Protein–RNA interactions for Protein: P49025

Cit, Citron Rho-interacting kinase, mousemouse

Predictions only

Length 2,055 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CitP49025 Nod1-202ENSMUST00000168172 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CitP49025 Apba2-206ENSMUST00000206246 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
CitP49025 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
CitP49025 Elf5-206ENSMUST00000164172 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CitP49025 Fgf14-201ENSMUST00000026631 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CitP49025 Rhox4a-201ENSMUST00000115194 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CitP49025 Gm12420-201ENSMUST00000119869 1048 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
CitP49025 Gm16268-201ENSMUST00000159445 1157 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CitP49025 Tnnc1-202ENSMUST00000169169 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CitP49025 Gm19668-201ENSMUST00000178581 747 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
CitP49025 Gm26532-201ENSMUST00000180630 690 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
CitP49025 Gm17944-201ENSMUST00000186351 643 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
CitP49025 Gm37229-201ENSMUST00000191643 732 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
CitP49025 Gm43866-201ENSMUST00000203894 839 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
CitP49025 E330011O21Rik-205ENSMUST00000211317 1062 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
CitP49025 Gm18646-201ENSMUST00000212240 1063 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
CitP49025 Pcbd1-202ENSMUST00000218005 361 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
CitP49025 Gm40689-201ENSMUST00000218006 362 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
CitP49025 Gm2696-201ENSMUST00000220062 723 ntAPPRIS P5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
CitP49025 Rab36-207ENSMUST00000147802 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
CitP49025 March10-204ENSMUST00000138977 2979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
CitP49025 Rpap2-201ENSMUST00000065422 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CitP49025 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
CitP49025 Gm16702-201ENSMUST00000181180 2384 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CitP49025 Etnppl-203ENSMUST00000166187 1712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CitP49025 Nln-205ENSMUST00000224945 2486 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
CitP49025 Cenpo-202ENSMUST00000111169 1550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CitP49025 Gm37975-201ENSMUST00000195494 2099 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
CitP49025 Supt7l-205ENSMUST00000202421 3056 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CitP49025 Clip3-201ENSMUST00000014065 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CitP49025 Gramd1b-212ENSMUST00000165104 3824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
CitP49025 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CitP49025 Trim36-202ENSMUST00000167364 4543 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
CitP49025 Gpi1-201ENSMUST00000038027 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CitP49025 Vwa7-202ENSMUST00000172499 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CitP49025 Kansl1-201ENSMUST00000018556 5061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CitP49025 Trak1-201ENSMUST00000045903 4827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CitP49025 Gm12666-201ENSMUST00000123179 764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
CitP49025 1700085C21Rik-201ENSMUST00000187123 1082 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CitP49025 Vmn1r206-201ENSMUST00000187140 1135 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
CitP49025 Gm37921-201ENSMUST00000194333 695 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
CitP49025 Gm32772-203ENSMUST00000207022 675 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
CitP49025 AC118639.1-202ENSMUST00000226957 653 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
CitP49025 Ica1-204ENSMUST00000115520 1876 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
CitP49025 Tor1aip2-204ENSMUST00000111754 2491 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CitP49025 P2rx7-201ENSMUST00000031425 1605 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CitP49025 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
CitP49025 Ak8-201ENSMUST00000074156 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
CitP49025 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
CitP49025 Cd74-203ENSMUST00000167610 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
CitP49025 Psd-202ENSMUST00000096029 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
CitP49025 Fam47e-202ENSMUST00000131166 1500 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
CitP49025 Rpain-202ENSMUST00000108529 282 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
CitP49025 Polr2j-203ENSMUST00000111129 474 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
CitP49025 Gm15815-201ENSMUST00000120569 255 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
CitP49025 Gm6939-201ENSMUST00000122029 864 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
CitP49025 Gm13781-201ENSMUST00000124153 492 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
CitP49025 Tead1-211ENSMUST00000170352 1218 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
CitP49025 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
CitP49025 Spin3-ps-201ENSMUST00000192825 770 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
CitP49025 Gm45783-201ENSMUST00000210877 656 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
CitP49025 AC124503.1-201ENSMUST00000218524 526 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
CitP49025 AC122824.1-201ENSMUST00000221705 828 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
CitP49025 AC161877.1-201ENSMUST00000227736 699 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
CitP49025 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
CitP49025 2010111I01Rik-201ENSMUST00000021911 2979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
CitP49025 Gm30504-201ENSMUST00000209316 1688 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
CitP49025 Gm14858-201ENSMUST00000138614 1758 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
CitP49025 Rpe65-202ENSMUST00000196999 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
CitP49025 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
CitP49025 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
CitP49025 Ces1a-201ENSMUST00000095211 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
CitP49025 A830010M20Rik-208ENSMUST00000211896 5256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
CitP49025 Ankrd31-203ENSMUST00000208758 5859 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
CitP49025 Gm45161-201ENSMUST00000207316 2263 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
CitP49025 Lasp1-201ENSMUST00000043843 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
CitP49025 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
CitP49025 Gm13758-201ENSMUST00000118699 743 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
CitP49025 Gm13505-201ENSMUST00000121666 817 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
CitP49025 Gm15650-201ENSMUST00000135451 770 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
CitP49025 1700065O20Rik-201ENSMUST00000186872 710 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
CitP49025 Gm28499-201ENSMUST00000191576 666 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
CitP49025 Gm30055-201ENSMUST00000203175 803 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
CitP49025 Gm5130-201ENSMUST00000210233 959 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
CitP49025 AC156274.1-201ENSMUST00000219193 634 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
CitP49025 Ccl25-201ENSMUST00000024004 1058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
CitP49025 Cxcl3-201ENSMUST00000031326 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
CitP49025 Speer4f1-201ENSMUST00000076099 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
CitP49025 Gm26205-201ENSMUST00000082907 134 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
CitP49025 Igsf11-202ENSMUST00000114706 1578 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
CitP49025 Gm45699-201ENSMUST00000212838 1576 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
CitP49025 Cnga4-201ENSMUST00000033187 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
CitP49025 Cadm2-201ENSMUST00000114292 9564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
CitP49025 Il1rap-202ENSMUST00000096129 4438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
CitP49025 Sun1-201ENSMUST00000058716 4134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
CitP49025 Zc3h18-202ENSMUST00000093073 3705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
CitP49025 Parvg-207ENSMUST00000163667 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
CitP49025 Hsdl1-204ENSMUST00000212517 2215 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
CitP49025 Sfmbt2-202ENSMUST00000114861 1813 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
CitP49025 Blnk-202ENSMUST00000117695 1701 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms