 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Col5a3Q9JLI2 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Col5a3Q9JLI2 Gm10398-201ENSMUST00000100826 397 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Col5a3Q9JLI2 Ripply1-201ENSMUST00000101217 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Col5a3Q9JLI2 Pla2g5-202ENSMUST00000102511 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Col5a3Q9JLI2 Mup9-201ENSMUST00000107506 721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Col5a3Q9JLI2 Wfdc6a-202ENSMUST00000109342 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Col5a3Q9JLI2 Gm9516-201ENSMUST00000119684 424 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Col5a3Q9JLI2 Mup9-207ENSMUST00000132829 598 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Col5a3Q9JLI2 Gm17228-201ENSMUST00000165006 491 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Col5a3Q9JLI2 5730435O14Rik-202ENSMUST00000170047 617 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Col5a3Q9JLI2 Gm17169-201ENSMUST00000171382 351 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Col5a3Q9JLI2 Ly6g6e-202ENSMUST00000172494 464 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Col5a3Q9JLI2 Zfp422-ps-201ENSMUST00000182230 706 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Col5a3Q9JLI2 Slc35a4-205ENSMUST00000185899 312 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Col5a3Q9JLI2 Shisa5-204ENSMUST00000196954 843 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Col5a3Q9JLI2 Gm44166-201ENSMUST00000204070 515 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Col5a3Q9JLI2 AC162893.1-201ENSMUST00000207732 1085 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Col5a3Q9JLI2 Gm36495-201ENSMUST00000221201 684 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Col5a3Q9JLI2 AC158531.1-201ENSMUST00000224617 457 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Col5a3Q9JLI2 AC165260.2-202ENSMUST00000224998 631 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Col5a3Q9JLI2 Mup11-201ENSMUST00000084544 601 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Col5a3Q9JLI2 Mup16-201ENSMUST00000095051 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Col5a3Q9JLI2 Tmprss5-202ENSMUST00000165088 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Col5a3Q9JLI2 Pde4d-209ENSMUST00000122041 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Col5a3Q9JLI2 Sept9-204ENSMUST00000106349 2932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Col5a3Q9JLI2 Gas2-209ENSMUST00000208711 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Col5a3Q9JLI2 Gm29367-201ENSMUST00000190911 1327 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Col5a3Q9JLI2 Gm10251-202ENSMUST00000181786 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Col5a3Q9JLI2 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Col5a3Q9JLI2 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Col5a3Q9JLI2 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Col5a3Q9JLI2 Slc10a7-202ENSMUST00000209490 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Col5a3Q9JLI2 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Col5a3Q9JLI2 Trim46-203ENSMUST00000107464 3252 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Col5a3Q9JLI2 Cyp2e1-201ENSMUST00000026552 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Col5a3Q9JLI2 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Col5a3Q9JLI2 Tmem134-216ENSMUST00000171743 3701 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Col5a3Q9JLI2 Gm38379-201ENSMUST00000194351 1525 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Col5a3Q9JLI2 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Col5a3Q9JLI2 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Col5a3Q9JLI2 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Col5a3Q9JLI2 Gps2-203ENSMUST00000116358 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Col5a3Q9JLI2 Olfr1343-ps1-201ENSMUST00000117414 914 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Col5a3Q9JLI2 Gm8310-201ENSMUST00000117526 1193 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Col5a3Q9JLI2 Dnmt3l-ps1-201ENSMUST00000118734 1253 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Col5a3Q9JLI2 Gm11225-201ENSMUST00000118903 1049 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Col5a3Q9JLI2 Gm13675-201ENSMUST00000120616 529 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Col5a3Q9JLI2 Gm15104-201ENSMUST00000132626 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Col5a3Q9JLI2 1700031F10Rik-202ENSMUST00000156018 609 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Col5a3Q9JLI2 1700112D23Rik-201ENSMUST00000167704 546 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Col5a3Q9JLI2 Gm7456-201ENSMUST00000182862 1011 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Col5a3Q9JLI2 Prr30-202ENSMUST00000187304 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Col5a3Q9JLI2 Gm45047-201ENSMUST00000207651 309 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Col5a3Q9JLI2 AC154848.1-201ENSMUST00000225451 846 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms