Protein–RNA interactions for Protein: P53564

Cux1, Homeobox protein cut-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux1P53564 4933428M09Rik-201ENSMUST00000113046 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cux1P53564 Elobl-203ENSMUST00000121228 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cux1P53564 Atad3aos-204ENSMUST00000174185 482 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cux1P53564 Pon1-203ENSMUST00000176945 619 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cux1P53564 Platr11-201ENSMUST00000182885 388 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cux1P53564 1700084F23Rik-201ENSMUST00000186662 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cux1P53564 AC160991.1-201ENSMUST00000224924 753 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Cux1P53564 AC158519.1-201ENSMUST00000228615 179 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Cux1P53564 Cib3-201ENSMUST00000098630 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cux1P53564 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cux1P53564 Gdpd1-201ENSMUST00000020804 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cux1P53564 Gm35021-201ENSMUST00000210105 2329 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cux1P53564 Gm43785-201ENSMUST00000201036 1345 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Cux1P53564 Ces2a-204ENSMUST00000164182 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cux1P53564 Kcnk2-209ENSMUST00000194402 1373 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cux1P53564 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cux1P53564 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cux1P53564 Zfp454-201ENSMUST00000050595 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cux1P53564 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cux1P53564 Apbb1-217ENSMUST00000191011 2712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cux1P53564 Snap25-201ENSMUST00000028727 2116 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cux1P53564 Mettl18-201ENSMUST00000045694 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cux1P53564 Gm36638-202ENSMUST00000192073 2169 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cux1P53564 Noxred1-203ENSMUST00000222480 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cux1P53564 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cux1P53564 Gm19001-201ENSMUST00000222736 1651 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cux1P53564 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cux1P53564 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cux1P53564 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cux1P53564 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cux1P53564 Rnf13-201ENSMUST00000041826 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cux1P53564 Ampd3-206ENSMUST00000170374 3489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cux1P53564 Phactr1-202ENSMUST00000110161 1950 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cux1P53564 Kng1-202ENSMUST00000039492 1985 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cux1P53564 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cux1P53564 Colq-201ENSMUST00000112027 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cux1P53564 Pcdhb10-201ENSMUST00000051126 2851 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cux1P53564 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cux1P53564 Mageb2-201ENSMUST00000101397 1143 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cux1P53564 Scgb1b30-201ENSMUST00000108083 491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cux1P53564 Myl12a-202ENSMUST00000123686 804 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cux1P53564 Pou1f1-203ENSMUST00000176038 1174 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cux1P53564 5730420D15Rik-201ENSMUST00000181781 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cux1P53564 Gm9621-201ENSMUST00000183322 1003 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cux1P53564 Gm15645-202ENSMUST00000183393 1299 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cux1P53564 Gm8982-201ENSMUST00000184198 1295 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cux1P53564 Gm32496-201ENSMUST00000191988 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cux1P53564 4930573I07Rik-202ENSMUST00000199120 413 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cux1P53564 Gm38839-201ENSMUST00000203833 633 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cux1P53564 AC154706.1-201ENSMUST00000225482 585 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cux1P53564 Sh2d1a-201ENSMUST00000005839 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cux1P53564 Retnlg-201ENSMUST00000065666 608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cux1P53564 Mageb1-201ENSMUST00000072269 1143 ntAPPRIS P2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cux1P53564 Speer4c-201ENSMUST00000095005 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cux1P53564 Speer4d-201ENSMUST00000095006 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cux1P53564 Mageb1-202ENSMUST00000099471 993 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cux1P53564 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cux1P53564 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cux1P53564 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cux1P53564 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cux1P53564 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cux1P53564 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cux1P53564 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cux1P53564 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cux1P53564 Zfp568-204ENSMUST00000177931 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cux1P53564 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cux1P53564 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cux1P53564 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cux1P53564 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cux1P53564 Gm15369-201ENSMUST00000119681 394 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cux1P53564 Gm6298-201ENSMUST00000122262 981 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cux1P53564 Ppp1r2-ps1-201ENSMUST00000178232 621 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cux1P53564 Ppp1r2-ps6-201ENSMUST00000179333 621 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cux1P53564 Gm28857-201ENSMUST00000188068 425 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cux1P53564 Gm19412-202ENSMUST00000189156 569 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cux1P53564 Gm8992-201ENSMUST00000204463 502 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cux1P53564 Rnf212b-201ENSMUST00000218311 1201 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cux1P53564 Olfr418-201ENSMUST00000059754 991 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cux1P53564 Gm26397-201ENSMUST00000083703 134 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cux1P53564 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cux1P53564 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cux1P53564 Trmt12-201ENSMUST00000036937 4454 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cux1P53564 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cux1P53564 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cux1P53564 Ilf3-203ENSMUST00000213518 3513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cux1P53564 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cux1P53564 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cux1P53564 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cux1P53564 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cux1P53564 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cux1P53564 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cux1P53564 Pde4d-202ENSMUST00000079975 2280 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cux1P53564 Nsdhl-201ENSMUST00000033715 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cux1P53564 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cux1P53564 Supt20-201ENSMUST00000029315 2112 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cux1P53564 Nr1h4-202ENSMUST00000105296 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cux1P53564 Tollip-203ENSMUST00000130439 1892 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cux1P53564 Opalin-201ENSMUST00000087176 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cux1P53564 Trim13-202ENSMUST00000165015 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cux1P53564 1810053B23Rik-205ENSMUST00000188056 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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