Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M2

Usp12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, mousemouse

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp12Q9D9M2 Pklr-201ENSMUST00000047111 2787 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Ifnl3-201ENSMUST00000078364 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Pop1-202ENSMUST00000079028 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Rtn3-204ENSMUST00000088171 4973 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Ppp6r2-201ENSMUST00000088788 2887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Gm10238-201ENSMUST00000089689 408 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Gm42047-202ENSMUST00000212899 4988 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Ppp2r2a-201ENSMUST00000089230 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Lrrc4-201ENSMUST00000062304 3615 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Svil-211ENSMUST00000143254 6594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Med24-202ENSMUST00000100500 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Bdh1-203ENSMUST00000115227 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Ing3-202ENSMUST00000115389 2546 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Ank3-242ENSMUST00000183261 4999 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Crocc2-201ENSMUST00000138595 7132 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Lox-202ENSMUST00000171470 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Hsdl1-204ENSMUST00000212517 2215 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Vmn1r184-207ENSMUST00000228369 6361 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Mfn2-204ENSMUST00000105716 4241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Dnajc10-201ENSMUST00000028392 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Sp100-201ENSMUST00000054279 1978 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Hsd3b1-202ENSMUST00000107016 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Plrg1-204ENSMUST00000150268 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Pmp22-201ENSMUST00000018361 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Gm37058-201ENSMUST00000193393 1644 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Ccdc148-204ENSMUST00000226455 4612 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Bfar-201ENSMUST00000023365 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Tcl1b4-202ENSMUST00000222867 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Ppp1r3c-201ENSMUST00000087321 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Gm8725-201ENSMUST00000221829 1333 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Hhip-201ENSMUST00000079038 9074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Ncam1-201ENSMUST00000114476 2567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Paip2-202ENSMUST00000115734 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Gm13281-201ENSMUST00000120871 567 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Ndufb5-202ENSMUST00000121778 574 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Fam229b-208ENSMUST00000139743 679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Gm26174-201ENSMUST00000158415 219 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Park2-203ENSMUST00000168593 735 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Gm16755-201ENSMUST00000180595 933 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Gm26716-201ENSMUST00000181227 415 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
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Usp12Q9D9M2 1700088E04Rik-207ENSMUST00000188562 631 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Gm29223-201ENSMUST00000188867 695 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Gm37921-201ENSMUST00000194333 695 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Gm42423-201ENSMUST00000196396 670 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
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Usp12Q9D9M2 Gm31314-201ENSMUST00000201435 609 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Gm45783-201ENSMUST00000210877 656 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Olfr1335-202ENSMUST00000219094 1148 ntAPPRIS P2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Gm1000-202ENSMUST00000222329 757 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 AC137950.2-201ENSMUST00000227127 1089 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Mcpt4-201ENSMUST00000043249 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Fam3b-201ENSMUST00000049721 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Gm22341-201ENSMUST00000083775 129 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Olfr1335-201ENSMUST00000084313 1148 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Il33-201ENSMUST00000025724 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 C230021G24Rik-201ENSMUST00000181196 3679 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Slc25a44-204ENSMUST00000195657 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Rasal1-205ENSMUST00000156722 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Dqx1-201ENSMUST00000077502 3257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Platr4-203ENSMUST00000199155 2161 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Clock-201ENSMUST00000075159 7478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Fyn-205ENSMUST00000135242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Adgre5-202ENSMUST00000075843 3000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Dgcr2-201ENSMUST00000012152 4045 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Avil-203ENSMUST00000129173 2925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Dclk1-213ENSMUST00000199702 2922 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Parp1-201ENSMUST00000027777 3873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Eef1b2-204ENSMUST00000129339 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Pld5-203ENSMUST00000111167 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Tstd2-201ENSMUST00000107770 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 AC153524.2-202ENSMUST00000220401 1794 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Ppid-201ENSMUST00000029382 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Togaram2-201ENSMUST00000097284 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Gab3-202ENSMUST00000114104 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 C920021L13Rik-201ENSMUST00000120398 1723 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Gm31138-201ENSMUST00000212296 1705 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Exoc3l4-210ENSMUST00000223050 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Hspa2-201ENSMUST00000080449 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Slc6a12-209ENSMUST00000171008 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Ccdc15-202ENSMUST00000213633 3331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Krt34-201ENSMUST00000056362 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Gm8684-201ENSMUST00000195078 1564 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Spats2l-206ENSMUST00000167085 3929 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Zkscan6-201ENSMUST00000018491 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Mthfsd-201ENSMUST00000047282 8312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 St6galnac4-201ENSMUST00000102818 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Phf20-ps-201ENSMUST00000185066 2886 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Plcxd2-201ENSMUST00000130481 7140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Klk1b5-201ENSMUST00000074359 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Traip-201ENSMUST00000049348 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Zfp943-201ENSMUST00000055349 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Rnf43-202ENSMUST00000092800 4037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Gm19951-201ENSMUST00000222616 1328 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Bicral-201ENSMUST00000040624 6579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Tsix-202ENSMUST00000211291 3263 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Ywhaq-ps3-201ENSMUST00000120944 738 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Vmn2r-ps9-201ENSMUST00000177446 1099 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Gm5274-201ENSMUST00000182641 1003 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Gm27833-201ENSMUST00000184285 124 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.5 ms