Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC1

UPF0489 protein C5orf22 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8BGC1 Gm26978-201ENSMUST00000182843 304 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q8BGC1 1700008A23Rik-201ENSMUST00000191694 691 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Q8BGC1 Gm3409-203ENSMUST00000199142 1167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q8BGC1 Gm3402-203ENSMUST00000200228 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q8BGC1 Gm44216-201ENSMUST00000203942 157 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Q8BGC1 E230014E18Rik-201ENSMUST00000215920 859 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q8BGC1 AC155300.1-201ENSMUST00000219134 480 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Q8BGC1 Gm40709-203ENSMUST00000219695 973 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q8BGC1 Stpg4-201ENSMUST00000040609 847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q8BGC1 4930555K19Rik-201ENSMUST00000060066 171 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Q8BGC1 n-R5s185-201ENSMUST00000083953 119 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Q8BGC1 Sh2d6-201ENSMUST00000089687 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q8BGC1 Pcdha6-201ENSMUST00000193389 4653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q8BGC1 Crispld2-203ENSMUST00000132583 4182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q8BGC1 Kcnmb1-201ENSMUST00000020362 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q8BGC1 Acer2-202ENSMUST00000084433 4060 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q8BGC1 Hemgn-201ENSMUST00000071096 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q8BGC1 Mak-203ENSMUST00000165087 3562 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q8BGC1 Pxdn-208ENSMUST00000220271 6377 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q8BGC1 Lrrc14b-201ENSMUST00000022064 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q8BGC1 Sh2d7-201ENSMUST00000060242 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q8BGC1 Bmp4-202ENSMUST00000100676 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q8BGC1 Txlng-204ENSMUST00000112316 3715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q8BGC1 Fubp1-220ENSMUST00000200524 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q8BGC1 Dmtn-203ENSMUST00000110984 4176 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q8BGC1 Gm42741-201ENSMUST00000201340 2278 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Q8BGC1 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q8BGC1 Sfi1-202ENSMUST00000081318 3969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q8BGC1 AC158779.1-201ENSMUST00000228912 3861 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Q8BGC1 Nrp2-202ENSMUST00000063594 6342 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q8BGC1 Hdac7-208ENSMUST00000121514 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q8BGC1 Ciapin1-209ENSMUST00000162538 4359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q8BGC1 Rad51d-201ENSMUST00000018985 3426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q8BGC1 Efna1-201ENSMUST00000029566 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q8BGC1 Entpd8-202ENSMUST00000114376 1942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q8BGC1 Epha6-203ENSMUST00000161358 1356 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q8BGC1 Esr2-202ENSMUST00000101291 3362 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q8BGC1 Rps9-203ENSMUST00000108624 478 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q8BGC1 Srpk1-202ENSMUST00000114767 445 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q8BGC1 Camk2a-204ENSMUST00000115295 979 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q8BGC1 Rps19-ps3-201ENSMUST00000116174 426 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Q8BGC1 Gm11235-201ENSMUST00000117763 333 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Q8BGC1 Lrrc75aos2-202ENSMUST00000128647 1227 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q8BGC1 Gm12426-201ENSMUST00000153083 371 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q8BGC1 Gm20536-201ENSMUST00000172588 406 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q8BGC1 Insig2-214ENSMUST00000186915 674 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q8BGC1 Gm33969-201ENSMUST00000197615 388 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q8BGC1 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Q8BGC1 Gm30873-201ENSMUST00000207512 1222 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q8BGC1 AC153363.1-201ENSMUST00000213572 359 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Q8BGC1 Gm31557-201ENSMUST00000213825 973 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q8BGC1 Gm31557-202ENSMUST00000213995 722 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q8BGC1 Gm8557-201ENSMUST00000220777 475 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Q8BGC1 Mgp-201ENSMUST00000032342 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q8BGC1 Snu13-202ENSMUST00000080622 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q8BGC1 Pdpk1-202ENSMUST00000102927 7161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q8BGC1 Tnip1-205ENSMUST00000108886 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q8BGC1 Dpy19l2-201ENSMUST00000133010 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q8BGC1 Olfr30-202ENSMUST00000215691 2404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q8BGC1 Ank1-206ENSMUST00000117662 6257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q8BGC1 Ascc2-201ENSMUST00000070257 2650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q8BGC1 Gm18638-201ENSMUST00000211293 1773 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Q8BGC1 Slc45a4-207ENSMUST00000151288 7509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q8BGC1 Tsc2-203ENSMUST00000226284 6266 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q8BGC1 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q8BGC1 Gm10790-202ENSMUST00000221285 1696 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q8BGC1 Tomm20-201ENSMUST00000179857 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q8BGC1 Ilf3-213ENSMUST00000216892 3684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q8BGC1 AC140393.1-201ENSMUST00000227959 1581 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Q8BGC1 Wdr93-201ENSMUST00000035622 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q8BGC1 Trim9-211ENSMUST00000223160 3574 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q8BGC1 Zcchc12-202ENSMUST00000115256 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q8BGC1 Pdk4-201ENSMUST00000019721 3484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q8BGC1 Pax5-202ENSMUST00000102932 1460 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q8BGC1 Adcy7-204ENSMUST00000171456 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q8BGC1 Ctnnd1-223ENSMUST00000111697 5294 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q8BGC1 Gpr75-201ENSMUST00000109430 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q8BGC1 Ggcx-201ENSMUST00000065906 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q8BGC1 Ilf3-203ENSMUST00000213518 3513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q8BGC1 Gm42970-201ENSMUST00000196407 1352 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Q8BGC1 Gm42714-201ENSMUST00000202063 1364 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Q8BGC1 Sec13-201ENSMUST00000032440 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q8BGC1 Stx8-201ENSMUST00000021285 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q8BGC1 Gm7823-201ENSMUST00000120761 1623 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Q8BGC1 Anxa6-202ENSMUST00000108883 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q8BGC1 Gm40655-201ENSMUST00000220802 1880 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q8BGC1 Gm15947-201ENSMUST00000161395 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q8BGC1 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q8BGC1 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q8BGC1 Gm14807-201ENSMUST00000116640 983 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Q8BGC1 Olfr1372-ps1-201ENSMUST00000121007 934 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Q8BGC1 Gm12826-201ENSMUST00000121841 379 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Q8BGC1 Polr1c-203ENSMUST00000124655 829 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q8BGC1 9230111E07Rik-201ENSMUST00000124850 811 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q8BGC1 Smim20-201ENSMUST00000147148 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q8BGC1 Gm24352-201ENSMUST00000158966 125 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Q8BGC1 Gm7535-201ENSMUST00000164167 909 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q8BGC1 Gm9372-201ENSMUST00000168454 430 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Q8BGC1 Zbtb37-205ENSMUST00000171748 2141 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q8BGC1 Gm43564-201ENSMUST00000196185 211 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.3 ms