Protein–RNA interactions for Protein: P40240

Cd9, CD9 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd9P40240 Tas2r141-ps4-201ENSMUST00000205072 946 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Cd9P40240 Gm45469-201ENSMUST00000210468 854 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cd9P40240 AC153363.1-201ENSMUST00000213572 359 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Cd9P40240 Gm18670-201ENSMUST00000218712 696 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Cd9P40240 Gm3926-201ENSMUST00000223378 1123 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Cd9P40240 Nat8f5-201ENSMUST00000032074 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cd9P40240 Rpl3l-201ENSMUST00000045186 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cd9P40240 3425401B19Rik-201ENSMUST00000096038 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cd9P40240 Ankrd46-201ENSMUST00000057486 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cd9P40240 Traip-201ENSMUST00000049348 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cd9P40240 Pde2a-202ENSMUST00000166652 3977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cd9P40240 B930082K07Rik-201ENSMUST00000181046 2478 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cd9P40240 Htr1b-202ENSMUST00000183482 4724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cd9P40240 Spef2-203ENSMUST00000159368 1422 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cd9P40240 Gm45769-201ENSMUST00000204588 1828 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Cd9P40240 Bicd1-203ENSMUST00000111513 4049 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cd9P40240 Cd8a-202ENSMUST00000172321 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cd9P40240 Catsperd-201ENSMUST00000112979 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cd9P40240 Qars-203ENSMUST00000134939 2374 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cd9P40240 Gm39312-201ENSMUST00000213586 2195 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cd9P40240 Pnma2-201ENSMUST00000089236 5518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cd9P40240 Klf3-202ENSMUST00000166409 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cd9P40240 Wdr20rt-202ENSMUST00000221658 1570 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cd9P40240 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cd9P40240 Tbc1d31-201ENSMUST00000022992 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cd9P40240 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cd9P40240 Tmem63a-205ENSMUST00000161523 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cd9P40240 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cd9P40240 Exoc3l4-210ENSMUST00000223050 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cd9P40240 Nectin4-203ENSMUST00000111286 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cd9P40240 4930447F24Rik-201ENSMUST00000194140 1341 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cd9P40240 Tgfb1i1-201ENSMUST00000070656 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cd9P40240 Ephb4-202ENSMUST00000111054 3784 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cd9P40240 Gemin8-201ENSMUST00000056410 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cd9P40240 C86187-202ENSMUST00000209497 2415 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cd9P40240 Gm4880-201ENSMUST00000207645 1696 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Cd9P40240 Ms4a6b-201ENSMUST00000025580 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cd9P40240 Wars-205ENSMUST00000161410 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cd9P40240 Nxpe1-ps-201ENSMUST00000209981 1454 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Cd9P40240 Sap30bpos-201ENSMUST00000132264 2352 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cd9P40240 Ndufb2-205ENSMUST00000135671 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cd9P40240 Ccl27a-204ENSMUST00000108035 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cd9P40240 Txnrd2-205ENSMUST00000126778 491 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cd9P40240 Gm12326-201ENSMUST00000132986 618 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cd9P40240 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cd9P40240 Gm23218-201ENSMUST00000158124 276 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Cd9P40240 Mocs2-205ENSMUST00000165022 962 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cd9P40240 Gm26989-201ENSMUST00000182608 749 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Cd9P40240 Gm27241-201ENSMUST00000183517 622 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cd9P40240 1700009J07Rik-202ENSMUST00000185309 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cd9P40240 Gm28179-201ENSMUST00000188365 613 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Cd9P40240 Gm28079-206ENSMUST00000188554 1170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cd9P40240 1700088E04Rik-207ENSMUST00000188562 631 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cd9P40240 Gm45349-201ENSMUST00000210285 1074 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cd9P40240 1700012D14Rik-204ENSMUST00000210788 547 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cd9P40240 E330011O21Rik-205ENSMUST00000211317 1062 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cd9P40240 CT025689.1-201ENSMUST00000225214 283 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Cd9P40240 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Cd9P40240 Tsga10ip-201ENSMUST00000044527 487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cd9P40240 Olfr1015-201ENSMUST00000047870 1016 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cd9P40240 Gm6960-201ENSMUST00000051629 639 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Cd9P40240 Vmn1r199-201ENSMUST00000091732 1104 ntAPPRIS P2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cd9P40240 Olfr1313-201ENSMUST00000099599 938 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cd9P40240 Gpatch2-204ENSMUST00000110943 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cd9P40240 Actr2-201ENSMUST00000000137 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cd9P40240 Arhgef4-204ENSMUST00000159747 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cd9P40240 Gm38054-201ENSMUST00000192380 2167 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cd9P40240 Gm46218-202ENSMUST00000215520 1956 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Cd9P40240 Afap1-201ENSMUST00000064571 6618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cd9P40240 Dip2c-202ENSMUST00000169960 4801 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cd9P40240 Abca2-201ENSMUST00000102919 8033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cd9P40240 Zfp112-201ENSMUST00000005413 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cd9P40240 Fam161b-202ENSMUST00000065536 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cd9P40240 Zfp775-201ENSMUST00000061720 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cd9P40240 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cd9P40240 AU041133-202ENSMUST00000201286 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cd9P40240 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cd9P40240 Arxes1-201ENSMUST00000057625 1580 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cd9P40240 AI854703-202ENSMUST00000154570 3806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cd9P40240 Klf17-201ENSMUST00000062747 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cd9P40240 Pcdha6-201ENSMUST00000193389 4653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cd9P40240 Gm37671-201ENSMUST00000193198 2096 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Cd9P40240 Tchhl1-201ENSMUST00000029516 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cd9P40240 Poteg-201ENSMUST00000081321 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cd9P40240 Tenm2-201ENSMUST00000057207 8298 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cd9P40240 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cd9P40240 Adam6a-201ENSMUST00000053086 2558 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cd9P40240 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cd9P40240 Tram2-201ENSMUST00000037998 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cd9P40240 Prdx6-202ENSMUST00000071718 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cd9P40240 Trim34b-202ENSMUST00000180136 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cd9P40240 Ddo-201ENSMUST00000019977 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cd9P40240 Champ1-201ENSMUST00000051870 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cd9P40240 Nsdhl-201ENSMUST00000033715 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cd9P40240 Henmt1-203ENSMUST00000106586 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cd9P40240 Ifitm7-202ENSMUST00000178021 1823 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cd9P40240 Ces1c-201ENSMUST00000034189 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cd9P40240 Klk13-201ENSMUST00000066834 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cd9P40240 Fan1-201ENSMUST00000163289 3460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cd9P40240 Usp11-201ENSMUST00000033383 3467 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms