Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Tpd52l1-204ENSMUST00000214644 1103 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SbdsP70122 Gm18968-201ENSMUST00000221319 862 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
SbdsP70122 Gm31513-201ENSMUST00000223261 684 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SbdsP70122 AC119177.2-201ENSMUST00000226699 629 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
SbdsP70122 AC149294.3-201ENSMUST00000226888 732 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
SbdsP70122 Hddc2-201ENSMUST00000000304 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SbdsP70122 C330021F23Rik-201ENSMUST00000086479 1111 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SbdsP70122 Mapk1ip1-201ENSMUST00000075667 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SbdsP70122 Gm43817-201ENSMUST00000196459 2262 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
SbdsP70122 Adra1a-205ENSMUST00000161339 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SbdsP70122 Mc4r-201ENSMUST00000057942 2758 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SbdsP70122 Piwil1-202ENSMUST00000195959 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SbdsP70122 D630003M21Rik-203ENSMUST00000169335 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SbdsP70122 Gm46218-202ENSMUST00000215520 1956 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
SbdsP70122 Tex21-202ENSMUST00000218426 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SbdsP70122 Gm11470-201ENSMUST00000118868 1475 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
SbdsP70122 Celf1-208ENSMUST00000111455 7579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SbdsP70122 Mcm10-202ENSMUST00000102985 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SbdsP70122 Thsd7b-201ENSMUST00000040311 3895 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SbdsP70122 Mepe-201ENSMUST00000066207 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SbdsP70122 Atg13-202ENSMUST00000076803 3551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SbdsP70122 St7-204ENSMUST00000077080 1887 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SbdsP70122 St5-204ENSMUST00000168005 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SbdsP70122 Apba2-206ENSMUST00000206246 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SbdsP70122 Mir9-3hg-202ENSMUST00000181511 3412 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SbdsP70122 Zfp133-ps-201ENSMUST00000119058 1802 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
SbdsP70122 Stk26-201ENSMUST00000033444 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SbdsP70122 B930082K07Rik-201ENSMUST00000181046 2478 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SbdsP70122 Slc44a4-202ENSMUST00000169230 2246 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SbdsP70122 Chac2-202ENSMUST00000101394 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SbdsP70122 Vmn1r181-205ENSMUST00000228399 4616 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SbdsP70122 Cacna1c-222ENSMUST00000190285 6585 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SbdsP70122 Gm20953-201ENSMUST00000216399 2614 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
SbdsP70122 Gm21874-202ENSMUST00000190315 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SbdsP70122 Ap2b1-201ENSMUST00000018875 5625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SbdsP70122 Vps8-204ENSMUST00000117598 4935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SbdsP70122 Srpk1-202ENSMUST00000114767 445 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SbdsP70122 Fthl17-ps2-201ENSMUST00000122268 528 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
SbdsP70122 9230111E07Rik-201ENSMUST00000124850 811 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SbdsP70122 Lrrc75aos2-202ENSMUST00000128647 1227 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SbdsP70122 Aamdc-206ENSMUST00000136757 789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SbdsP70122 Gm15935-201ENSMUST00000141004 607 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SbdsP70122 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SbdsP70122 4930405O22Rik-201ENSMUST00000164605 954 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SbdsP70122 Gm9135-201ENSMUST00000182963 990 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
SbdsP70122 Gm5311-201ENSMUST00000203518 709 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
SbdsP70122 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
SbdsP70122 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SbdsP70122 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SbdsP70122 Gm4903-201ENSMUST00000210462 405 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
SbdsP70122 Gm45728-201ENSMUST00000211475 2979 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
SbdsP70122 Gm11149-203ENSMUST00000215465 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SbdsP70122 Gm9487-201ENSMUST00000216600 472 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
SbdsP70122 AC100406.1-201ENSMUST00000217305 480 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
SbdsP70122 Prss3-201ENSMUST00000096003 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SbdsP70122 Gas7-202ENSMUST00000108680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SbdsP70122 AC131029.1-201ENSMUST00000226391 2929 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
SbdsP70122 Kdm2b-205ENSMUST00000121739 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SbdsP70122 Zfp61-201ENSMUST00000077780 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SbdsP70122 Tmem87a-201ENSMUST00000090042 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SbdsP70122 Gm26908-201ENSMUST00000181856 1637 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SbdsP70122 AC151836.1-201ENSMUST00000228730 1637 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
SbdsP70122 Gm10804-201ENSMUST00000099693 2244 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
SbdsP70122 Plscr4-201ENSMUST00000034941 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
SbdsP70122 Adgrl2-208ENSMUST00000197567 5585 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
SbdsP70122 Tet3-202ENSMUST00000089622 10904 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
SbdsP70122 Gm10425-201ENSMUST00000181085 3364 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
SbdsP70122 Tgm7-201ENSMUST00000110675 2151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
SbdsP70122 Vmn1r199-204ENSMUST00000227846 5523 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
SbdsP70122 Rtbdn-202ENSMUST00000109740 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
SbdsP70122 Limk1-202ENSMUST00000111233 3109 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SbdsP70122 Pklr-202ENSMUST00000107482 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SbdsP70122 Anxa7-207ENSMUST00000224975 2727 ntAPPRIS P2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SbdsP70122 Arhgap32-206ENSMUST00000182802 5621 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SbdsP70122 Eif2ak4-201ENSMUST00000005233 5212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SbdsP70122 Ilf3-213ENSMUST00000216892 3684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SbdsP70122 Kif1b-202ENSMUST00000055647 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SbdsP70122 Kirrel3-208ENSMUST00000188933 3643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SbdsP70122 Usp4-209ENSMUST00000194959 3436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SbdsP70122 Gm43334-201ENSMUST00000197740 1318 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SbdsP70122 Gm9979-201ENSMUST00000069457 3005 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SbdsP70122 St6galnac2-206ENSMUST00000144398 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SbdsP70122 Abcc3-206ENSMUST00000178136 5005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SbdsP70122 Gm37160-201ENSMUST00000193081 1689 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SbdsP70122 Mtfr1-204ENSMUST00000130645 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SbdsP70122 Fignl1-207ENSMUST00000171938 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SbdsP70122 Setd7-201ENSMUST00000037141 7411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SbdsP70122 Pex7-201ENSMUST00000020182 8099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SbdsP70122 Krba1-208ENSMUST00000203371 4000 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SbdsP70122 Gm6500-201ENSMUST00000119412 451 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SbdsP70122 Gm16217-201ENSMUST00000124182 616 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SbdsP70122 Dpf3-206ENSMUST00000177959 1298 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SbdsP70122 H2al1e-201ENSMUST00000178979 494 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SbdsP70122 Mir8111-201ENSMUST00000184463 137 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SbdsP70122 Gm28836-201ENSMUST00000185842 633 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SbdsP70122 H2al1b-201ENSMUST00000189531 495 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SbdsP70122 Gm28096-201ENSMUST00000191391 824 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SbdsP70122 E230014E18Rik-201ENSMUST00000215920 859 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SbdsP70122 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SbdsP70122 AC166341.2-201ENSMUST00000220571 120 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
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