Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 Snu13-202ENSMUST00000080622 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 Gm9962-201ENSMUST00000085241 321 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 Gpa33-204ENSMUST00000166860 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 Tbc1d31-201ENSMUST00000022992 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 Platr9-202ENSMUST00000149572 1556 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 Gm45699-201ENSMUST00000212838 1576 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 Gm10643-201ENSMUST00000098592 1577 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 Zfp60-208ENSMUST00000167955 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 Cdh1-203ENSMUST00000167688 3203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 Gm26586-201ENSMUST00000181918 1745 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 Ap1m2-201ENSMUST00000003397 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 Casq2-205ENSMUST00000165540 2434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 Scamp1-203ENSMUST00000152555 1877 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 Chac2-202ENSMUST00000101394 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 Ctns-202ENSMUST00000108476 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 Gm45714-201ENSMUST00000211466 2722 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 AW146154-201ENSMUST00000098509 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 Gm37909-201ENSMUST00000193157 2159 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 Gm29101-201ENSMUST00000188329 1471 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 Pde6a-201ENSMUST00000025468 4421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 Gm10754-202ENSMUST00000220233 1633 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 Rnf6-206ENSMUST00000161859 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 Plekha7-206ENSMUST00000182487 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 Espl1-201ENSMUST00000064924 6630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 Brcc3-203ENSMUST00000118428 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 Slc39a14-210ENSMUST00000152067 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 Ahi1-202ENSMUST00000163505 2067 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 Gm12912-201ENSMUST00000121596 1381 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 4930589L23Rik-201ENSMUST00000091023 1364 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 Pus7l-201ENSMUST00000049151 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 Pygl-201ENSMUST00000071250 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 Phf20-201ENSMUST00000037401 5737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 Nos1ap-203ENSMUST00000160466 1533 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 Cdip1-202ENSMUST00000117713 1964 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 Ccdc167-203ENSMUST00000129091 2256 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 Lama5-201ENSMUST00000015791 11388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 B630019A10Rik-201ENSMUST00000149488 2407 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 Olfr376-202ENSMUST00000120401 3342 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 Fyco1-201ENSMUST00000084715 7949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 Gm16195-201ENSMUST00000130607 442 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 Utp23-202ENSMUST00000136129 779 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 Rab7b-205ENSMUST00000136247 497 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 Stk33-205ENSMUST00000141210 949 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 Gm25830-201ENSMUST00000158923 132 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 Has2os-202ENSMUST00000163314 633 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 Rsph14-206ENSMUST00000166088 1203 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 Gm16982-201ENSMUST00000181275 2620 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 Gm38313-201ENSMUST00000191953 1266 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 Gm42710-201ENSMUST00000200608 985 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 Gm43274-201ENSMUST00000202545 5000 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 Gm35822-201ENSMUST00000204954 562 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 Gm45509-201ENSMUST00000209624 1229 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 Gm7319-201ENSMUST00000210047 778 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 Gm45310-201ENSMUST00000210436 275 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 Gm39464-201ENSMUST00000214091 2169 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 548 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 Picalm-201ENSMUST00000049537 3528 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 Mblac2-201ENSMUST00000057598 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 Prr9-201ENSMUST00000070284 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 Rsph14-201ENSMUST00000009214 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 AC117648.1-201ENSMUST00000219777 2510 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 Hpgds-201ENSMUST00000031982 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 Lyn-201ENSMUST00000041377 3463 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 Snx29-201ENSMUST00000096273 1622 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 4930539E08Rik-201ENSMUST00000062357 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 E330023G01Rik-201ENSMUST00000186387 1483 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 Ndufaf1-203ENSMUST00000110802 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 Tcf4-203ENSMUST00000114977 3070 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 3930402G23Rik-201ENSMUST00000040608 3086 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 Ap3m1-206ENSMUST00000154460 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 Grin2a-201ENSMUST00000032331 4395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 Lrit3-201ENSMUST00000179187 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 Gm26724-201ENSMUST00000180434 1650 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 Git2-203ENSMUST00000112183 4886 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 Qrich2-204ENSMUST00000208602 7260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 Smarca5-ps-201ENSMUST00000121843 3123 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 Sh3rf2-201ENSMUST00000072008 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 Bbs5-202ENSMUST00000112286 1397 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 Bcl2l1-206ENSMUST00000140436 1865 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 Mthfd1-206ENSMUST00000220046 3040 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 Ctnnd1-211ENSMUST00000111685 5985 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 Ctnnd1-215ENSMUST00000111689 5961 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 Bag6-211ENSMUST00000173550 3536 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 Itgax-201ENSMUST00000033053 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 Kif2b-201ENSMUST00000061019 2244 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 Fgd1-202ENSMUST00000112685 3240 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 Gm8122-201ENSMUST00000165988 1404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 Exosc10-201ENSMUST00000017408 2790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 Tial1-202ENSMUST00000106226 4451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 Apoc3-202ENSMUST00000118649 453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 Tspan2-202ENSMUST00000119902 961 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 Gm14165-201ENSMUST00000121456 952 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 Treml4-203ENSMUST00000136272 811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 Treml4-206ENSMUST00000154335 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 Gzmn-201ENSMUST00000015587 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 Gng2-203ENSMUST00000159073 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
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