Protein–RNA interactions for Protein: P09055

Itgb1, Integrin beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb1P09055 Gm10646-201ENSMUST00000213227 3293 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Itgb1P09055 Synj2-203ENSMUST00000115784 2634 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Itgb1P09055 Gm37744-201ENSMUST00000194616 1590 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Itgb1P09055 Morf4l2-201ENSMUST00000033797 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Itgb1P09055 Nxpe5-204ENSMUST00000161047 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Itgb1P09055 Gm35507-201ENSMUST00000197932 2761 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Itgb1P09055 AC242690.1-202ENSMUST00000214616 1742 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Itgb1P09055 Msln-201ENSMUST00000075884 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Itgb1P09055 Fbxo40-202ENSMUST00000114806 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Itgb1P09055 Sod3-201ENSMUST00000101208 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Itgb1P09055 Mkx-201ENSMUST00000079788 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Itgb1P09055 5730403I07Rik-201ENSMUST00000183878 2033 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Itgb1P09055 Pla2g4c-201ENSMUST00000043612 3382 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Itgb1P09055 Itgal-205ENSMUST00000170971 3662 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Itgb1P09055 Cers3-201ENSMUST00000066475 3250 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Itgb1P09055 Acvr1-203ENSMUST00000112599 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Itgb1P09055 Tmprss5-202ENSMUST00000165088 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Itgb1P09055 Mirg-201ENSMUST00000181496 1906 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Itgb1P09055 Pcgf5-202ENSMUST00000071267 1508 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Itgb1P09055 Bsnd-201ENSMUST00000054472 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Itgb1P09055 Arc-202ENSMUST00000110009 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Itgb1P09055 Arc-201ENSMUST00000023268 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Itgb1P09055 Masp2-202ENSMUST00000105701 738 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Itgb1P09055 Gm11365-201ENSMUST00000144277 774 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Itgb1P09055 H2afy3-201ENSMUST00000151919 1112 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Itgb1P09055 Rpl17-ps11-201ENSMUST00000161946 729 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Itgb1P09055 Gm28806-201ENSMUST00000191134 528 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Itgb1P09055 1810059H22Rik-207ENSMUST00000204809 289 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Itgb1P09055 AC134439.3-201ENSMUST00000223486 851 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Itgb1P09055 Gzmf-201ENSMUST00000022757 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Itgb1P09055 Taar1-201ENSMUST00000051532 1114 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Itgb1P09055 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Itgb1P09055 Rps18-201ENSMUST00000008812 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Itgb1P09055 Ccdc130-202ENSMUST00000098578 2119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Itgb1P09055 March1-207ENSMUST00000110258 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Itgb1P09055 C8b-202ENSMUST00000065072 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Itgb1P09055 Tbpl1-202ENSMUST00000127698 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Itgb1P09055 Thbs4-201ENSMUST00000022213 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Itgb1P09055 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Itgb1P09055 Gm42141-201ENSMUST00000196534 2172 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Itgb1P09055 Slc45a4-202ENSMUST00000076224 4240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Itgb1P09055 Gm45234-201ENSMUST00000129411 4359 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Itgb1P09055 Cpne9-201ENSMUST00000041203 2777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Itgb1P09055 Urod-201ENSMUST00000030446 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Itgb1P09055 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Itgb1P09055 P2rx7-201ENSMUST00000031425 1605 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Itgb1P09055 Slc7a9-203ENSMUST00000118969 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Itgb1P09055 Gm21103-202ENSMUST00000170923 1761 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Itgb1P09055 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Itgb1P09055 Synpr-201ENSMUST00000070323 2541 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Itgb1P09055 Il27ra-201ENSMUST00000005601 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Itgb1P09055 Pkn3-201ENSMUST00000045246 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Itgb1P09055 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Itgb1P09055 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Itgb1P09055 Gm17746-201ENSMUST00000223429 3772 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Itgb1P09055 Tesk2-201ENSMUST00000045542 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Itgb1P09055 Tctn3-201ENSMUST00000025981 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Itgb1P09055 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Itgb1P09055 Cct3-201ENSMUST00000001452 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Itgb1P09055 Zwilch-209ENSMUST00000176299 1831 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Itgb1P09055 Spata7-202ENSMUST00000101144 1541 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Itgb1P09055 AC129336.2-201ENSMUST00000218053 3086 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Itgb1P09055 Zfp956-201ENSMUST00000101445 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Itgb1P09055 Kcnh3-201ENSMUST00000041415 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Itgb1P09055 Ppp1r16b-203ENSMUST00000103116 6370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Itgb1P09055 Oas1d-201ENSMUST00000044224 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Itgb1P09055 Loxl3-202ENSMUST00000101257 3252 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Itgb1P09055 Ephb4-202ENSMUST00000111054 3784 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Itgb1P09055 Kcne4-201ENSMUST00000057262 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Itgb1P09055 Gm23062-201ENSMUST00000102349 110 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Itgb1P09055 Spaca3-201ENSMUST00000103222 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Itgb1P09055 Gm14227-201ENSMUST00000119431 629 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Itgb1P09055 Apela-201ENSMUST00000124790 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Itgb1P09055 Gm20821-202ENSMUST00000180352 684 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Itgb1P09055 Gm38004-201ENSMUST00000192972 357 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Itgb1P09055 Gm2328-201ENSMUST00000193525 535 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Itgb1P09055 Gm43122-202ENSMUST00000202259 526 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Itgb1P09055 Gm18646-201ENSMUST00000212240 1063 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Itgb1P09055 Gm3635-201ENSMUST00000212314 354 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Itgb1P09055 AC151971.6-201ENSMUST00000216193 866 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Itgb1P09055 4930547H16Rik-201ENSMUST00000222281 907 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Itgb1P09055 Gm5191-201ENSMUST00000222882 1236 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Itgb1P09055 Gm8256-202ENSMUST00000227964 828 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Itgb1P09055 AC163646.3-201ENSMUST00000228879 772 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Itgb1P09055 Olfr311-201ENSMUST00000071625 927 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Itgb1P09055 Zfp474-201ENSMUST00000072666 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Itgb1P09055 Xaf1-204ENSMUST00000146233 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Itgb1P09055 Adra2b-202ENSMUST00000104934 4014 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Itgb1P09055 Robo1-201ENSMUST00000023600 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Itgb1P09055 Slc17a3-203ENSMUST00000110422 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Itgb1P09055 Gm38115-201ENSMUST00000194317 2413 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Itgb1P09055 Mobp-202ENSMUST00000093773 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Itgb1P09055 Sgca-201ENSMUST00000100551 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Itgb1P09055 Gm15604-201ENSMUST00000118350 1456 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Itgb1P09055 Prkd2-201ENSMUST00000086104 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Itgb1P09055 Vmn1r38-202ENSMUST00000227493 3486 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Itgb1P09055 A930007I19Rik-201ENSMUST00000180737 2319 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Itgb1P09055 Shc1-210ENSMUST00000191485 3154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Itgb1P09055 Ttll7-203ENSMUST00000106134 2664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Itgb1P09055 Hdac9-208ENSMUST00000211107 1683 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.8 ms