Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDV6

Ccdc63, Coiled-coil domain-containing protein 63, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc63Q8CDV6 Chad-201ENSMUST00000040418 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccdc63Q8CDV6 Gm15535-202ENSMUST00000148478 1519 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccdc63Q8CDV6 Gm7356-201ENSMUST00000186636 1527 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccdc63Q8CDV6 Gm7358-201ENSMUST00000189454 1527 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccdc63Q8CDV6 Gm17644-201ENSMUST00000181272 3200 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccdc63Q8CDV6 Plscr4-201ENSMUST00000034941 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccdc63Q8CDV6 Clic5-201ENSMUST00000024755 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccdc63Q8CDV6 Bsn-201ENSMUST00000035208 15938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccdc63Q8CDV6 Gm42962-201ENSMUST00000201966 2325 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccdc63Q8CDV6 Gm7932-202ENSMUST00000205047 2194 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccdc63Q8CDV6 Srcap-201ENSMUST00000066582 4545 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccdc63Q8CDV6 Gm7598-201ENSMUST00000130251 3123 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccdc63Q8CDV6 Fbxl12-206ENSMUST00000148631 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccdc63Q8CDV6 AC123731.1-201ENSMUST00000227417 1403 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccdc63Q8CDV6 Ralgps1-201ENSMUST00000042615 6029 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccdc63Q8CDV6 Rabep1-206ENSMUST00000177731 3167 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccdc63Q8CDV6 Sfi1-202ENSMUST00000081318 3969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccdc63Q8CDV6 Ncoa1-209ENSMUST00000220434 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccdc63Q8CDV6 Olfr1372-ps1-201ENSMUST00000121007 934 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccdc63Q8CDV6 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccdc63Q8CDV6 Gm20822-201ENSMUST00000165756 687 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccdc63Q8CDV6 Gm20828-201ENSMUST00000170889 687 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccdc63Q8CDV6 Rps28-203ENSMUST00000173019 437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccdc63Q8CDV6 Gm20455-201ENSMUST00000174100 1138 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccdc63Q8CDV6 Gm6773-201ENSMUST00000182377 878 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccdc63Q8CDV6 Rbp2-202ENSMUST00000187905 611 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccdc63Q8CDV6 Gm7539-201ENSMUST00000189789 630 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccdc63Q8CDV6 Myo1h-207ENSMUST00000196676 1256 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccdc63Q8CDV6 Pcdh7-207ENSMUST00000199310 659 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccdc63Q8CDV6 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccdc63Q8CDV6 AC113291.2-201ENSMUST00000215490 1205 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccdc63Q8CDV6 4930449E01Rik-201ENSMUST00000022711 595 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccdc63Q8CDV6 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccdc63Q8CDV6 Zfp287-203ENSMUST00000128370 2062 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccdc63Q8CDV6 3632454L22Rik-202ENSMUST00000153610 2872 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccdc63Q8CDV6 Tmco3-201ENSMUST00000045229 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccdc63Q8CDV6 Serpinb9c-201ENSMUST00000021837 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccdc63Q8CDV6 Bcat1-203ENSMUST00000111742 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccdc63Q8CDV6 Hmgcll1-205ENSMUST00000183425 3239 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccdc63Q8CDV6 Slc17a3-203ENSMUST00000110422 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccdc63Q8CDV6 Gba-201ENSMUST00000077367 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccdc63Q8CDV6 Klf17-201ENSMUST00000062747 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccdc63Q8CDV6 Slc7a14-202ENSMUST00000108245 3080 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccdc63Q8CDV6 Stx16-201ENSMUST00000044638 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccdc63Q8CDV6 Txndc16-205ENSMUST00000139526 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccdc63Q8CDV6 Gm42735-201ENSMUST00000201718 1646 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccdc63Q8CDV6 Nrf1-203ENSMUST00000069831 1625 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccdc63Q8CDV6 Tardbp-202ENSMUST00000084125 7477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccdc63Q8CDV6 Phf20-201ENSMUST00000037401 5737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccdc63Q8CDV6 Gm15612-201ENSMUST00000147542 3118 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccdc63Q8CDV6 Smarca1-202ENSMUST00000088973 4798 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccdc63Q8CDV6 Fam83c-201ENSMUST00000029143 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccdc63Q8CDV6 Mgat4a-202ENSMUST00000143636 1802 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccdc63Q8CDV6 Ndn-201ENSMUST00000038775 3694 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccdc63Q8CDV6 Hdhd2-201ENSMUST00000026485 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccdc63Q8CDV6 Cdh8-205ENSMUST00000142475 3216 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccdc63Q8CDV6 Flg2-201ENSMUST00000098884 7011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ccdc63Q8CDV6 Ctss-201ENSMUST00000015667 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ccdc63Q8CDV6 Erich3-202ENSMUST00000098496 8280 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ccdc63Q8CDV6 Ralgapb-202ENSMUST00000109485 6709 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ccdc63Q8CDV6 Gm13128-201ENSMUST00000105751 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ccdc63Q8CDV6 Acsm2-201ENSMUST00000084647 2051 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ccdc63Q8CDV6 Ddx25-201ENSMUST00000034612 6934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ccdc63Q8CDV6 Armcx3-203ENSMUST00000086884 3488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ccdc63Q8CDV6 Dmtn-203ENSMUST00000110984 4176 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ccdc63Q8CDV6 Mbnl1-203ENSMUST00000191747 4046 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ccdc63Q8CDV6 Gm43813-201ENSMUST00000196847 2294 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ccdc63Q8CDV6 Utrn-206ENSMUST00000219003 5751 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ccdc63Q8CDV6 Stoml3-201ENSMUST00000029307 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccdc63Q8CDV6 Vma21-201ENSMUST00000114575 4290 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccdc63Q8CDV6 Gm20658-202ENSMUST00000177059 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccdc63Q8CDV6 Rest-201ENSMUST00000080359 7004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccdc63Q8CDV6 Gm22937-201ENSMUST00000103954 131 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccdc63Q8CDV6 Gstm6-204ENSMUST00000106684 1179 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccdc63Q8CDV6 Pxmp4-202ENSMUST00000109703 560 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccdc63Q8CDV6 Gm11560-201ENSMUST00000117567 948 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccdc63Q8CDV6 Gm11235-201ENSMUST00000117763 333 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccdc63Q8CDV6 Gm1826-201ENSMUST00000118646 1162 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccdc63Q8CDV6 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccdc63Q8CDV6 Smim20-201ENSMUST00000147148 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccdc63Q8CDV6 Gm26978-201ENSMUST00000182843 304 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccdc63Q8CDV6 Gm9358-201ENSMUST00000183067 927 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccdc63Q8CDV6 Gm28836-201ENSMUST00000185842 633 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccdc63Q8CDV6 Gm19587-201ENSMUST00000191395 545 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccdc63Q8CDV6 Gm9116-201ENSMUST00000192400 1018 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccdc63Q8CDV6 P4htm-204ENSMUST00000193621 1297 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccdc63Q8CDV6 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccdc63Q8CDV6 AC100406.1-201ENSMUST00000217305 480 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccdc63Q8CDV6 AC160991.1-201ENSMUST00000224924 753 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccdc63Q8CDV6 Crx-201ENSMUST00000044434 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccdc63Q8CDV6 Ddhd2-201ENSMUST00000033975 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccdc63Q8CDV6 Nfya-202ENSMUST00000078800 3653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccdc63Q8CDV6 Ecsit-203ENSMUST00000179422 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccdc63Q8CDV6 Parp1-201ENSMUST00000027777 3873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccdc63Q8CDV6 Gm44070-201ENSMUST00000203389 2220 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccdc63Q8CDV6 Gabrr3-201ENSMUST00000114341 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccdc63Q8CDV6 Gfap-202ENSMUST00000077902 2600 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccdc63Q8CDV6 Snhg11-201ENSMUST00000109488 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccdc63Q8CDV6 Hoxa1-201ENSMUST00000000964 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccdc63Q8CDV6 Usp4-209ENSMUST00000194959 3436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms