Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 Gm7545-201ENSMUST00000182773 1008 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Grin2bQ01097 AC125488.2-201ENSMUST00000218908 793 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Grin2bQ01097 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Grin2bQ01097 A630052C17Rik-201ENSMUST00000129876 2203 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Grin2bQ01097 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Grin2bQ01097 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Grin2bQ01097 Gm29773-201ENSMUST00000212751 1895 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Grin2bQ01097 Gm32200-201ENSMUST00000192778 2385 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Grin2bQ01097 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Grin2bQ01097 AC154528.2-201ENSMUST00000228432 3023 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Grin2bQ01097 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Grin2bQ01097 Ccdc87-201ENSMUST00000088653 3163 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Grin2bQ01097 5330411J11Rik-201ENSMUST00000137162 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Grin2bQ01097 Gps2-203ENSMUST00000116358 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Grin2bQ01097 Gm13592-201ENSMUST00000118148 1010 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Grin2bQ01097 Gm5389-201ENSMUST00000120893 1176 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Grin2bQ01097 Gm12499-201ENSMUST00000121961 546 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Grin2bQ01097 Gm14225-201ENSMUST00000142310 539 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Grin2bQ01097 Gm16184-201ENSMUST00000162324 573 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Grin2bQ01097 Gstm5-204ENSMUST00000169365 810 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Grin2bQ01097 Mir3060-201ENSMUST00000175339 83 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Grin2bQ01097 Gm29323-201ENSMUST00000189792 332 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Grin2bQ01097 Gm44331-201ENSMUST00000203217 388 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Grin2bQ01097 Gm826-201ENSMUST00000099127 637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Grin2bQ01097 Spata5-202ENSMUST00000108112 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Grin2bQ01097 Pomt1-201ENSMUST00000036473 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Grin2bQ01097 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Grin2bQ01097 Htr2b-201ENSMUST00000027431 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Grin2bQ01097 Slc16a7-202ENSMUST00000105257 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Grin2bQ01097 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Grin2bQ01097 Efcab12-203ENSMUST00000184428 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Grin2bQ01097 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Grin2bQ01097 Scmh1-202ENSMUST00000064991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Grin2bQ01097 Rnf13-201ENSMUST00000041826 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Grin2bQ01097 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Grin2bQ01097 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Grin2bQ01097 4930432K21Rik-201ENSMUST00000093375 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Grin2bQ01097 Fbxo8-201ENSMUST00000040218 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Grin2bQ01097 AC125487.1-201ENSMUST00000217888 1300 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Grin2bQ01097 Esr2-205ENSMUST00000218621 3342 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Grin2bQ01097 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Grin2bQ01097 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Grin2bQ01097 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Grin2bQ01097 Gabarap-202ENSMUST00000108592 750 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Grin2bQ01097 Gm11703-201ENSMUST00000118352 483 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Grin2bQ01097 Gm12411-201ENSMUST00000119140 483 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Grin2bQ01097 Gm15921-201ENSMUST00000119542 483 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Grin2bQ01097 Gm13784-201ENSMUST00000119639 519 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Grin2bQ01097 Gm13370-201ENSMUST00000121309 483 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Grin2bQ01097 Gm15682-201ENSMUST00000121563 483 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Grin2bQ01097 Gm12146-201ENSMUST00000127604 518 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Grin2bQ01097 Dtx3-205ENSMUST00000137151 346 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Grin2bQ01097 Gm10163-201ENSMUST00000155008 481 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Grin2bQ01097 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Grin2bQ01097 Ang-202ENSMUST00000171688 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Grin2bQ01097 BC049352-203ENSMUST00000171799 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Grin2bQ01097 Gm20529-201ENSMUST00000173683 203 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Grin2bQ01097 Gm16416-201ENSMUST00000179660 483 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Grin2bQ01097 Gm26964-201ENSMUST00000182516 832 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Grin2bQ01097 Rpl21-ps1-201ENSMUST00000193804 480 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Grin2bQ01097 Gm37113-201ENSMUST00000195675 1157 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Grin2bQ01097 Rcvrn-201ENSMUST00000021290 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Grin2bQ01097 Gm4478-201ENSMUST00000218322 483 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Grin2bQ01097 AC154693.1-201ENSMUST00000223821 523 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Grin2bQ01097 Polr1e-201ENSMUST00000029999 1724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Grin2bQ01097 Endov-201ENSMUST00000064513 954 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Grin2bQ01097 Rpl21-ps10-201ENSMUST00000071237 480 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Grin2bQ01097 Rpl21-ps11-201ENSMUST00000077278 480 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Grin2bQ01097 Mir25-201ENSMUST00000083460 84 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Grin2bQ01097 Gm10240-201ENSMUST00000089785 483 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Grin2bQ01097 Tigit-201ENSMUST00000096065 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Grin2bQ01097 Olfr1264-201ENSMUST00000099758 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Grin2bQ01097 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Grin2bQ01097 AA474408-201ENSMUST00000098110 3339 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Grin2bQ01097 Tmem87a-201ENSMUST00000090042 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Grin2bQ01097 Opalin-201ENSMUST00000087176 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Grin2bQ01097 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Grin2bQ01097 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Grin2bQ01097 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Grin2bQ01097 Milr1-202ENSMUST00000106794 1514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Grin2bQ01097 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Grin2bQ01097 Dpep2-202ENSMUST00000117555 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Grin2bQ01097 4930589L23Rik-201ENSMUST00000091023 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Grin2bQ01097 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Grin2bQ01097 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Grin2bQ01097 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Grin2bQ01097 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Grin2bQ01097 Nap1l2-201ENSMUST00000121720 2465 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Grin2bQ01097 Pdcd1lg2-201ENSMUST00000112576 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Grin2bQ01097 Zfp568-204ENSMUST00000177931 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Grin2bQ01097 Snap47-201ENSMUST00000010038 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Grin2bQ01097 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Grin2bQ01097 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Grin2bQ01097 Gm12072-201ENSMUST00000118293 715 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Grin2bQ01097 Snhg7os-201ENSMUST00000126798 546 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Grin2bQ01097 Tcl1b2-202ENSMUST00000142230 851 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Grin2bQ01097 Gm11832-201ENSMUST00000148576 432 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Grin2bQ01097 Ly6g6e-202ENSMUST00000172494 464 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Grin2bQ01097 Gm28281-201ENSMUST00000185658 187 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Grin2bQ01097 Gm43049-201ENSMUST00000198099 462 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.4 ms