Protein–RNA interactions for Protein: Q3V009

Tmed1, Transmembrane emp24 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed1Q3V009 Gm7589-201ENSMUST00000085631 534 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
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Tmed1Q3V009 Ctxn2-201ENSMUST00000099452 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmed1Q3V009 Gm28898-201ENSMUST00000189604 2167 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmed1Q3V009 Gm39464-201ENSMUST00000214091 2169 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmed1Q3V009 Sdhaf3-201ENSMUST00000040826 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmed1Q3V009 Zfp672-201ENSMUST00000057836 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmed1Q3V009 Dnajc14-202ENSMUST00000217745 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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Tmed1Q3V009 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmed1Q3V009 Aox2-201ENSMUST00000114366 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmed1Q3V009 Scnn1g-201ENSMUST00000000221 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmed1Q3V009 Ube2l3-201ENSMUST00000090192 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmed1Q3V009 Col4a5-201ENSMUST00000112930 6285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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Tmed1Q3V009 Ctnnd1-217ENSMUST00000111691 5380 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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Tmed1Q3V009 Arhgap19-201ENSMUST00000026150 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmed1Q3V009 Dapp1-201ENSMUST00000029806 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmed1Q3V009 Bcl2l1-206ENSMUST00000140436 1865 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmed1Q3V009 Plrg1-204ENSMUST00000150268 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmed1Q3V009 Aqr-202ENSMUST00000102543 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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Tmed1Q3V009 Zfp229-201ENSMUST00000065871 4525 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tmed1Q3V009 H2-T3-204ENSMUST00000102675 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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Tmed1Q3V009 Fut10-204ENSMUST00000161788 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tmed1Q3V009 Csf2rb2-201ENSMUST00000096356 4612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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Tmed1Q3V009 Zfp541-201ENSMUST00000108509 4561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tmed1Q3V009 Trerf1-205ENSMUST00000190080 7045 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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Tmed1Q3V009 Timm9-208ENSMUST00000221797 2564 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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Tmed1Q3V009 Pkp1-203ENSMUST00000163260 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tmed1Q3V009 Tcf20-202ENSMUST00000109510 7347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmed1Q3V009 Ptpn5-202ENSMUST00000102626 3137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmed1Q3V009 Tbx19-201ENSMUST00000027859 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmed1Q3V009 Drc3-204ENSMUST00000108723 1917 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmed1Q3V009 Agbl4-202ENSMUST00000097920 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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Tmed1Q3V009 Gm19951-201ENSMUST00000222616 1328 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmed1Q3V009 Mapk6-202ENSMUST00000168937 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
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Tmed1Q3V009 Klhl1-201ENSMUST00000022666 6645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmed1Q3V009 Tecpr2-202ENSMUST00000169597 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmed1Q3V009 AC153940.1-201ENSMUST00000220149 5300 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmed1Q3V009 Phf21a-205ENSMUST00000111291 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmed1Q3V009 9930022D16Rik-201ENSMUST00000055404 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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Tmed1Q3V009 Cyfip2-202ENSMUST00000093166 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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Tmed1Q3V009 Meikin-201ENSMUST00000094193 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmed1Q3V009 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmed1Q3V009 Pfn1-202ENSMUST00000108549 608 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
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Tmed1Q3V009 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96 ms