Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M2

Usp12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp12Q9D9M2 Myo1c-203ENSMUST00000102505 4652 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Gm17141-201ENSMUST00000167578 3148 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Gpm6b-207ENSMUST00000112229 3203 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Gm5122-202ENSMUST00000216854 1637 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Fanca-202ENSMUST00000118395 3274 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Tbc1d31-201ENSMUST00000022992 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 6430573F11Rik-203ENSMUST00000147525 5820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Gm28268-201ENSMUST00000188966 2528 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Dctn1-202ENSMUST00000113907 4205 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Traf3-201ENSMUST00000021706 7060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Slc12a6-204ENSMUST00000110991 4556 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Tmprss3-202ENSMUST00000114549 2872 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Epb41l4a-201ENSMUST00000025234 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Lrpap1-201ENSMUST00000030986 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Phc1-203ENSMUST00000112600 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 A830010M20Rik-208ENSMUST00000211896 5256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Cckar-202ENSMUST00000200691 3230 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Pigb-202ENSMUST00000098566 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Cbfa2t3-203ENSMUST00000127984 7645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Epn2-203ENSMUST00000108712 4458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Cep112-201ENSMUST00000061287 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Scnn1a-201ENSMUST00000081440 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Sez6l-202ENSMUST00000079491 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
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Usp12Q9D9M2 Acadsb-202ENSMUST00000117518 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
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Usp12Q9D9M2 Dmrtc1b-201ENSMUST00000101324 1200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Psmb3-201ENSMUST00000103147 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Dmrtc1b-202ENSMUST00000113609 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Itpa-ps1-201ENSMUST00000117207 597 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Gm5764-201ENSMUST00000118817 885 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Gm10443-201ENSMUST00000119024 210 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Gm6238-201ENSMUST00000120999 465 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Gm13688-201ENSMUST00000121557 608 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Gm13954-201ENSMUST00000123441 543 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
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Usp12Q9D9M2 Stard6-206ENSMUST00000174118 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
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Usp12Q9D9M2 A930036I15Rik-201ENSMUST00000196018 1045 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
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Usp12Q9D9M2 AC140314.1-201ENSMUST00000219549 554 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
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Usp12Q9D9M2 Rpl9-201ENSMUST00000057885 738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
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Usp12Q9D9M2 Dmtf1-201ENSMUST00000071921 3806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
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Usp12Q9D9M2 Msl1-202ENSMUST00000037930 1303 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
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Usp12Q9D9M2 Bet1-201ENSMUST00000049166 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Apc-203ENSMUST00000115781 12346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
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Usp12Q9D9M2 Oprm1-230ENSMUST00000154906 2039 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Sema4g-203ENSMUST00000179305 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Zfp423-203ENSMUST00000165770 4334 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
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Usp12Q9D9M2 Celf2-224ENSMUST00000182879 2223 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
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Usp12Q9D9M2 Gpi1-201ENSMUST00000038027 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Dcaf12l1-201ENSMUST00000060481 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Zc3h18-202ENSMUST00000093073 3705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Bloc1s5-201ENSMUST00000035899 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Nlgn1-205ENSMUST00000193603 11807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Upp1-202ENSMUST00000101525 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Tnnt3-214ENSMUST00000105953 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Pax6-207ENSMUST00000111087 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Cacna2d1-204ENSMUST00000115281 3412 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Gm15636-201ENSMUST00000119205 668 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Myl1-203ENSMUST00000120415 621 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Prelid3b-203ENSMUST00000120822 622 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Gm5860-201ENSMUST00000137810 1028 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Gm25394-201ENSMUST00000157338 133 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Gm15651-201ENSMUST00000159953 2507 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Platr17-201ENSMUST00000172817 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Gm26875-201ENSMUST00000181006 950 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 1110020A21Rik-201ENSMUST00000181147 853 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Gm16982-201ENSMUST00000181275 2620 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Plekha7-206ENSMUST00000182487 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Rpl15-ps2-201ENSMUST00000184247 613 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 2810454H06Rik-201ENSMUST00000189942 3148 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Gm18555-201ENSMUST00000197935 584 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Gm17936-201ENSMUST00000199413 988 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Gm29773-201ENSMUST00000212751 1895 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 AC155300.1-201ENSMUST00000219134 480 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Gm7242-201ENSMUST00000221134 705 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 CT030159.3-201ENSMUST00000222936 1481 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 AC102523.1-201ENSMUST00000228706 1144 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 AC107711.4-201ENSMUST00000228948 440 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Psmb7-201ENSMUST00000028083 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Gzmk-201ENSMUST00000038212 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Acsl5-201ENSMUST00000043150 4243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Ggta1-201ENSMUST00000044255 1221 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
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